RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446904.5

SH3BP4-206, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 829 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-206ENST00000446904 PRNTQ86SH4 94 aa6.91□□□□□ -1.3
SH3BP4-206ENST00000446904 PRADC1Q9BSG0 188 aa6.91□□□□□ -1.3
SH3BP4-206ENST00000446904 PSG8Q9UQ74 426 aa6.91□□□□□ -1.3
SH3BP4-206ENST00000446904 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa6.9□□□□□ -1.3
SH3BP4-206ENST00000446904 LRCOL1A6NCL2 159 aa6.9□□□□□ -1.3
SH3BP4-206ENST00000446904 PGPEP1LA6NFU8 196 aa6.9□□□□□ -1.3
SH3BP4-206ENST00000446904 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa6.9□□□□□ -1.3
SH3BP4-206ENST00000446904 GGTLC3B5MD39 225 aa6.9□□□□□ -1.3
SH3BP4-206ENST00000446904 IGHV3-30P01768 117 aa6.9□□□□□ -1.3
SH3BP4-206ENST00000446904 IGHV3-33P01772 117 aa6.9□□□□□ -1.3
SH3BP4-206ENST00000446904 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa6.9□□□□□ -1.3
SH3BP4-206ENST00000446904 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa6.9□□□□□ -1.3
SH3BP4-206ENST00000446904 ATP6V0CP27449 155 aa6.9□□□□□ -1.3
SH3BP4-206ENST00000446904 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
SH3BP4-206ENST00000446904 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
SH3BP4-206ENST00000446904 SMUG1Q53HV7 270 aa6.9□□□□□ -1.3
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF506Q5JVG8 444 aa6.9□□□□□ -1.3
SH3BP4-206ENST00000446904 Q6ZSN1 163 aa6.9□□□□□ -1.3
SH3BP4-206ENST00000446904 SUN5Q8TC36 379 aa6.9□□□□□ -1.3
SH3BP4-206ENST00000446904 C9orf85Q96MD7 179 aa6.9□□□□□ -1.3
SH3BP4-206ENST00000446904 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
SH3BP4-206ENST00000446904 SH3BGRL3Q9H299 93 aa6.9□□□□□ -1.3
SH3BP4-206ENST00000446904 EPDR1Q9UM22 224 aa6.9□□□□□ -1.3
SH3BP4-206ENST00000446904 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
SH3BP4-206ENST00000446904 ZFP69Q49AA0 526 aa6.89□□□□□ -1.31
SH3BP4-206ENST00000446904 LELP1Q5T871 98 aa6.89□□□□□ -1.31
SH3BP4-206ENST00000446904 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa6.89□□□□□ -1.31
SH3BP4-206ENST00000446904 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
SH3BP4-206ENST00000446904 GTSF1LQ9H1H1 148 aa6.89□□□□□ -1.31
SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM167BQ9NRX6 74 aa6.89□□□□□ -1.31
SH3BP4-206ENST00000446904 TRAV34A0A0B4J273 112 aa6.88□□□□□ -1.31
SH3BP4-206ENST00000446904 CIDEAO60543 219 aa6.88□□□□□ -1.31
SH3BP4-206ENST00000446904 CXorf1O96002 111 aa6.88□□□□□ -1.31
SH3BP4-206ENST00000446904 MBP02144 154 aa6.88□□□□□ -1.31
SH3BP4-206ENST00000446904 MGST1P10620 155 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
SH3BP4-206ENST00000446904 Q5BKY6 102 aa6.88□□□□□ -1.31
SH3BP4-206ENST00000446904 Q8N3U1 123 aa6.88□□□□□ -1.31
SH3BP4-206ENST00000446904 Q8N814 137 aa6.88□□□□□ -1.31
SH3BP4-206ENST00000446904 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa6.88□□□□□ -1.31
SH3BP4-206ENST00000446904 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
SH3BP4-206ENST00000446904 PTH2Q96A98 100 aa6.88□□□□□ -1.31
SH3BP4-206ENST00000446904 LINC00479Q96M42 142 aa6.88□□□□□ -1.31
SH3BP4-206ENST00000446904 AQP10Q96PS8 301 aa6.88□□□□□ -1.31
SH3BP4-206ENST00000446904 IFNA7P01567 189 aa6.87□□□□□ -1.31
SH3BP4-206ENST00000446904 SERF2P84101 59 aa6.87□□□□□ -1.31
SH3BP4-206ENST00000446904 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa6.87□□□□□ -1.31
SH3BP4-206ENST00000446904 MED28Q9H204 178 aa6.87□□□□□ -1.31
SH3BP4-206ENST00000446904 PARLQ9H300 379 aa6.87□□□□□ -1.31
SH3BP4-206ENST00000446904 TNFSF18Q9UNG2 199 aa6.87□□□□□ -1.31
