RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431803.2

CDC42-IT1-201, CDC42 intronic transcript 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CDC42-IT1, Length 692 nt, Biotype sense intronic.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42-IT1-201ENST00000431803 OR10G7Q8NGN6 311 aa6.34□□□□□ -1.39
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ASB13Q8WXK3 278 aa6.34□□□□□ -1.39
CDC42-IT1-201ENST00000431803 KCNS1Q96KK3 526 aa6.34□□□□□ -1.39
CDC42-IT1-201ENST00000431803 C11orf21Q9P2W6 132 aa6.34□□□□□ -1.39
CDC42-IT1-201ENST00000431803 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 EPM2AB3EWF7 344 aa6.33□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 IGLV2-11P01706 119 aa6.33□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TCRAP04437 139 aa6.33□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 STAG3L2P0CL84 134 aa6.33□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 STAG3L3P0CL85 134 aa6.33□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 KRTAP10-1P60331 282 aa6.33□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ODF1Q14990 250 aa6.33□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 LINC01556Q5JQF7 62 aa6.33□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 C5orf17Q8NAS9 161 aa6.33□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.33□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 DNAH8Q96JB1 4490 aa6.33□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa6.32□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 GGTLC3B5MD39 225 aa6.32□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CIDEAO60543 219 aa6.32□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PFN1P07737 140 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 GCHFRP30047 84 aa6.32□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ZNF876PQ49A33 203 aa6.32□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CFAP126Q5VTH2 177 aa6.32□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 DPPA3Q6W0C5 159 aa6.32□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SLC25A29Q8N8R3 303 aa6.32□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 NHLRC2Q8NBF2 726 aa6.32□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa6.32□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RAB24Q969Q5 203 aa6.32□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PTH2Q96A98 100 aa6.32□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SGK494Q96LW2 274 aa6.32□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 C9orf85Q96MD7 179 aa6.32□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 AQP10Q96PS8 301 aa6.32□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 NDFIP1Q9BT67 221 aa6.32□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ALG5Q9Y673 324 aa6.32□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa6.31□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 LRCOL1A6NCL2 159 aa6.31□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TAAR5O14804 337 aa6.31□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RS1O15537 224 aa6.31□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 GCGP01275 180 aa6.31□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ATP6V0CP27449 155 aa6.31□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PPT1P50897 306 aa6.31□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SERF2P84101 59 aa6.31□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RHOHQ15669 191 aa6.31□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PSG8Q9UQ74 426 aa6.31□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa6.3□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 K7EQM0 130 aa6.3□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MBP02144 154 aa6.3□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 GCSHP23434 173 aa6.3□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ZNF506Q5JVG8 444 aa6.3□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 Q5VSD8 79 aa6.3□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa6.3□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TMEM75Q8N9X5 138 aa6.3□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PRADC1Q9BSG0 188 aa6.3□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SH3BGRL3Q9H299 93 aa6.3□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TMEM167BQ9NRX6 74 aa6.3□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 EPDR1Q9UM22 224 aa6.3□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa6.29□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa6.29□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PGPEP1LA6NFU8 196 aa6.29□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.29□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PTTG1O95997 202 aa6.29□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CXorf1O96002 111 aa6.29□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MGST1P10620 155 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ZFP69Q49AA0 526 aa6.29□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SMUG1Q53HV7 270 aa6.29□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 LELP1Q5T871 98 aa6.29□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TNFSF18Q9UNG2 199 aa6.29□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa6.28□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 A0A1W2PRE2 83 aa6.28□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PSCAO43653 123 aa6.28□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 LINC00694P0DN24 101 aa6.28□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 LAGE3Q14657 143 aa6.28□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 Q5BKY6 102 aa6.28□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 OR10J3Q5JRS4 329 aa6.28□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa6.28□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa6.28□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ZFP2Q6ZN57 461 aa6.28□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PRNTQ86SH4 94 aa6.28□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 FRZBQ92765 325 aa6.28□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 GTSF1LQ9H1H1 148 aa6.28□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MED28Q9H204 178 aa6.28□□□□□ -1.4
CDC42-IT1-201ENST00000431803 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa6.27□□□□□ -1.41
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RNF222A6NCQ9 220 aa6.27□□□□□ -1.41
CDC42-IT1-201ENST00000431803 GIPP09681 153 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CDC42-IT1-201ENST00000431803 INAFM2P0DMQ5 153 aa6.27□□□□□ -1.41
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ZNF726P1Q15940 193 aa6.27□□□□□ -1.41
CDC42-IT1-201ENST00000431803 Q6ZSN1 163 aa6.27□□□□□ -1.41
CDC42-IT1-201ENST00000431803 Q8N814 137 aa6.27□□□□□ -1.41
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa6.27□□□□□ -1.41
CDC42-IT1-201ENST00000431803 LINC00479Q96M42 142 aa6.27□□□□□ -1.41
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TMEM70Q9BUB7 260 aa6.27□□□□□ -1.41
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PARLQ9H300 379 aa6.27□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.4 ms