RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435136.6

SH3BP2-202, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,318 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-202ENST00000435136 HBDP02042 147 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP2-202ENST00000435136 EVI2AP22794 236 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP2-202ENST00000435136 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP2-202ENST00000435136 C7orf71A4D174 169 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP2-202ENST00000435136 SMKR1H3BMG3 65 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP2-202ENST00000435136 J3KRW8 73 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP2-202ENST00000435136 NCR2O95944 276 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP2-202ENST00000435136 SLURP1P55000 103 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP2-202ENST00000435136 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP2-202ENST00000435136 OR11H1Q8NG94 326 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP2-202ENST00000435136 OR9G4Q8NGQ1 327 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP2-202ENST00000435136 A0A096LNJ9 63 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP2-202ENST00000435136 LINC00173Q6ZV60 143 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP2-202ENST00000435136 FAM159AQ6UWV7 190 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP2-202ENST00000435136 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP2-202ENST00000435136 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2-202ENST00000435136 TFPI2P48307 235 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2-202ENST00000435136 LINC01545Q5VT33 79 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2-202ENST00000435136 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2-202ENST00000435136 C18orf65Q6ZTR6 163 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2-202ENST00000435136 OR2K2Q8NGT1 345 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2-202ENST00000435136 C16orf95Q9H693 158 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2-202ENST00000435136 UQCR10Q9UDW1 63 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2-202ENST00000435136 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2-202ENST00000435136 Q8N8P6 123 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2-202ENST00000435136 DPH3P1Q9H4G8 78 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2-202ENST00000435136 OR4C46A6NHA9 309 aa13.89□□□□□ -0.19
SH3BP2-202ENST00000435136 A8MTW9 85 aa13.89□□□□□ -0.19
SH3BP2-202ENST00000435136 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa13.89□□□□□ -0.19
SH3BP2-202ENST00000435136 IGLC3P0DOY3 106 aa13.89□□□□□ -0.19
SH3BP2-202ENST00000435136 NRACQ8N912 160 aa13.89□□□□□ -0.19
SH3BP2-202ENST00000435136 ESM1Q9NQ30 184 aa13.89□□□□□ -0.19
SH3BP2-202ENST00000435136 SELENOKQ9Y6D0 94 aa13.89□□□□□ -0.19
SH3BP2-202ENST00000435136 M0R381 172 aa13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2-202ENST00000435136 CDKN1BP46527 198 aa13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2-202ENST00000435136 KIR3DS1Q14943 382 aa13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2-202ENST00000435136 DEFB136Q30KP8 78 aa13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2-202ENST00000435136 POM121L12Q8N7R1 296 aa13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2-202ENST00000435136 AP1S3Q96PC3 154 aa13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2-202ENST00000435136 C2orf88Q9BSF0 95 aa13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2-202ENST00000435136 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa13.87□□□□□ -0.19
SH3BP2-202ENST00000435136 ST20Q9HBF5 79 aa13.87□□□□□ -0.19
SH3BP2-202ENST00000435136 PPP1R17O96001 155 aa13.86□□□□□ -0.19
SH3BP2-202ENST00000435136 FCER1GP30273 86 aa13.86□□□□□ -0.19
SH3BP2-202ENST00000435136 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa13.86□□□□□ -0.19
SH3BP2-202ENST00000435136 GNRH2O43555 120 aa13.86□□□□□ -0.19
