RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462323.5

MUC4-208, Transcript of mucin 4, cell surface associated, human

TSL 5

Gene MUC4, Length 16,197 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MUC4-208	ENST00000462323	PRO0461	Q9UI25	63 aa		4.59	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	PKD1L2	Q7Z442	2459 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	SH2D1A	O60880	128 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	LINC00311	Q8N616	119 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	LINC01560	Q8TB33	94 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	PIEZO2	Q9H5I5	2752 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	ARID2	Q68CP9	1835 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	FGF23	Q9GZV9	251 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	TRGV4	A0A0C4DH28	118 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	FGF6	P10767	208 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	THAP8	Q8NA92	274 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	DKK2	Q9UBU2	259 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	IGHV1-3	A0A0C4DH29	117 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	IGLV1-44	P01699	117 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	C11orf53	Q8IXP5	236 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	LY6G5B	Q8NDX9	201 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	ZNF876P	Q49A33	203 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	PEMT	Q9UBM1	199 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	TICRR	Q7Z2Z1	1910 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	TEX49	A0A1B0GTD5	131 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	MP68	P56378	58 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323		P0C879	139 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	SERP1	Q9Y6X1	66 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	IGKV3D-7	A0A0C4DH55	119 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	FAM240A	A0A1B0GVK7	77 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	ERCC8	Q13216	396 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	FAM168A	Q92567	244 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	FOXE3	Q13461	319 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	IGKV1-16	P04430	117 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	MBD6	Q96DN6	1003 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	FXYD7	P58549	80 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323		Q6ZR03	302 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	ZNF134	P52741	427 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	DEFB105A	Q8NG35	78 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	ADAMTS9	Q9P2N4	1935 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	ITLN2	Q8WWU7	325 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	SERP2	Q8N6R1	65 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	FXYD5	Q96DB9	178 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323		Q8N8P6	123 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	TRAV40	A0A0B4J280	105 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323		M0R1W7	72 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	TMEM105	Q8N8V8	129 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	TMEM131	Q92545	1883 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	HLA-DRB4	P13762	266 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	SLC25A16	P16260	332 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	LY6E	Q16553	131 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323		S4R3C0	116 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	BUB1B-PAK6	H3BSN5	160 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	ZNF503-AS2	A6NEH8	195 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323		K7EM74	188 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	PCDH15	Q96QU1	1955 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	PLXNB3	Q9ULL4	1909 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	NOTCH4	Q99466	2003 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	JMJD1C	Q15652	2540 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	RLF	Q13129	1914 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	TCL1B	O95988	128 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	ODF3	Q96PU9	254 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	CR1L	Q2VPA4	569 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	PIP4P1	Q86T03	277 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	MPLKIP	Q8TAP9	179 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	CHD8	Q9HCK8	2581 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	ARMS2	P0C7Q2	107 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323		H3BQ85	93 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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