RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491075.1

CLIP2-208, Transcript of CAP-Gly domain containing linker protein 2, human

TSL 1 (best)

Gene CLIP2, Length 551 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLIP2-208	ENST00000491075	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	13.51	□□□□□ -0.25
CLIP2-208	ENST00000491075	SEC11B	P0C7V7	166 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CLIP2-208	ENST00000491075	GNG5	P63218	68 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CLIP2-208	ENST00000491075	GAGE1	Q13065	139 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CLIP2-208	ENST00000491075	GAGE4	Q13068	117 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CLIP2-208	ENST00000491075	GAGE5	Q13069	117 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CLIP2-208	ENST00000491075	GAGE13	Q4V321	117 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CLIP2-208	ENST00000491075	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CLIP2-208	ENST00000491075	SIX6	O95475	246 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CLIP2-208	ENST00000491075	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
CLIP2-208	ENST00000491075	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CLIP2-208	ENST00000491075	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CLIP2-208	ENST00000491075	PARL	Q9H300	379 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CLIP2-208	ENST00000491075	URGCP-MRPS24	S4R325	110 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CLIP2-208	ENST00000491075	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CLIP2-208	ENST00000491075	GCG	P01275	180 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CLIP2-208	ENST00000491075	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
CLIP2-208	ENST00000491075	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CLIP2-208	ENST00000491075	SGK494	Q96LW2	274 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CLIP2-208	ENST00000491075		A0A1W2PPV4	95 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CLIP2-208	ENST00000491075		A8MWV9	139 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CLIP2-208	ENST00000491075	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
CLIP2-208	ENST00000491075	CCDC32	Q9BV29	185 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CLIP2-208	ENST00000491075	HSPB11	Q9Y547	144 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CLIP2-208	ENST00000491075		K7EQM0	130 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CLIP2-208	ENST00000491075	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
CLIP2-208	ENST00000491075	ZFP69	Q49AA0	526 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CLIP2-208	ENST00000491075	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CLIP2-208	ENST00000491075	IGLV2-11	P01706	119 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CLIP2-208	ENST00000491075	SMUG1	Q53HV7	270 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CLIP2-208	ENST00000491075	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CLIP2-208	ENST00000491075	NIT1	Q86X76	327 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CLIP2-208	ENST00000491075	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CLIP2-208	ENST00000491075	LINC00479	Q96M42	142 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CLIP2-208	ENST00000491075	TCRA	P04437	139 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CLIP2-208	ENST00000491075	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
CLIP2-208	ENST00000491075	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CLIP2-208	ENST00000491075	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CLIP2-208	ENST00000491075	KLK12	Q9UKR0	248 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CLIP2-208	ENST00000491075	LGALSL	Q3ZCW2	172 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
CLIP2-208	ENST00000491075	C14orf177	Q52M58	125 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CLIP2-208	ENST00000491075	OR10G9	Q8NGN4	311 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CLIP2-208	ENST00000491075	PPP1R1C	Q8WVI7	109 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CLIP2-208	ENST00000491075	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CLIP2-208	ENST00000491075		Q9UF83	564 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CLIP2-208	ENST00000491075	PSG8	Q9UQ74	426 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CLIP2-208	ENST00000491075	PET100	P0DJ07	73 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CLIP2-208	ENST00000491075	RAB2A	P61019	212 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CLIP2-208	ENST00000491075	ELOB	Q15370	118 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CLIP2-208	ENST00000491075	ATRAID	Q6UW56	229 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CLIP2-208	ENST00000491075	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
CLIP2-208	ENST00000491075	UBE2W	Q96B02	151 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CLIP2-208	ENST00000491075	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CLIP2-208	ENST00000491075	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CLIP2-208	ENST00000491075	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
CLIP2-208	ENST00000491075	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CLIP2-208	ENST00000491075	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
CLIP2-208	ENST00000491075	FLI1	Q01543	452 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
CLIP2-208	ENST00000491075	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CLIP2-208	ENST00000491075		A0A087WX48	190 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CLIP2-208	ENST00000491075	RPL12	P30050	165 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
CLIP2-208	ENST00000491075	RHOD	O00212	210 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CLIP2-208	ENST00000491075	MPC2	O95563	127 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CLIP2-208	ENST00000491075	ASIP	P42127	132 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CLIP2-208	ENST00000491075	H2BFS	P57053	126 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CLIP2-208	ENST00000491075		Q0VG73	95 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CLIP2-208	ENST00000491075	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CLIP2-208	ENST00000491075	PRNT	Q86SH4	94 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CLIP2-208	ENST00000491075	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CLIP2-208	ENST00000491075	SAPCD1	Q5SSQ6	148 aa		13.39	□□□□□ -0.27
CLIP2-208	ENST00000491075	ENKUR	Q8TC29	256 aa		13.39	□□□□□ -0.27
CLIP2-208	ENST00000491075	JPT2	Q9H910	190 aa		13.39	□□□□□ -0.27
CLIP2-208	ENST00000491075	IL36B	Q9NZH7	164 aa		13.39	□□□□□ -0.27
CLIP2-208	ENST00000491075	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		13.38	□□□□□ -0.27
CLIP2-208	ENST00000491075	STAG3L2	P0CL84	134 aa		13.38	□□□□□ -0.27
CLIP2-208	ENST00000491075	STAG3L3	P0CL85	134 aa		13.38	□□□□□ -0.27
CLIP2-208	ENST00000491075	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
CLIP2-208	ENST00000491075	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
CLIP2-208	ENST00000491075	DMRTA1	Q5VZB9	504 aa		13.38	□□□□□ -0.27
CLIP2-208	ENST00000491075	SUN5	Q8TC36	379 aa		13.38	□□□□□ -0.27
CLIP2-208	ENST00000491075	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
CLIP2-208	ENST00000491075	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		13.38	□□□□□ -0.27
CLIP2-208	ENST00000491075	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		13.37	□□□□□ -0.27
CLIP2-208	ENST00000491075	WFDC1	Q9HC57	220 aa		13.37	□□□□□ -0.27
CLIP2-208	ENST00000491075	EPDR1	Q9UM22	224 aa		13.37	□□□□□ -0.27
CLIP2-208	ENST00000491075	GCHFR	P30047	84 aa		13.36	□□□□□ -0.27
CLIP2-208	ENST00000491075	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
CLIP2-208	ENST00000491075	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CLIP2-208	ENST00000491075	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CLIP2-208	ENST00000491075		H3BVH4	76 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CLIP2-208	ENST00000491075	RAB24	Q969Q5	203 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CLIP2-208	ENST00000491075		B4DEV8	164 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CLIP2-208	ENST00000491075	CRP	P02741	224 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CLIP2-208	ENST00000491075	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CLIP2-208	ENST00000491075	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CLIP2-208	ENST00000491075	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CLIP2-208	ENST00000491075	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		13.32	□□□□□ -0.28
CLIP2-208	ENST00000491075	MT1HL1	P0DM35	61 aa		13.32	□□□□□ -0.28
CLIP2-208	ENST00000491075	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
CLIP2-208	ENST00000491075	DNLZ	Q5SXM8	178 aa		13.32	□□□□□ -0.28

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms