RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489630.5

VWA3B-217, Transcript of von Willebrand factor A domain containing 3B, humanhuman

TSL 2

Gene VWA3B, Length 2,575 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3B-217ENST00000489630 FHL3Q13643 280 aa7.79□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 ORMDL2Q53FV1 153 aa7.79□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 C2orf66Q6UXQ4 117 aa7.79□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 C20orf173Q96LM9 149 aa7.79□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 RNF223E7ERA6 249 aa7.79□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.79□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa7.79□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 TIMD4Q96H15 378 aa7.79□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 CDIP1Q9H305 208 aa7.79□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 GATA3P23771 443 aa7.78□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 GAGE5Q13069 117 aa7.78□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 GAGE6Q13070 117 aa7.78□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 C16orf92Q96LL3 132 aa7.78□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 METTL26Q96S19 204 aa7.78□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 EBI3Q14213 229 aa7.78□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 VPREB3Q9UKI3 123 aa7.78□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 MT-ATP8P03928 68 aa7.77□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 COX6B1P14854 86 aa7.77□□□□□ -1.17
VWA3B-217ENST00000489630 S100A4P26447 101 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
VWA3B-217ENST00000489630 UBE2D1P51668 147 aa7.77□□□□□ -1.17
VWA3B-217ENST00000489630 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
VWA3B-217ENST00000489630 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
VWA3B-217ENST00000489630 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
VWA3B-217ENST00000489630 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
VWA3B-217ENST00000489630 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
VWA3B-217ENST00000489630 C11orf86A6NJI1 115 aa7.76□□□□□ -1.17
VWA3B-217ENST00000489630 SPINK8P0C7L1 97 aa7.76□□□□□ -1.17
VWA3B-217ENST00000489630 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa7.76□□□□□ -1.17
VWA3B-217ENST00000489630 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa7.76□□□□□ -1.17
VWA3B-217ENST00000489630 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa7.76□□□□□ -1.17
VWA3B-217ENST00000489630 DUX5Q96PT3 197 aa7.76□□□□□ -1.17
VWA3B-217ENST00000489630 DPH3P1Q9H4G8 78 aa7.76□□□□□ -1.17
VWA3B-217ENST00000489630 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa7.76□□□□□ -1.17
VWA3B-217ENST00000489630 CRYGDP07320 174 aa7.75□□□□□ -1.17
VWA3B-217ENST00000489630 CD7P09564 240 aa7.75□□□□□ -1.17
VWA3B-217ENST00000489630 XGP55808 180 aa7.75□□□□□ -1.17
VWA3B-217ENST00000489630 CDSNQ15517 529 aa7.75□□□□□ -1.17
VWA3B-217ENST00000489630 MINOS1Q5TGZ0 78 aa7.75□□□□□ -1.17
VWA3B-217ENST00000489630 CARD19Q96LW7 228 aa7.75□□□□□ -1.17
VWA3B-217ENST00000489630 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa7.75□□□□□ -1.17
VWA3B-217ENST00000489630 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
VWA3B-217ENST00000489630 OOSP1A8MZH6 123 aa7.75□□□□□ -1.17
VWA3B-217ENST00000489630 GNRH2O43555 120 aa7.75□□□□□ -1.17
VWA3B-217ENST00000489630 ASIPP42127 132 aa7.75□□□□□ -1.17
VWA3B-217ENST00000489630 Q6ZS46 218 aa7.75□□□□□ -1.17
