RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493660.5

SMARCE1-211, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 2,284 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-211ENST00000493660 FASNP49327 2511 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.52
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SMARCE1-211ENST00000493660 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa5.58□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 LINC01619G3V211 115 aa5.58□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 H3BUA1 57 aa5.58□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 M0R2P5 195 aa5.58□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 DEFA4P12838 97 aa5.58□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 HERVK_113P63121 156 aa5.58□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 C9orf153Q5TBE3 101 aa5.58□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 C3orf22Q8N5N4 141 aa5.58□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM158Q8WZ71 300 aa5.58□□□□□ -1.52
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SMARCE1-211ENST00000493660 VPS13CQ709C8 3753 aa5.58□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 I3L2K1 104 aa5.58□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 CAMPP49913 170 aa5.58□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM167BQ9NRX6 74 aa5.58□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 CSMD2Q7Z408 3487 aa5.57□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 TRAV41A0A0B4J266 112 aa5.57□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
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SMARCE1-211ENST00000493660 APELAP0DMC3 54 aa5.57□□□□□ -1.52
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SMARCE1-211ENST00000493660 C10orf126Q8N4M7 172 aa5.57□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 FANCD2OSQ96PS1 177 aa5.57□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 MGST2Q99735 147 aa5.57□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 PRO0628Q9UI54 55 aa5.57□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 K7EIM0 57 aa5.57□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 UQCRQO14949 82 aa5.57□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 LY6G6DO95868 133 aa5.57□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 ECSCRQ19T08 205 aa5.57□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 IL17RELQ6ZVW7 336 aa5.57□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 TRGV9Q99603 122 aa5.57□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC25A2Q9BXI2 301 aa5.57□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 PRSS22Q9GZN4 317 aa5.57□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 ITPR2Q14571 2701 aa5.56□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 AKAP9Q99996 3911 aa5.56□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa5.56□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM89A2RUT3 159 aa5.56□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM223BA6NKX1 122 aa5.56□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 CHEK1O14757 476 aa5.56□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 GNG5P63218 68 aa5.56□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 PRR20EP86478 221 aa5.56□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 PRR20CP86479 221 aa5.56□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 PRR20DP86480 221 aa5.56□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 PRR20BP86481 221 aa5.56□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 PRR20AP86496 221 aa5.56□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM223AQ8IWN6 122 aa5.56□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 Q8N2B8 174 aa5.56□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 ANKRD29Q8N6D5 301 aa5.56□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 GATD1Q8NB37 220 aa5.56□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 NPIPB3Q92617 1050 aa5.56□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 RNF125Q96EQ8 232 aa5.56□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 LINC00526Q96FQ7 95 aa5.56□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF414Q96IQ9 312 aa5.56□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa5.55□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa5.55□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 HIGD1CA8MV81 97 aa5.55□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 SCGB1C2P0DMR2 95 aa5.55□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 CACNG7P62955 275 aa5.55□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 MLANAQ16655 118 aa5.55□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa5.55□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 C15orf53Q8NAA6 179 aa5.55□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 OR8A1Q8NGG7 326 aa5.55□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 HECTD1Q9ULT8 2610 aa5.55□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 CSPG4Q6UVK1 2322 aa5.55□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa5.55□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa5.55□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa5.55□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 LINC01548A6NM66 108 aa5.55□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 APOHP02749 345 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 ATP5G1P05496 136 aa5.55□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 PSMB2P49721 201 aa5.55□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 BLCAPP62952 87 aa5.55□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 CFHR3Q02985 330 aa5.55□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 PMVKQ15126 192 aa5.55□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 CT83Q5H943 113 aa5.55□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 Q6ZQT7 251 aa5.55□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa5.55□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa5.54□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 G3V318 75 aa5.54□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 MIC13Q5XKP0 118 aa5.54□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 C3orf56Q8N813 242 aa5.54□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 USMG5Q96IX5 58 aa5.54□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF702PQ9H963 129 aa5.54□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa5.54□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa5.54□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 LTAP01374 205 aa5.54□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 IGLV1-40P01703 118 aa5.54□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 UBE2D3P61077 147 aa5.54□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 UBE2D2P62837 147 aa5.54□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa5.54□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 CHCHD5Q9BSY4 110 aa5.54□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 GFRA4Q9GZZ7 299 aa5.54□□□□□ -1.52
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