RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486889.1

CTPS1-210, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 2

Gene CTPS1, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-210ENST00000486889 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 A0A0J9YWU9 116 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 GRIFINA4D1Z8 144 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 GNRH2O43555 120 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 OR5AL1P0C617 328 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 ARMS2P0C7Q2 107 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 RBMY1CP0DJD4 496 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 AZU1P20160 251 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 WDR73Q6P4I2 378 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 PTH2Q96A98 100 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 TGP01266 2768 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-210ENST00000486889 A0A1B0GW15 77 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-210ENST00000486889 A8MWV9 139 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-210ENST00000486889 H3BVH4 76 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-210ENST00000486889 TRGC1P0CF51 173 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-210ENST00000486889 DEFB130BP0DP73 79 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-210ENST00000486889 DEFB130AP0DP74 79 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-210ENST00000486889 SLAQ13239 276 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-210ENST00000486889 RIGQ13278 110 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF876PQ49A33 203 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-210ENST00000486889 C10orf91Q5T1B1 145 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-210ENST00000486889 FAM222AQ5U5X8 452 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-210ENST00000486889 TMEM242Q9NWH2 141 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-210ENST00000486889 A0A087WWC5 75 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-210ENST00000486889 M0R381 172 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-210ENST00000486889 RHODO00212 210 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-210ENST00000486889 ATP5G1P05496 136 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-210ENST00000486889 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-210ENST00000486889 CLRN3Q8NCR9 226 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-210ENST00000486889 OR4C5Q8NGB2 326 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-210ENST00000486889 RASL10AQ92737 203 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-210ENST00000486889 AP1S3Q96PC3 154 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-210ENST00000486889 IMMP2LQ96T52 175 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-210ENST00000486889 RPS10P5Q9NQ39 176 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-210ENST00000486889 MDFICQ9P1T7 246 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-210ENST00000486889 DKK2Q9UBU2 259 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-210ENST00000486889 A0A1B0GUT8 65 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-210ENST00000486889 GAGE12BA1L429 117 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-210ENST00000486889 DEFB4AO15263 64 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-210ENST00000486889 SPINK4O60575 86 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-210ENST00000486889 GAGE7O76087 117 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-210ENST00000486889 GAGE12FP0CL80 117 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-210ENST00000486889 GAGE12GP0CL81 117 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-210ENST00000486889 GAGE12IP0CL82 117 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-210ENST00000486889 S100A1P23297 94 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-210ENST00000486889 TWIST1Q15672 202 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-210ENST00000486889 RNF212Q495C1 297 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-210ENST00000486889 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CTPS1-210ENST00000486889 C11orf72Q8NBR9 251 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-210ENST00000486889 C9orf85Q96MD7 179 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-210ENST00000486889 C11orf21Q9P2W6 132 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-210ENST00000486889 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-210ENST00000486889 TRAV10A0A0B4J240 114 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-210ENST00000486889 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-210ENST00000486889 HIGD1CA8MV81 97 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-210ENST00000486889 SNAI2O43623 268 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-210ENST00000486889 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-210ENST00000486889 LYZL1Q6UWQ5 148 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-210ENST00000486889 C18orf15Q96N68 181 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-210ENST00000486889 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-210ENST00000486889 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-210ENST00000486889 V9GYV3 84 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-210ENST00000486889 TRAV4A0A0B4J268 109 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-210ENST00000486889 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-210ENST00000486889 C7orf77A4D0Y5 90 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-210ENST00000486889 H7C1H1 209 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-210ENST00000486889 IGLC6P0CF74 106 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-210ENST00000486889 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-210ENST00000486889 ADCYAP1P18509 176 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-210ENST00000486889 CTRLP40313 264 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-210ENST00000486889 COX19Q49B96 90 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-210ENST00000486889 Q6ZQT7 251 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-210ENST00000486889 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-210ENST00000486889 FAM210BQ96KR6 192 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-210ENST00000486889 PGLYRP4Q96LB8 373 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-210ENST00000486889 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-210ENST00000486889 SCRT2Q9NQ03 307 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-210ENST00000486889 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-210ENST00000486889 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-210ENST00000486889 NUPR2A6NF83 97 aa6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-210ENST00000486889 PRM2P04554 102 aa6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-210ENST00000486889 GZMBP10144 247 aa6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-210ENST00000486889 NTF3P20783 257 aa6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-210ENST00000486889 ZFP2Q6ZN57 461 aa6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-210ENST00000486889 Q6ZTI0 123 aa6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-210ENST00000486889 PRADC1Q9BSG0 188 aa6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-210ENST00000486889 CMYA5Q8N3K9 4069 aa6.96□□□□□ -1.29
CTPS1-210ENST00000486889 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-210ENST00000486889 PLAC8L1A1L4L8 177 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-210ENST00000486889 F5H697 171 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-210ENST00000486889 F5H768 121 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-210ENST00000486889 HTN3P15516 51 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-210ENST00000486889 SSTP61278 116 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-210ENST00000486889 HBBP68871 147 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-210ENST00000486889 FAM74A4Q5TZK3 123 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-210ENST00000486889 RASL11AQ6T310 242 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-210ENST00000486889 OR10AG1Q8NH19 301 aa6.96□□□□□ -1.3
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