RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463041.1

PTPRF-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, human

TSL 3

Gene PTPRF, Length 298 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRF-210	ENST00000463041	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	FHIT	P49789	147 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	KRTAP10-2	P60368	255 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	UBE2G2	P60604	165 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	RHOH	Q15669	191 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	CYTL1	Q9NRR1	136 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	ARPC5	O15511	151 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	CRYGD	P07320	174 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	MGST1	P10620	155 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	ERVFC1-1	P60608	527 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	DNLZ	Q5SXM8	178 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	TCEAL7	Q9BRU2	100 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	GTSF1L	Q9H1H1	148 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	IL36B	Q9NZH7	164 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041		A0A087WTM6	91 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041		A0A0D9SG52	128 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	HMSD	A8MTL9	139 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041		B4DEV8	164 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	UMAD1	C9J7I0	102 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	KRBOX1	C9JBD0	128 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	S100A9	P06702	114 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	SEC11B	P0C7V7	166 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	ASIP	P42127	132 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	CRIP1	P50238	77 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	UBE2G1	P62253	170 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	ZNF345	Q14585	488 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	LGALSL	Q3ZCW2	172 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	LELP1	Q5T871	98 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	CST9LP1	Q5W188	147 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	FMC1	Q96HJ9	113 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	KRTAP4-5	Q9BYR2	181 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	ARMS2	P0C7Q2	107 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	EIF5A	P63241	154 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	ZNF674	Q2M3X9	581 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	DMRTA1	Q5VZB9	504 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041		Q6ZSN1	163 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041		Q86TA4	180 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041		Q8N1X5	172 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	SYT8	Q8NBV8	401 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	SFT2D1	Q8WV19	159 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	PARL	Q9H300	379 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041		A0A087WWC5	75 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRF-210	ENST00000463041	SMLR1	H3BR10	107 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRF-210	ENST00000463041	RHOD	O00212	210 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRF-210	ENST00000463041	PAGE4	O60829	102 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRF-210	ENST00000463041	SH2D1A	O60880	128 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRF-210	ENST00000463041	LTA	P01374	205 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRF-210	ENST00000463041	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRF-210	ENST00000463041	JPT2	Q9H910	190 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRF-210	ENST00000463041	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRF-210	ENST00000463041	PHLDA3	Q9Y5J5	127 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRF-210	ENST00000463041	KANTR	A0A1W2PQU2	76 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPRF-210	ENST00000463041	GRIFIN	A4D1Z8	144 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPRF-210	ENST00000463041	GAGE12J	A6NER3	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPRF-210	ENST00000463041		H3BVH4	76 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPRF-210	ENST00000463041		M0R036	132 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPRF-210	ENST00000463041	PSCA	O43653	123 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPRF-210	ENST00000463041	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPRF-210	ENST00000463041	TPT1	P13693	172 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PTPRF-210	ENST00000463041	AKR1C3	P42330	323 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPRF-210	ENST00000463041	GAGE1	Q13065	139 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPRF-210	ENST00000463041	GAGE4	Q13068	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPRF-210	ENST00000463041	GAGE5	Q13069	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPRF-210	ENST00000463041	LINC01559	Q495D7	138 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPRF-210	ENST00000463041	GAGE13	Q4V321	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPRF-210	ENST00000463041	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPRF-210	ENST00000463041	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPRF-210	ENST00000463041	SFRP2	Q96HF1	295 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPRF-210	ENST00000463041	TM2D2	Q9BX73	214 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPRF-210	ENST00000463041	ZNF471	Q9BX82	626 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PTPRF-210	ENST00000463041	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPRF-210	ENST00000463041	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPRF-210	ENST00000463041	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPRF-210	ENST00000463041	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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