RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497508.1

TMEM18-208, Transcript of transmembrane protein 18, human

TSL 2

Gene TMEM18, Length 1,706 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM18-208	ENST00000497508	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
TMEM18-208	ENST00000497508	SST	P61278	116 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TMEM18-208	ENST00000497508	CACNG7	P62955	275 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TMEM18-208	ENST00000497508	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TMEM18-208	ENST00000497508	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
TMEM18-208	ENST00000497508	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TMEM18-208	ENST00000497508	GSN-AS1	Q9NRJ2	163 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TMEM18-208	ENST00000497508	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TMEM18-208	ENST00000497508	HSBP1	O75506	76 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TMEM18-208	ENST00000497508	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
TMEM18-208	ENST00000497508	AMN1	Q8IY45	258 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TMEM18-208	ENST00000497508	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TMEM18-208	ENST00000497508	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
TMEM18-208	ENST00000497508	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
TMEM18-208	ENST00000497508	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TMEM18-208	ENST00000497508	NAGK	Q9UJ70	344 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TMEM18-208	ENST00000497508		J3QL48	77 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TMEM18-208	ENST00000497508		K7EIL1	84 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TMEM18-208	ENST00000497508	SCGB1D1	O95968	90 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TMEM18-208	ENST00000497508	TG	P01266	2768 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TMEM18-208	ENST00000497508	MED14OS	P0DP75	135 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TMEM18-208	ENST00000497508	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TMEM18-208	ENST00000497508	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TMEM18-208	ENST00000497508	ORMDL3	Q8N138	153 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TMEM18-208	ENST00000497508	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TMEM18-208	ENST00000497508		D6R8Y8	96 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TMEM18-208	ENST00000497508	ASIP	P42127	132 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TMEM18-208	ENST00000497508	KIR3DS1	Q14943	382 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TMEM18-208	ENST00000497508	FAM19A2	Q8N3H0	131 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TMEM18-208	ENST00000497508	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TMEM18-208	ENST00000497508	PRELID3A	Q96N28	172 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TMEM18-208	ENST00000497508		H3BVH4	76 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TMEM18-208	ENST00000497508		M0R2Z0	102 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TMEM18-208	ENST00000497508	LINC00614	P0C842	121 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TMEM18-208	ENST00000497508	TSPO	P30536	169 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TMEM18-208	ENST00000497508	TMEM61	Q8N0U2	210 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TMEM18-208	ENST00000497508	MRAP	Q8TCY5	172 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TMEM18-208	ENST00000497508	RNF185	Q96GF1	192 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TMEM18-208	ENST00000497508	C7orf71	A4D174	169 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TMEM18-208	ENST00000497508	PPBP	P02775	128 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TMEM18-208	ENST00000497508	RAB4A	P20338	218 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TMEM18-208	ENST00000497508	SMIM15	Q7Z3B0	74 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TMEM18-208	ENST00000497508	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TMEM18-208	ENST00000497508	TRAV25	A0A0B4J276	109 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TMEM18-208	ENST00000497508	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TMEM18-208	