RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486964.5

POLR1A-208, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 5

Gene POLR1A, Length 1,427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-208ENST00000486964 Q6ZVH6 145 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 Q8N8P6 123 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 Q8TAT8 98 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 VGLL1Q99990 258 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 K7EMI3 77 aa7.29□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 K7EP34 96 aa7.29□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 BUB3O43684 328 aa7.29□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 DPM2O94777 84 aa7.29□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 TNFRSF6BO95407 300 aa7.29□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 PF4V1P10720 104 aa7.29□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 KIR3DS1Q14943 382 aa7.29□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 C10orf99Q6UWK7 81 aa7.29□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa7.29□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 MRAP2Q96G30 205 aa7.29□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 RNF185Q96GF1 192 aa7.29□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa7.28□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 GAGE12BA1L429 117 aa7.28□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 TRBV12-3P01733 135 aa7.28□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 IGKCP01834 107 aa7.28□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 EVI2AP22794 236 aa7.28□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 LEPP41159 167 aa7.28□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 NMUP48645 174 aa7.28□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 SCGB2A2Q13296 93 aa7.28□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 FAM106AQ4KMX7 169 aa7.28□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa7.28□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 Q6ZSV7 163 aa7.28□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 DUX5Q96PT3 197 aa7.28□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 ZMAT4Q9H898 229 aa7.28□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 TP73-AS1Q9UF72 201 aa7.28□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa7.27□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 NDUFA4O00483 81 aa7.27□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 PLNP26678 52 aa7.27□□□□□ -1.24
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POLR1A-208ENST00000486964 ODF1Q14990 250 aa7.27□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 UFSP1Q6NVU6 142 aa7.27□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa7.27□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 LCNL1Q6ZST4 164 aa7.27□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 OR2K2Q8NGT1 345 aa7.27□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 VPS25Q9BRG1 176 aa7.27□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 C16orf95Q9H693 158 aa7.27□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 LINC01549A6NIU2 74 aa7.27□□□□□ -1.25
POLR1A-208ENST00000486964 SMKR1H3BMG3 65 aa7.27□□□□□ -1.25
POLR1A-208ENST00000486964 SNAI2O43623 268 aa7.27□□□□□ -1.25
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POLR1A-208ENST00000486964 MED14OSP0DP75 135 aa7.27□□□□□ -1.25
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POLR1A-208ENST00000486964 ARL3P36405 182 aa7.27□□□□□ -1.25
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POLR1A-208ENST00000486964 IGHV3-11P01762 117 aa7.26□□□□□ -1.25
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POLR1A-208ENST00000486964 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa7.26□□□□□ -1.25
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POLR1A-208ENST00000486964 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa7.25□□□□□ -1.25
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POLR1A-208ENST00000486964 LINC01619G3V211 115 aa7.25□□□□□ -1.25
POLR1A-208ENST00000486964 K7EMT4 169 aa7.25□□□□□ -1.25
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POLR1A-208ENST00000486964 OVOL1O14753 267 aa7.25□□□□□ -1.25
POLR1A-208ENST00000486964 SMIM17P0DL12 118 aa7.25□□□□□ -1.25
POLR1A-208ENST00000486964 ERCC8Q13216 396 aa7.25□□□□□ -1.25
POLR1A-208ENST00000486964 SPANXN1Q5VSR9 72 aa7.25□□□□□ -1.25
POLR1A-208ENST00000486964 SAMD13Q5VXD3 122 aa7.25□□□□□ -1.25
POLR1A-208ENST00000486964 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa7.25□□□□□ -1.25
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POLR1A-208ENST00000486964 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa7.25□□□□□ -1.25
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POLR1A-208ENST00000486964 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa7.24□□□□□ -1.25
POLR1A-208ENST00000486964 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa7.24□□□□□ -1.25
POLR1A-208ENST00000486964 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa7.24□□□□□ -1.25
POLR1A-208ENST00000486964 H3BUT2 72 aa7.24□□□□□ -1.25
POLR1A-208ENST00000486964 M0R381 172 aa7.24□□□□□ -1.25
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POLR1A-208ENST00000486964 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
POLR1A-208ENST00000486964 HLA-DMBP28068 263 aa7.24□□□□□ -1.25
POLR1A-208ENST00000486964 C16orf92Q96LL3 132 aa7.24□□□□□ -1.25
POLR1A-208ENST00000486964 LINC00477Q96M19 166 aa7.24□□□□□ -1.25
POLR1A-208ENST00000486964 C18orf15Q96N68 181 aa7.24□□□□□ -1.25
POLR1A-208ENST00000486964 C20orf78Q9BR46 151 aa7.24□□□□□ -1.25
POLR1A-208ENST00000486964 UFC1Q9Y3C8 167 aa7.24□□□□□ -1.25
POLR1A-208ENST00000486964 SPCS1Q9Y6A9 102 aa7.24□□□□□ -1.25
POLR1A-208ENST00000486964 A0A087WX48 190 aa7.23□□□□□ -1.25
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