RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497210.5

CTPS1-211, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 463 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-211ENST00000497210 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa7.06□□□□□ -1.28
CTPS1-211ENST00000497210 A0A087WWC5 75 aa7.06□□□□□ -1.28
CTPS1-211ENST00000497210 A8MWL6 223 aa7.06□□□□□ -1.28
CTPS1-211ENST00000497210 K7EIL1 84 aa7.06□□□□□ -1.28
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
CTPS1-211ENST00000497210 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
CTPS1-211ENST00000497210 S100PP25815 95 aa7.06□□□□□ -1.28
CTPS1-211ENST00000497210 S100A4P26447 101 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
CTPS1-211ENST00000497210 RPL19P84098 196 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
CTPS1-211ENST00000497210 RNF212Q495C1 297 aa7.06□□□□□ -1.28
CTPS1-211ENST00000497210 MUC21Q5SSG8 566 aa7.06□□□□□ -1.28
CTPS1-211ENST00000497210 KCNIP4Q6PIL6 250 aa7.06□□□□□ -1.28
CTPS1-211ENST00000497210 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
CTPS1-211ENST00000497210 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
CTPS1-211ENST00000497210 BORCS7Q96B45 105 aa7.06□□□□□ -1.28
CTPS1-211ENST00000497210 C16orf74Q96GX8 76 aa7.06□□□□□ -1.28
CTPS1-211ENST00000497210 A0A1W2PPQ1 181 aa7.05□□□□□ -1.28
CTPS1-211ENST00000497210 FAM231BA6NCW3 169 aa7.05□□□□□ -1.28
CTPS1-211ENST00000497210 SMIM9A6NGZ8 99 aa7.05□□□□□ -1.28
CTPS1-211ENST00000497210 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
CTPS1-211ENST00000497210 CRIP1P50238 77 aa7.05□□□□□ -1.28
CTPS1-211ENST00000497210 FOXI1Q12951 378 aa7.05□□□□□ -1.28
CTPS1-211ENST00000497210 RRN3P1Q2M238 152 aa7.05□□□□□ -1.28
CTPS1-211ENST00000497210 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa7.05□□□□□ -1.28
CTPS1-211ENST00000497210 DEFB121Q5J5C9 76 aa7.05□□□□□ -1.28
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF493Q6ZR52 646 aa7.05□□□□□ -1.28
CTPS1-211ENST00000497210 TSKUQ8WUA8 353 aa7.05□□□□□ -1.28
CTPS1-211ENST00000497210 GFRA4Q9GZZ7 299 aa7.05□□□□□ -1.28
CTPS1-211ENST00000497210 RPS10P5Q9NQ39 176 aa7.05□□□□□ -1.28
CTPS1-211ENST00000497210 TMEM242Q9NWH2 141 aa7.05□□□□□ -1.28
CTPS1-211ENST00000497210 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa7.04□□□□□ -1.28
CTPS1-211ENST00000497210 C7orf77A4D0Y5 90 aa7.04□□□□□ -1.28
CTPS1-211ENST00000497210 SNURFLB1AK76 121 aa7.04□□□□□ -1.28
CTPS1-211ENST00000497210 SPRY2O43597 315 aa7.04□□□□□ -1.28
CTPS1-211ENST00000497210 TYMSP04818 313 aa7.04□□□□□ -1.28
CTPS1-211ENST00000497210 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
CTPS1-211ENST00000497210 RBMY1CP0DJD4 496 aa7.04□□□□□ -1.28
CTPS1-211ENST00000497210 MIFP14174 115 aa7.04□□□□□ -1.28
CTPS1-211ENST00000497210 HTN1P15515 57 aa7.04□□□□□ -1.28
CTPS1-211ENST00000497210 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
CTPS1-211ENST00000497210 Q8N1X5 172 aa7.04□□□□□ -1.28
CTPS1-211ENST00000497210 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa7.04□□□□□ -1.28
CTPS1-211ENST00000497210 RNF183Q96D59 192 aa7.04□□□□□ -1.28
CTPS1-211ENST00000497210 BTF3L4Q96K17 158 aa7.04□□□□□ -1.28
CTPS1-211ENST00000497210 IMMP2LQ96T52 175 aa7.04□□□□□ -1.28
CTPS1-211ENST00000497210 NAT8BQ9UHF3 227 aa7.04□□□□□ -1.28
CTPS1-211ENST00000497210 V9GYV3 84 aa7.04□□□□□ -1.28
CTPS1-211ENST00000497210 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-211ENST00000497210 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-211ENST00000497210 CXorf65A6NEN9 183 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-211ENST00000497210 F2Z2F3 143 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-211ENST00000497210 H3BVH4 76 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-211ENST00000497210 C1orf158Q8N1D5 194 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-211ENST00000497210 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-211ENST00000497210 OR11H2Q8NH07 326 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-211ENST00000497210 TPPP3Q9BW30 176 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-211ENST00000497210 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-211ENST00000497210 IL36BQ9NZH7 164 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-211ENST00000497210 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-211ENST00000497210 HIGD1CA8MV81 97 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-211ENST00000497210 OR5AL1P0C617 328 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-211ENST00000497210 CTRLP40313 264 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-211ENST00000497210 TCL1AP56279 114 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-211ENST00000497210 DNLZQ5SXM8 178 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-211ENST00000497210 ZFP82Q8N141 532 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-211ENST00000497210 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-211ENST00000497210 B9D2Q9BPU9 175 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-211ENST00000497210 NDUFAF3Q9BU61 184 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-211ENST00000497210 C11orf21Q9P2W6 132 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-211ENST00000497210 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-211ENST00000497210 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-211ENST00000497210 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-211ENST00000497210 S100A8P05109 93 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-211ENST00000497210 CACNG7P62955 275 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-211ENST00000497210 DEFA6Q01524 100 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-211ENST00000497210 SPANXN1Q5VSR9 72 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-211ENST00000497210 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-211ENST00000497210 TM2D3Q9BRN9 247 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-211ENST00000497210 SPXQ9BT56 116 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-211ENST00000497210 SMCO4Q9NRQ5 59 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-211ENST00000497210 A0A1B0GW15 77 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-211ENST00000497210 GRIFINA4D1Z8 144 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-211ENST00000497210 SNAI2O43623 268 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-211ENST00000497210 IGLC6P0CF74 106 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-211ENST00000497210 Q6ZQT7 251 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-211ENST00000497210 SMIM15Q7Z3B0 74 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-211ENST00000497210 AP1S3Q96PC3 154 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-211ENST00000497210 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CTPS1-211ENST00000497210 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-211ENST00000497210 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CTPS1-211ENST00000497210 A0A1B0GUT8 65 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-211ENST00000497210 M0R2P5 195 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-211ENST00000497210 ARMS2P0C7Q2 107 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-211ENST00000497210 TRGC1P0CF51 173 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-211ENST00000497210 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-211ENST00000497210 GZMBP10144 247 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-211ENST00000497210 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-211ENST00000497210 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-211ENST00000497210 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
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