RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468922.1

SYN3-210, Transcript of synapsin III, humanhuman

TSL 3

Gene SYN3, Length 507 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN3-210ENST00000468922 TRAV34A0A0B4J273 112 aa5.85□□□□□ -1.47
SYN3-210ENST00000468922 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa5.85□□□□□ -1.47
SYN3-210ENST00000468922 M0R2P5 195 aa5.85□□□□□ -1.47
SYN3-210ENST00000468922 PEX7O00628 323 aa5.85□□□□□ -1.47
SYN3-210ENST00000468922 GCGP01275 180 aa5.85□□□□□ -1.47
SYN3-210ENST00000468922 IFNA7P01567 189 aa5.85□□□□□ -1.47
SYN3-210ENST00000468922 PFN1P07737 140 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
SYN3-210ENST00000468922 UBE2G2P60604 165 aa5.85□□□□□ -1.47
SYN3-210ENST00000468922 IFITM2Q01629 132 aa5.85□□□□□ -1.47
SYN3-210ENST00000468922 ESRGQ1W209 222 aa5.85□□□□□ -1.47
SYN3-210ENST00000468922 PRNTQ86SH4 94 aa5.85□□□□□ -1.47
SYN3-210ENST00000468922 TCEAL7Q9BRU2 100 aa5.85□□□□□ -1.47
SYN3-210ENST00000468922 UPK3BQ9BT76 320 aa5.85□□□□□ -1.47
SYN3-210ENST00000468922 SDF2L1Q9HCN8 221 aa5.85□□□□□ -1.47
SYN3-210ENST00000468922 PRO0255Q9UI72 69 aa5.85□□□□□ -1.47
SYN3-210ENST00000468922 NAGKQ9UJ70 344 aa5.85□□□□□ -1.47
SYN3-210ENST00000468922 PAX4O43316 350 aa5.84□□□□□ -1.47
SYN3-210ENST00000468922 IGHV3-53P01767 116 aa5.84□□□□□ -1.47
SYN3-210ENST00000468922 TPT1P13693 172 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
SYN3-210ENST00000468922 PPT1P50897 306 aa5.84□□□□□ -1.47
SYN3-210ENST00000468922 CRYBA4P53673 196 aa5.84□□□□□ -1.47
SYN3-210ENST00000468922 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
SYN3-210ENST00000468922 Q86TA4 180 aa5.84□□□□□ -1.47
SYN3-210ENST00000468922 FAM213BQ8TBF2 198 aa5.84□□□□□ -1.47
SYN3-210ENST00000468922 SFT2D1Q8WV19 159 aa5.84□□□□□ -1.47
SYN3-210ENST00000468922 PTH2Q96A98 100 aa5.84□□□□□ -1.47
SYN3-210ENST00000468922 ZNF479Q96JC4 524 aa5.84□□□□□ -1.47
SYN3-210ENST00000468922 C9orf85Q96MD7 179 aa5.84□□□□□ -1.47
SYN3-210ENST00000468922 ZFP30Q9Y2G7 519 aa5.84□□□□□ -1.47
SYN3-210ENST00000468922 TRAV4A0A0B4J268 109 aa5.83□□□□□ -1.48
SYN3-210ENST00000468922 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa5.83□□□□□ -1.48
SYN3-210ENST00000468922 A4D1N5 150 aa5.83□□□□□ -1.48
SYN3-210ENST00000468922 FABP5P3A8MUU1 101 aa5.83□□□□□ -1.48
SYN3-210ENST00000468922 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
SYN3-210ENST00000468922 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa5.83□□□□□ -1.48
SYN3-210ENST00000468922 FMC1Q96HJ9 113 aa5.83□□□□□ -1.48
SYN3-210ENST00000468922 Q9H8V8 135 aa5.83□□□□□ -1.48
SYN3-210ENST00000468922 HHLA3Q9XRX5 114 aa5.83□□□□□ -1.48
SYN3-210ENST00000468922 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
SYN3-210ENST00000468922 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa5.82□□□□□ -1.48
SYN3-210ENST00000468922 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa5.82□□□□□ -1.48
SYN3-210ENST00000468922 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa5.82□□□□□ -1.48
SYN3-210ENST00000468922 CIDEAO60543 219 aa5.82□□□□□ -1.48
SYN3-210ENST00000468922 PAGE4O60829 102 aa5.82□□□□□ -1.48
SYN3-210ENST00000468922 H2AFB1P0C5Y9 115 aa5.82□□□□□ -1.48
SYN3-210ENST00000468922 SFTA3P0C7M3 94 aa5.82□□□□□ -1.48
SYN3-210ENST00000468922 CRIP1P50238 77 aa5.82□□□□□ -1.48
SYN3-210ENST00000468922 RAB5CP51148 216 aa5.82□□□□□ -1.48
