RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	XG	P55808	180 aa		11.98	□□□□□ -0.49
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		11.98	□□□□□ -0.49
MRPL28-203	ENST00000429738	NKX6-2	Q9C056	277 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
MRPL28-203	ENST00000429738	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		11.98	□□□□□ -0.49
MRPL28-203	ENST00000429738	PEX7	O00628	323 aa		11.97	□□□□□ -0.49
MRPL28-203	ENST00000429738	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
MRPL28-203	ENST00000429738	UBE2G2	P60604	165 aa		11.97	□□□□□ -0.49
MRPL28-203	ENST00000429738	ERVFC1-1	P60608	527 aa		11.97	□□□□□ -0.49
MRPL28-203	ENST00000429738	RHOH	Q15669	191 aa		11.97	□□□□□ -0.49
MRPL28-203	ENST00000429738	AKR1C8P	Q5T2L2	129 aa		11.97	□□□□□ -0.49
MRPL28-203	ENST00000429738	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		11.97	□□□□□ -0.49
MRPL28-203	ENST00000429738	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		11.97	□□□□□ -0.49
MRPL28-203	ENST00000429738	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		11.97	□□□□□ -0.49
MRPL28-203	ENST00000429738	MYCBP2	O75592	4640 aa		11.97	□□□□□ -0.49
MRPL28-203	ENST00000429738	ARPC5	O15511	151 aa		11.96	□□□□□ -0.49
MRPL28-203	ENST00000429738	IFNA7	P01567	189 aa		11.96	□□□□□ -0.49
MRPL28-203	ENST00000429738	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		11.96	□□□□□ -0.49
MRPL28-203	ENST00000429738	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		11.96	□□□□□ -0.49
MRPL28-203	ENST00000429738		Q86TA4	180 aa		11.96	□□□□□ -0.49
MRPL28-203	ENST00000429738	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		11.96	□□□□□ -0.49
MRPL28-203	ENST00000429738	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		11.96	□□□□□ -0.49
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A087WTM6	91 aa		11.95	□□□□□ -0.5
MRPL28-203	ENST00000429738	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		11.95	□□□□□ -0.5
MRPL28-203	ENST00000429738	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		11.95	□□□□□ -0.5
MRPL28-203	ENST00000429738	EREG	O14944	169 aa		11.95	□□□□□ -0.5
MRPL28-203	ENST00000429738	PPT1	P50897	306 aa		11.95	□□□□□ -0.5
MRPL28-203	ENST00000429738	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		11.95	□□□□□ -0.5
MRPL28-203	ENST00000429738	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
MRPL28-203	ENST00000429738	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MRPL28-203	ENST00000429738	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MRPL28-203	ENST00000429738	CRYGD	P07320	174 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MRPL28-203	ENST00000429738	MGST1	P10620	155 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
MRPL28-203	ENST00000429738	CRIP1	P50238	77 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MRPL28-203	ENST00000429738	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MRPL28-203	ENST00000429738		Q5VSD8	79 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MRPL28-203	ENST00000429738	FRZB	Q92765	325 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MRPL28-203	ENST00000429738	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MRPL28-203	ENST00000429738	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	11.93	□□□□□ -0.5
MRPL28-203	ENST00000429738	DNLZ	Q5SXM8	178 aa		11.93	□□□□□ -0.5
MRPL28-203	ENST00000429738	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		11.93	□□□□□ -0.5
MRPL28-203	ENST00000429738	PARL	Q9H300	379 aa		11.93	□□□□□ -0.5
MRPL28-203	ENST00000429738	IL36B	Q9NZH7	164 aa		11.93	□□□□□ -0.5
MRPL28-203	ENST00000429738		A8MWV9	139 aa		11.92	□□□□□ -0.5
MRPL28-203	ENST00000429738	SMLR1	H3BR10	107 aa		11.92	□□□□□ -0.5
MRPL28-203	ENST00000429738	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
MRPL28-203	ENST00000429738	ASIP	P42127	132 aa		11.92	□□□□□ -0.5
MRPL28-203	ENST00000429738	FHIT	P49789	147 aa		11.92	□□□□□ -0.5
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF345	Q14585	488 aa		11.92	□□□□□ -0.5
MRPL28-203	ENST00000429738	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		11.92	□□□□□ -0.5
MRPL28-203	ENST00000429738	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		11.92	□□□□□ -0.5