ENST00000497508	CKS2	P33552	79 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TMEM18-208	ENST00000497508	DEFB121	Q5J5C9	76 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TMEM18-208	ENST00000497508	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TMEM18-208	ENST00000497508	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TMEM18-208	ENST00000497508		A8MTW9	85 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TMEM18-208	ENST00000497508	KRTDAP	P60985	99 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TMEM18-208	ENST00000497508	FA2H	Q7L5A8	372 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TMEM18-208	ENST00000497508	LAMTOR2	Q9Y2Q5	125 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TMEM18-208	ENST00000497508	TRAV12-3	A0A0B4J271	114 aa		10.75	□□□□□ -0.69
TMEM18-208	ENST00000497508	IGHV1-24	A0A0C4DH33	117 aa		10.75	□□□□□ -0.69
TMEM18-208	ENST00000497508	CDKN1B	P46527	198 aa		10.75	□□□□□ -0.69
TMEM18-208	ENST00000497508	DEFB131A	P59861	70 aa		10.75	□□□□□ -0.69
TMEM18-208	ENST00000497508	C4orf48	Q5BLP8	95 aa		10.75	□□□□□ -0.69
TMEM18-208	ENST00000497508	FAM159A	Q6UWV7	190 aa		10.75	□□□□□ -0.69
TMEM18-208	ENST00000497508	AMTN	Q6UX39	209 aa		10.75	□□□□□ -0.69
TMEM18-208	ENST00000497508	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		10.75	□□□□□ -0.69
TMEM18-208	ENST00000497508	SPAG8	Q99932	426 aa	Predicted RBP	10.75	□□□□□ -0.69
TMEM18-208	ENST00000497508	TIMM8B	Q9Y5J9	83 aa	Predicted RBP	10.75	□□□□□ -0.69
TMEM18-208	ENST00000497508	OR4C46	A6NHA9	309 aa		10.75	□□□□□ -0.69
TMEM18-208	ENST00000497508	SMKR1	H3BMG3	65 aa		10.75	□□□□□ -0.69
TMEM18-208	ENST00000497508	GNRH2	O43555	120 aa		10.75	□□□□□ -0.69
TMEM18-208	ENST00000497508	IGKV3-20	P01619	116 aa		10.75	□□□□□ -0.69
TMEM18-208	ENST00000497508	C3orf79	P0CE67	100 aa		10.75	□□□□□ -0.69
TMEM18-208	ENST00000497508	HLA-DRB4	P13762	266 aa		10.75	□□□□□ -0.69
TMEM18-208	ENST00000497508	PKIA	P61925	76 aa		10.75	□□□□□ -0.69
TMEM18-208	ENST00000497508	TDRG1	Q3Y452	100 aa		10.75	□□□□□ -0.69
TMEM18-208	ENST00000497508	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		10.75	□□□□□ -0.69
TMEM18-208	ENST00000497508	PHLDA3	Q9Y5J5	127 aa		10.75	□□□□□ -0.69
TMEM18-208	ENST00000497508	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		10.75	□□□□□ -0.69
TMEM18-208	ENST00000497508	KNCN	A6PVL3	124 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TMEM18-208	ENST00000497508	NPY	P01303	97 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TMEM18-208	ENST00000497508	CD7	P09564	240 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TMEM18-208	ENST00000497508	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
TMEM18-208	ENST00000497508	EVI2A	P22794	236 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TMEM18-208	ENST00000497508		Q8N976	141 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TMEM18-208	ENST00000497508	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TMEM18-208	ENST00000497508	NXPH4	O95158	308 aa		10.73	□□□□□ -0.69
TMEM18-208	ENST00000497508	NCR2	O95944	276 aa		10.73	□□□□□ -0.69
TMEM18-208	ENST00000497508	TEX43	Q6ZNM6	134 aa		10.73	□□□□□ -0.69
TMEM18-208	ENST00000497508		Q8N1Y9	231 aa		10.73	□□□□□ -0.69
TMEM18-208	ENST00000497508	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		10.73	□□□□□ -0.69
TMEM18-208	ENST00000497508	TSTD3	H0UI37	97 aa		10.72	□□□□□ -0.69
TMEM18-208	ENST00000497508		H3BMM0	161 aa		10.72	□□□□□ -0.69
TMEM18-208	ENST00000497508	IFI27	P40305	119 aa	Predicted RBP	10.72	□□□□□ -0.69
TMEM18-208	ENST00000497508	PMCHL1	Q16048	86 aa		10.72	□□□□□ -0.69
TMEM18-208	ENST00000497508	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		10.72	□□□□□ -0.69
TMEM18-208	ENST00000497508	WFDC10A	Q9H1F0	79 aa		10.72	□□□□□ -0.69
TMEM18-208	ENST00000497508	COL7A1	Q02388	2944 aa		10.72	□□□□□ -0.69
TMEM18-208	ENST00000497508	AGRN	O00468	2067 aa		10.72	□□□□□ -0.69
TMEM18-208	ENST00000497508	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		10.72	□□□□□ -0.69
TMEM18-208	ENST00000497508	LOC389332	A0A1B0GUA5	103 aa		10.72	□□□□□ -0.69
TMEM18-208	ENST00000497508		M0R381	172 aa		10.72	□□□□□ -0.69
TMEM18-208	ENST00000497508	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		10.72	□□□□□ -0.69
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		10.72	□□□□□ -0.69

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