SYN3-210ENST00000468922 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
SYN3-210ENST00000468922 DNLZQ5SXM8 178 aa5.82□□□□□ -1.48
SYN3-210ENST00000468922 CST9LP1Q5W188 147 aa5.82□□□□□ -1.48
SYN3-210ENST00000468922 ICOSQ9Y6W8 199 aa5.82□□□□□ -1.48
SYN3-210ENST00000468922 RS1O15537 224 aa5.81□□□□□ -1.48
SYN3-210ENST00000468922 LTAP01374 205 aa5.81□□□□□ -1.48
SYN3-210ENST00000468922 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
SYN3-210ENST00000468922 MALP21145 153 aa5.81□□□□□ -1.48
SYN3-210ENST00000468922 SULT1A2P50226 295 aa5.81□□□□□ -1.48
SYN3-210ENST00000468922 UBE2G1P62253 170 aa5.81□□□□□ -1.48
SYN3-210ENST00000468922 ZNF876PQ49A33 203 aa5.81□□□□□ -1.48
SYN3-210ENST00000468922 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa5.81□□□□□ -1.48
SYN3-210ENST00000468922 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
SYN3-210ENST00000468922 OR4C5Q8NGB2 326 aa5.81□□□□□ -1.48
SYN3-210ENST00000468922 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa5.81□□□□□ -1.48
SYN3-210ENST00000468922 A0A1W2PPQ1 181 aa5.8□□□□□ -1.48
SYN3-210ENST00000468922 KRBOX1C9JBD0 128 aa5.8□□□□□ -1.48
SYN3-210ENST00000468922 J3QL48 77 aa5.8□□□□□ -1.48
SYN3-210ENST00000468922 K7EQD1 137 aa5.8□□□□□ -1.48
SYN3-210ENST00000468922 SH2D1AO60880 128 aa5.8□□□□□ -1.48
SYN3-210ENST00000468922 ORM1P02763 201 aa5.8□□□□□ -1.48
SYN3-210ENST00000468922 S100A9P06702 114 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
SYN3-210ENST00000468922 AKR1C3P42330 323 aa5.8□□□□□ -1.48
SYN3-210ENST00000468922 TTC32Q5I0X7 151 aa5.8□□□□□ -1.48
SYN3-210ENST00000468922 ZNF506Q5JVG8 444 aa5.8□□□□□ -1.48
SYN3-210ENST00000468922 CFAP126Q5VTH2 177 aa5.8□□□□□ -1.48
SYN3-210ENST00000468922 LYPD5Q6UWN5 251 aa5.8□□□□□ -1.48
SYN3-210ENST00000468922 NEGR1Q7Z3B1 354 aa5.8□□□□□ -1.48
SYN3-210ENST00000468922 SLC51BQ86UW2 128 aa5.8□□□□□ -1.48
SYN3-210ENST00000468922 MLST8Q9BVC4 326 aa5.8□□□□□ -1.48
SYN3-210ENST00000468922 IL36BQ9NZH7 164 aa5.8□□□□□ -1.48
SYN3-210ENST00000468922 A0A1B0GV50 99 aa5.79□□□□□ -1.48
SYN3-210ENST00000468922 SCO2A0A1W2PP80 73 aa5.79□□□□□ -1.48
SYN3-210ENST00000468922 B4DEV8 164 aa5.79□□□□□ -1.48
SYN3-210ENST00000468922 C9JCJ5 164 aa5.79□□□□□ -1.48
SYN3-210ENST00000468922 GYPEP15421 78 aa5.79□□□□□ -1.48
SYN3-210ENST00000468922 ASIPP42127 132 aa5.79□□□□□ -1.48
SYN3-210ENST00000468922 CCL20P78556 96 aa5.79□□□□□ -1.48
SYN3-210ENST00000468922 FAM162BQ5T6X4 162 aa5.79□□□□□ -1.48
SYN3-210ENST00000468922 SPATA12Q7Z6I5 190 aa5.79□□□□□ -1.48
SYN3-210ENST00000468922 C6orf223Q8N319 242 aa5.79□□□□□ -1.48
SYN3-210ENST00000468922 C9orf62Q8N4C0 152 aa5.79□□□□□ -1.48
SYN3-210ENST00000468922 C11orf52Q96A22 123 aa5.79□□□□□ -1.48
SYN3-210ENST00000468922 TXNDC17Q9BRA2 123 aa5.79□□□□□ -1.48
SYN3-210ENST00000468922 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa5.79□□□□□ -1.48
SYN3-210ENST00000468922 MANBALQ9NQG1 85 aa5.79□□□□□ -1.48
SYN3-210ENST00000468922 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa5.78□□□□□ -1.48
SYN3-210ENST00000468922 SIVA1O15304 175 aa5.78□□□□□ -1.48
SYN3-210ENST00000468922 S100A4P26447 101 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
SYN3-210ENST00000468922 SRIP30626 198 aa5.78□□□□□ -1.48
SYN3-210ENST00000468922 TIRAPP58753 221 aa5.78□□□□□ -1.48
SYN3-210ENST00000468922 RAB14P61106 215 aa5.78□□□□□ -1.48
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