MRPL28-203	ENST00000429738	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		11.92	□□□□□ -0.5
MRPL28-203	ENST00000429738	BOLA1	Q9Y3E2	137 aa		11.92	□□□□□ -0.5
MRPL28-203	ENST00000429738	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		11.91	□□□□□ -0.5
MRPL28-203	ENST00000429738	LINC00694	P0DN24	101 aa		11.91	□□□□□ -0.5
MRPL28-203	ENST00000429738	LELP1	Q5T871	98 aa		11.91	□□□□□ -0.5
MRPL28-203	ENST00000429738		Q6ZSN1	163 aa		11.91	□□□□□ -0.5
MRPL28-203	ENST00000429738	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		11.91	□□□□□ -0.5
MRPL28-203	ENST00000429738	FMC1	Q96HJ9	113 aa		11.91	□□□□□ -0.5
MRPL28-203	ENST00000429738	TCEAL7	Q9BRU2	100 aa		11.91	□□□□□ -0.5
MRPL28-203	ENST00000429738	GTSF1L	Q9H1H1	148 aa		11.91	□□□□□ -0.5
MRPL28-203	ENST00000429738	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		11.9	□□□□□ -0.5
MRPL28-203	ENST00000429738	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		11.9	□□□□□ -0.5
MRPL28-203	ENST00000429738		B4DEV8	164 aa		11.9	□□□□□ -0.5
MRPL28-203	ENST00000429738	KRBOX1	C9JBD0	128 aa		11.9	□□□□□ -0.5
MRPL28-203	ENST00000429738	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		11.9	□□□□□ -0.5
MRPL28-203	ENST00000429738	LTA	P01374	205 aa		11.89	□□□□□ -0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	KRTAP10-1	P60331	282 aa		11.89	□□□□□ -0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF674	Q2M3X9	581 aa		11.89	□□□□□ -0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		11.89	□□□□□ -0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	DMRTA1	Q5VZB9	504 aa		11.89	□□□□□ -0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	JPT2	Q9H910	190 aa		11.89	□□□□□ -0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	HMSD	A8MTL9	139 aa		11.88	□□□□□ -0.51
MRPL28-203	ENST00000429738		H3BVH4	76 aa		11.88	□□□□□ -0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	SH2D1A	O60880	128 aa		11.88	□□□□□ -0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	SEC11B	P0C7V7	166 aa		11.88	□□□□□ -0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	UBE2G1	P62253	170 aa		11.88	□□□□□ -0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	LGALSL	Q3ZCW2	172 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		11.88	□□□□□ -0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	STOML3	Q8TAV4	291 aa		11.88	□□□□□ -0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		11.88	□□□□□ -0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		11.87	□□□□□ -0.51
MRPL28-203	ENST00000429738		M0R036	132 aa		11.87	□□□□□ -0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	ARMS2	P0C7Q2	107 aa		11.87	□□□□□ -0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	LINC01559	Q495D7	138 aa		11.87	□□□□□ -0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		11.87	□□□□□ -0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		11.87	□□□□□ -0.51
MRPL28-203	ENST00000429738		Q9UF83	564 aa		11.87	□□□□□ -0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	CST9LP1	Q5W188	147 aa		11.86	□□□□□ -0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	GRIFIN	A4D1Z8	144 aa		11.85	□□□□□ -0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	GAGE12J	A6NER3	117 aa		11.85	□□□□□ -0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	UMAD1	C9J7I0	102 aa		11.85	□□□□□ -0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	RHOD	O00212	210 aa		11.85	□□□□□ -0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	PAGE4	O60829	102 aa		11.85	□□□□□ -0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	11.85	□□□□□ -0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	GAGE1	Q13065	139 aa		11.85	□□□□□ -0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	GAGE4	Q13068	117 aa		11.85	□□□□□ -0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	GAGE5	Q13069	117 aa		11.85	□□□□□ -0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	GAGE13	Q4V321	117 aa		11.85	□□□□□ -0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	11.85	□□□□□ -0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	SYT8	Q8NBV8	401 aa		11.85	□□□□□ -0.51

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