SH3BP4-206ENST00000446904 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa6.86□□□□□ -1.31
SH3BP4-206ENST00000446904 GAGE12JA6NER3 117 aa6.86□□□□□ -1.31
SH3BP4-206ENST00000446904 FAM229AH3BQW9 127 aa6.86□□□□□ -1.31
SH3BP4-206ENST00000446904 S100A4P26447 101 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
SH3BP4-206ENST00000446904 UBE2G2P60604 165 aa6.86□□□□□ -1.31
SH3BP4-206ENST00000446904 GAGE1Q13065 139 aa6.86□□□□□ -1.31
SH3BP4-206ENST00000446904 GAGE4Q13068 117 aa6.86□□□□□ -1.31
SH3BP4-206ENST00000446904 GAGE5Q13069 117 aa6.86□□□□□ -1.31
SH3BP4-206ENST00000446904 WFDC2Q14508 124 aa6.86□□□□□ -1.31
SH3BP4-206ENST00000446904 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
SH3BP4-206ENST00000446904 GAGE13Q4V321 117 aa6.86□□□□□ -1.31
SH3BP4-206ENST00000446904 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
SH3BP4-206ENST00000446904 OR2T35Q8NGX2 323 aa6.86□□□□□ -1.31
SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM70Q9BUB7 260 aa6.86□□□□□ -1.31
SH3BP4-206ENST00000446904 JPT2Q9H910 190 aa6.86□□□□□ -1.31
SH3BP4-206ENST00000446904 Q9UF83 564 aa6.86□□□□□ -1.31
SH3BP4-206ENST00000446904 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa6.86□□□□□ -1.31
SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.85□□□□□ -1.31
SH3BP4-206ENST00000446904 A0A1W2PRE2 83 aa6.85□□□□□ -1.31
SH3BP4-206ENST00000446904 A8MWV9 139 aa6.85□□□□□ -1.31
SH3BP4-206ENST00000446904 LECT2O14960 151 aa6.85□□□□□ -1.31
SH3BP4-206ENST00000446904 LINC00694P0DN24 101 aa6.85□□□□□ -1.31
SH3BP4-206ENST00000446904 ASIPP42127 132 aa6.85□□□□□ -1.31
SH3BP4-206ENST00000446904 LAGE3Q14657 143 aa6.85□□□□□ -1.31
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF726P1Q15940 193 aa6.85□□□□□ -1.31
SH3BP4-206ENST00000446904 RGS21Q2M5E4 152 aa6.85□□□□□ -1.31
SH3BP4-206ENST00000446904 ZFP2Q6ZN57 461 aa6.85□□□□□ -1.31
SH3BP4-206ENST00000446904 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SH3BP4-206ENST00000446904 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SH3BP4-206ENST00000446904 TM2D2Q9BX73 214 aa6.85□□□□□ -1.31
SH3BP4-206ENST00000446904 SAMD10Q9BYL1 202 aa6.85□□□□□ -1.31
SH3BP4-206ENST00000446904 FAM30AQ9NZY2 134 aa6.85□□□□□ -1.31
SH3BP4-206ENST00000446904 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa6.84□□□□□ -1.31
SH3BP4-206ENST00000446904 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa6.84□□□□□ -1.31
SH3BP4-206ENST00000446904 FABP5P3A8MUU1 101 aa6.84□□□□□ -1.31
SH3BP4-206ENST00000446904 H3BVH4 76 aa6.84□□□□□ -1.31
SH3BP4-206ENST00000446904 PEX7O00628 323 aa6.84□□□□□ -1.31
SH3BP4-206ENST00000446904 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SH3BP4-206ENST00000446904 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SH3BP4-206ENST00000446904 Q86TA4 180 aa6.84□□□□□ -1.31
SH3BP4-206ENST00000446904 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SH3BP4-206ENST00000446904 IL36BQ9NZH7 164 aa6.84□□□□□ -1.31
SH3BP4-206ENST00000446904 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa6.83□□□□□ -1.32
SH3BP4-206ENST00000446904 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa6.83□□□□□ -1.32
SH3BP4-206ENST00000446904 GRIFINA4D1Z8 144 aa6.83□□□□□ -1.32
SH3BP4-206ENST00000446904 RNF222A6NCQ9 220 aa6.83□□□□□ -1.32
SH3BP4-206ENST00000446904 B4DEV8 164 aa6.83□□□□□ -1.32
SH3BP4-206ENST00000446904 M0R036 132 aa6.83□□□□□ -1.32
SH3BP4-206ENST00000446904 GIPP09681 153 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
SH3BP4-206ENST00000446904 CRIP1P50238 77 aa6.83□□□□□ -1.32
SH3BP4-206ENST00000446904 UFSP1Q6NVU6 142 aa6.83□□□□□ -1.32
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