SH3BP2-202ENST00000435136 FHL3Q13643 280 aa13.86□□□□□ -0.19
SH3BP2-202ENST00000435136 M0R143 59 aa13.85□□□□□ -0.19
SH3BP2-202ENST00000435136 AMTNQ6UX39 209 aa13.85□□□□□ -0.19
SH3BP2-202ENST00000435136 ATOH7Q8N100 152 aa13.85□□□□□ -0.19
SH3BP2-202ENST00000435136 K7EMI3 77 aa13.85□□□□□ -0.19
SH3BP2-202ENST00000435136 GAS8-AS1O95177 125 aa13.85□□□□□ -0.19
SH3BP2-202ENST00000435136 LGALS9BQ3B8N2 356 aa13.85□□□□□ -0.19
SH3BP2-202ENST00000435136 LGALS9CQ6DKI2 356 aa13.85□□□□□ -0.19
SH3BP2-202ENST00000435136 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP13.85□□□□□ -0.19
SH3BP2-202ENST00000435136 C20orf78Q9BR46 151 aa13.85□□□□□ -0.19
SH3BP2-202ENST00000435136 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP13.85□□□□□ -0.19
SH3BP2-202ENST00000435136 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa13.84□□□□□ -0.19
SH3BP2-202ENST00000435136 TRAV25A0A0B4J276 109 aa13.84□□□□□ -0.19
SH3BP2-202ENST00000435136 HSBP1L1C9JCN9 74 aa13.84□□□□□ -0.19
SH3BP2-202ENST00000435136 HLA-DRB4P13762 266 aa13.84□□□□□ -0.19
SH3BP2-202ENST00000435136 DYNLRB2Q8TF09 96 aa13.84□□□□□ -0.19
SH3BP2-202ENST00000435136 C9orf85Q96MD7 179 aa13.84□□□□□ -0.19
SH3BP2-202ENST00000435136 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa13.84□□□□□ -0.19
SH3BP2-202ENST00000435136 COL6A5A8TX70 2615 aa13.83□□□□□ -0.19
SH3BP2-202ENST00000435136 IGLL1P15814 213 aa13.83□□□□□ -0.2
SH3BP2-202ENST00000435136 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP13.83□□□□□ -0.2
SH3BP2-202ENST00000435136 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP13.83□□□□□ -0.2
SH3BP2-202ENST00000435136 MDFIQ99750 246 aa13.83□□□□□ -0.2
SH3BP2-202ENST00000435136 IFI27L1Q96BM0 104 aa13.82□□□□□ -0.2
SH3BP2-202ENST00000435136 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP13.82□□□□□ -0.2
SH3BP2-202ENST00000435136 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa13.82□□□□□ -0.2
SH3BP2-202ENST00000435136 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa13.82□□□□□ -0.2
SH3BP2-202ENST00000435136 CD7P09564 240 aa13.82□□□□□ -0.2
SH3BP2-202ENST00000435136 DEFB114Q30KQ6 69 aa13.82□□□□□ -0.2
SH3BP2-202ENST00000435136 TMEM61Q8N0U2 210 aa13.82□□□□□ -0.2
SH3BP2-202ENST00000435136 SNHG12Q9BXW3 62 aa13.81□□□□□ -0.2
SH3BP2-202ENST00000435136 HILS1P60008 231 aa13.81□□□□□ -0.2
SH3BP2-202ENST00000435136 MAJINQ3KP22 176 aa13.81□□□□□ -0.2
SH3BP2-202ENST00000435136 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa13.81□□□□□ -0.2
SH3BP2-202ENST00000435136 RAX2Q96IS3 184 aa13.81□□□□□ -0.2
SH3BP2-202ENST00000435136 CLUHP3Q96NS8 147 aa13.81□□□□□ -0.2
SH3BP2-202ENST00000435136 SMIM2Q9BVW6 85 aa13.81□□□□□ -0.2
SH3BP2-202ENST00000435136 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP13.81□□□□□ -0.2
SH3BP2-202ENST00000435136 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa13.81□□□□□ -0.2
SH3BP2-202ENST00000435136 NDUFA7O95182 113 aa13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2-202ENST00000435136 RPL32P62910 135 aaKnown RBP13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2-202ENST00000435136 LAGE3Q14657 143 aa13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2-202ENST00000435136 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2-202ENST00000435136 SYT8Q8NBV8 401 aa13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2-202ENST00000435136 TRGV11A0A075B6L2 103 aa13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2-202ENST00000435136 DEFB131AP59861 70 aa13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2-202ENST00000435136 SPINK13Q1W4C9 94 aa13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2-202ENST00000435136 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa13.79□□□□□ -0.2
SH3BP2-202ENST00000435136 H3BMM0 161 aa13.79□□□□□ -0.2
SH3BP2-202ENST00000435136 EREGO14944 169 aa13.79□□□□□ -0.2
SH3BP2-202ENST00000435136 SMIM17P0DL12 118 aa13.79□□□□□ -0.2
SH3BP2-202ENST00000435136 LINC01006Q8NI28 216 aa13.79□□□□□ -0.2
SH3BP2-202ENST00000435136 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
SH3BP2-202ENST00000435136 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.5 ms