RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510204.5

SH3BP2-217, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 3,617 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-217ENST00000510204 CEP295Q9C0D2 2601 aa9.11□□□□□ -0.95
SH3BP2-217ENST00000510204 IGLV2-11P01706 119 aa9.11□□□□□ -0.95
SH3BP2-217ENST00000510204 LINC01620Q4KN68 170 aa9.11□□□□□ -0.95
SH3BP2-217ENST00000510204 LYZL1Q6UWQ5 148 aa9.11□□□□□ -0.95
SH3BP2-217ENST00000510204 C9orf106Q8NAJ2 232 aa9.11□□□□□ -0.95
SH3BP2-217ENST00000510204 ZNF318Q5VUA4 2279 aa9.1□□□□□ -0.95
SH3BP2-217ENST00000510204 SPRY3O43610 288 aa9.1□□□□□ -0.95
SH3BP2-217ENST00000510204 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa9.1□□□□□ -0.95
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SH3BP2-217ENST00000510204 CFC1P0CG37 223 aa9.1□□□□□ -0.95
SH3BP2-217ENST00000510204 C10orf55Q5SWW7 151 aa9.1□□□□□ -0.95
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SH3BP2-217ENST00000510204 M0R1B8 84 aa9.09□□□□□ -0.95
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SH3BP2-217ENST00000510204 C20orf173Q96LM9 149 aa9.09□□□□□ -0.95
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SH3BP2-217ENST00000510204 IGKV3-15P01624 115 aa9.09□□□□□ -0.96
SH3BP2-217ENST00000510204 AKAP6Q13023 2319 aa9.08□□□□□ -0.96
SH3BP2-217ENST00000510204 SMKR1H3BMG3 65 aa9.08□□□□□ -0.96
SH3BP2-217ENST00000510204 ELANEP08246 267 aa9.08□□□□□ -0.96
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SH3BP2-217ENST00000510204 DSCAML1Q8TD84 2053 aa9.08□□□□□ -0.96
SH3BP2-217ENST00000510204 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa9.08□□□□□ -0.96
SH3BP2-217ENST00000510204 IGHV4-39P01824 125 aa9.08□□□□□ -0.96
SH3BP2-217ENST00000510204 WT1P19544 449 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
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SH3BP2-217ENST00000510204 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa9.08□□□□□ -0.96
SH3BP2-217ENST00000510204 BRK1Q8WUW1 75 aa9.08□□□□□ -0.96
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SH3BP2-217ENST00000510204 HCP5Q6MZN7 132 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP2-217ENST00000510204 LINC01600Q96MT4 127 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP2-217ENST00000510204 UPK3BQ9BT76 320 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP2-217ENST00000510204 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
SH3BP2-217ENST00000510204 ATMQ13315 3056 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP2-217ENST00000510204 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP2-217ENST00000510204 PLGLAQ15195 96 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP2-217ENST00000510204 SCGB1D4Q6XE38 83 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP2-217ENST00000510204 Q71RC1 249 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
SH3BP2-217ENST00000510204 NAV3Q8IVL0 2385 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP2-217ENST00000510204 C2orf82Q6UX34 121 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP2-217ENST00000510204 SMCR5Q8TEV8 140 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP2-217ENST00000510204 PRO1854Q9UHT4 67 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP2-217ENST00000510204 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
SH3BP2-217ENST00000510204 C16orf92Q96LL3 132 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP2-217ENST00000510204 ZNRD1Q9P1U0 126 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP2-217ENST00000510204 CGB1A6NKQ9 187 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP2-217ENST00000510204 ATOX1O00244 68 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP2-217ENST00000510204 TMEM170BQ5T4T1 132 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP2-217ENST00000510204 LYPD1Q8N2G4 141 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP2-217ENST00000510204 C16orf95Q9H693 158 aa9.06□□□□□ -0.96
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SH3BP2-217ENST00000510204 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
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SH3BP2-217ENST00000510204 COL6A6A6NMZ7 2263 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP2-217ENST00000510204 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa9.05□□□□□ -0.96
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SH3BP2-217ENST00000510204 LINC00574Q9H8X3 128 aa9.05□□□□□ -0.96
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SH3BP2-217ENST00000510204 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP2-217ENST00000510204 RNF7Q9UBF6 113 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP2-217ENST00000510204 Q9UFV3 132 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP2-217ENST00000510204 AKAP13Q12802 2813 aa9.04□□□□□ -0.96
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SH3BP2-217ENST00000510204 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
SH3BP2-217ENST00000510204 MSMPQ1L6U9 139 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP2-217ENST00000510204 DEFB121Q5J5C9 76 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP2-217ENST00000510204 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
SH3BP2-217ENST00000510204 MUC6Q6W4X9 2439 aa9.02□□□□□ -0.96
SH3BP2-217ENST00000510204 WNK2Q9Y3S1 2297 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP2-217ENST00000510204 PLNP26678 52 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP2-217ENST00000510204 LINC01546A6NGU7 62 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP2-217ENST00000510204 P0DMU3 169 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP2-217ENST00000510204 FAM231AP0DMU4 169 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP2-217ENST00000510204 FAM231CP0DMU5 169 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP2-217ENST00000510204 GAFA1Q96PS6 74 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP2-217ENST00000510204 DSCAMO60469 2012 aa9.02□□□□□ -0.97
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