VWA3B-217ENST00000489630 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa7.75□□□□□ -1.17
VWA3B-217ENST00000489630 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
VWA3B-217ENST00000489630 LINC00527Q9UJ94 153 aa7.75□□□□□ -1.17
VWA3B-217ENST00000489630 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
VWA3B-217ENST00000489630 U3KQE9 123 aa7.75□□□□□ -1.17
VWA3B-217ENST00000489630 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa7.74□□□□□ -1.17
VWA3B-217ENST00000489630 TCL1BO95988 128 aa7.74□□□□□ -1.17
VWA3B-217ENST00000489630 TSHBP01222 138 aa7.74□□□□□ -1.17
VWA3B-217ENST00000489630 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
VWA3B-217ENST00000489630 UBE2D3P61077 147 aa7.74□□□□□ -1.17
VWA3B-217ENST00000489630 UBE2D2P62837 147 aa7.74□□□□□ -1.17
VWA3B-217ENST00000489630 AJUBAQ96IF1 538 aa7.74□□□□□ -1.17
VWA3B-217ENST00000489630 ZNF292O60281 2723 aa7.74□□□□□ -1.17
VWA3B-217ENST00000489630 F6UB75 175 aa7.74□□□□□ -1.17
VWA3B-217ENST00000489630 TSPEAR-AS2P59090 65 aa7.74□□□□□ -1.17
VWA3B-217ENST00000489630 Q6ZUT4 128 aa7.74□□□□□ -1.17
VWA3B-217ENST00000489630 NDUFA11Q86Y39 141 aa7.74□□□□□ -1.17
VWA3B-217ENST00000489630 TRAV21A0A0B4J279 112 aa7.73□□□□□ -1.17
VWA3B-217ENST00000489630 A0A0J9YY99 117 aa7.73□□□□□ -1.17
VWA3B-217ENST00000489630 GPHB5Q86YW7 130 aa7.73□□□□□ -1.17
VWA3B-217ENST00000489630 KIR2DL4Q99706 377 aa7.73□□□□□ -1.17
VWA3B-217ENST00000489630 ERG28Q9UKR5 140 aa7.73□□□□□ -1.17
VWA3B-217ENST00000489630 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa7.73□□□□□ -1.17
VWA3B-217ENST00000489630 NBASA2RRP1 2371 aa7.73□□□□□ -1.17
VWA3B-217ENST00000489630 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
VWA3B-217ENST00000489630 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa7.73□□□□□ -1.17
VWA3B-217ENST00000489630 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa7.73□□□□□ -1.17
VWA3B-217ENST00000489630 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa7.73□□□□□ -1.17
VWA3B-217ENST00000489630 SAA4P35542 130 aa7.73□□□□□ -1.17
VWA3B-217ENST00000489630 RPL39P62891 51 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
VWA3B-217ENST00000489630 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa7.73□□□□□ -1.17
VWA3B-217ENST00000489630 SIRPDQ9H106 197 aa7.73□□□□□ -1.17
VWA3B-217ENST00000489630 TRBV12-3P01733 135 aa7.72□□□□□ -1.17
VWA3B-217ENST00000489630 CFC1BP0CG36 223 aa7.72□□□□□ -1.17
VWA3B-217ENST00000489630 CFC1P0CG37 223 aa7.72□□□□□ -1.17
VWA3B-217ENST00000489630 C9orf139Q6ZV77 190 aa7.72□□□□□ -1.17
VWA3B-217ENST00000489630 TMEM219Q86XT9 240 aa7.72□□□□□ -1.17
VWA3B-217ENST00000489630 OR10J6PQ8NGY7 276 aa7.72□□□□□ -1.17
VWA3B-217ENST00000489630 JPT2Q9H910 190 aa7.72□□□□□ -1.17
VWA3B-217ENST00000489630 SPTA1P02549 2419 aa7.72□□□□□ -1.17
VWA3B-217ENST00000489630 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
VWA3B-217ENST00000489630 TEN1Q86WV5 123 aa7.72□□□□□ -1.17
VWA3B-217ENST00000489630 PPDPFLQ8WWR9 84 aa7.72□□□□□ -1.17
VWA3B-217ENST00000489630 RNF183Q96D59 192 aa7.72□□□□□ -1.17
VWA3B-217ENST00000489630 B5MCH6 92 aa7.71□□□□□ -1.17
VWA3B-217ENST00000489630 KLK9Q2XQG4 91 aa7.71□□□□□ -1.17
VWA3B-217ENST00000489630 TMEM170BQ5T4T1 132 aa7.71□□□□□ -1.17
VWA3B-217ENST00000489630 LINC00477Q96M19 166 aa7.71□□□□□ -1.17
VWA3B-217ENST00000489630 KLK9Q9UKQ9 250 aa7.71□□□□□ -1.17
VWA3B-217ENST00000489630 RPL11P62913 178 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.18
VWA3B-217ENST00000489630 C11orf71Q6IPW1 123 aa7.71□□□□□ -1.18
VWA3B-217ENST00000489630 NRGNQ92686 78 aa7.71□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.4 ms