RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495615.5

CBWD5-231, Transcript of COBW domain containing 5, human

TSL 3

Gene CBWD5, Length 993 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CBWD5-231	ENST00000495615	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		0.09	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		0.08	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	GOLGA4	Q13439	2230 aa	Known RBP	0.08	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615		A0A0G2JMM0	328 aa		0.08	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		0.08	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	IGF2	P01344	180 aa		0.08	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	IGKC	P01834	107 aa		0.08	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	CKS2	P33552	79 aa		0.08	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	RHOH	Q15669	191 aa		0.08	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		0.08	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		0.08	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	THEM6	Q8WUY1	208 aa		0.08	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	DMAC1	Q96GE9	116 aa		0.08	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	MED31	Q9Y3C7	131 aa		0.08	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	STARD9	Q9P2P6	4700 aa		0.08	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	TENM4	Q6N022	2769 aa		0.08	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	0.08	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	0.08	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	KNL1	Q8NG31	2342 aa		0.08	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	USP54	Q70EL1	1684 aa		0.08	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	FLNC	Q14315	2725 aa		0.07	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	DNAJC13	O75165	2243 aa		0.07	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	PI4KA	P42356	2102 aa		0.07	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	0.07	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	DSP	P15924	2871 aa	Known RBP	0.07	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	TRBV7-6	A0A0J9YX20	115 aa		0.07	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		0.07	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615		A0A1W2PRE2	83 aa		0.07	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615		M0QZK8	103 aa		0.07	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	HBD	P02042	147 aa		0.07	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	ASB16-AS1	Q495Z4	193 aa		0.07	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		0.07	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	BRK1	Q8WUW1	75 aa		0.07	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	ATG5	Q9H1Y0	275 aa		0.07	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		0.07	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615		V9GYQ6	96 aa		0.07	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	TRANK1	O15050	2925 aa		0.07	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	COL7A1	Q02388	2944 aa		0.07	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		0.07	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	TEX15	Q9BXT5	2789 aa		0.07	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	ITPR1	Q14643	2758 aa		0.06	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	TENM2	Q9NT68	2774 aa		0.06	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	PDZD2	O15018	2839 aa		0.06	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	PKDREJ	Q9NTG1	2253 aa		0.06	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	ITPR2	Q14571	2701 aa		0.06	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	A2M	P01023	1474 aa		0.06	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	IGHV1-24	A0A0C4DH33	117 aa		0.06	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615		A0A1B0GV72	72 aa		0.06	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	CCK	P06307	115 aa		0.06	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	SDC4	P31431	198 aa		0.06	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	POLR2H	P52434	150 aa	Known RBP	0.06	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	POLR2J	P52435	117 aa	Known RBP	0.06	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	PCBD1	P61457	104 aa		0.06	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	KLKP1	Q107X0	134 aa		0.06	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	CRYBG3	Q68DQ2	2970 aa		0.06	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		0.06	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	OR9Q1	Q8NGQ5	310 aa		0.06	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	SPRR2G	Q9BYE4	73 aa		0.06	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		0.06	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	PIEZO2	Q9H5I5	2752 aa		0.06	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	MYH1	P12882	1939 aa		0.06	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	0.06	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	WDR87	Q6ZQQ6	2873 aa		0.06	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	MXRA5	Q9NR99	2828 aa		0.05	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		0.05	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	MYCBP2	O75592	4640 aa		0.05	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	USF3	Q68DE3	2245 aa		0.05	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	NBPF19	A0A087WUL8	3843 aa		0.05	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	PNMA8C	A0A1B0GUJ8	204 aa		0.05	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	SPINK1	P00995	79 aa		0.05	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	IFNA21	P01568	189 aa		0.05	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	APOC1	P02654	83 aa		0.05	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	0.05	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	RPL22	P35268	128 aa	Known RBP	0.05	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		0.05	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	TMEM35B	Q8NCS4	154 aa		0.05	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	OR5A2	Q8NGI9	324 aa		0.05	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	OTOS	Q8NHW6	89 aa		0.05	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	NAT14	Q8WUY8	206 aa		0.05	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	DSCR8	Q96T75	97 aa		0.05	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	PKD1L1	Q8TDX9	2849 aa		0.05	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	LRP2	P98164	4655 aa		0.05	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	HRNR	Q86YZ3	2850 aa	Predicted RBP	0.05	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	MYO7B	Q6PIF6	2116 aa		0.05	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		0.05	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	0.05	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	0.05	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	0.04	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	FAT1	Q14517	4588 aa		0.04	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	TG	P01266	2768 aa		0.04	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		0.04	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	TRAV17	A0A0B4J275	112 aa		0.04	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	PGRMC1	O00264	195 aa	Known RBP	0.04	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	UQCRQ	O14949	82 aa		0.04	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	FABP1	P07148	127 aa		0.04	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	ADCYAP1	P18509	176 aa		0.04	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	S100G	P29377	79 aa		0.04	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	MT4	P47944	62 aa		0.04	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	PSPH	P78330	225 aa		0.04	□□□□□ -2.4
CBWD5-231	ENST00000495615	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		0.04	□□□□□ -2.4

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