RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 F8VRH5 84 aa2.7□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 IGLV1-40P01703 118 aa2.7□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 C8orf86Q6ZUL3 223 aa2.7□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 CARD19Q96LW7 228 aa2.7□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 TENM2Q9NT68 2774 aa2.7□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa2.7□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 TRBV12-3P01733 135 aa2.7□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 Q8N1Y9 231 aa2.7□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 MGAM2Q2M2H8 2515 aa2.7□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A0J9YY99 117 aa2.7□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 M0R381 172 aa2.7□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP2.7□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 ETDBQ3ZM63 59 aa2.7□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 OR4C5Q8NGB2 326 aa2.7□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa2.7□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa2.7□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 SPRY2O43597 315 aa2.7□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 GNG7O60262 68 aa2.7□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 C5orf56Q8N8D9 126 aa2.7□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 OR8A1Q8NGG7 326 aa2.7□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM8BA6NDV4 472 aa2.7□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 UBE2E1P51965 193 aa2.7□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 RIPPLY3P57055 190 aa2.7□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 WFDC3Q8IUB2 231 aa2.7□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNRF2Q8NHG8 242 aa2.7□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 PLEKHB2Q96CS7 222 aa2.7□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 TRAV40A0A0B4J280 105 aa2.7□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 TM4SF20Q53R12 229 aa2.7□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 FA2HQ7L5A8 372 aa2.7□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP2.7□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 TOMM6Q96B49 74 aa2.7□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 HIF1ANQ9NWT6 349 aa2.7□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 GAGE10A6NGK3 116 aa2.69□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 MED14OSP0DP75 135 aa2.69□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 C12orf74Q32Q52 190 aa2.69□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 DCANP1Q8TF63 244 aa2.69□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC50A1Q9BRV3 221 aa2.69□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 EDA2RQ9HAV5 297 aa2.69□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 SPCS1Q9Y6A9 102 aa2.69□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa2.69□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 CD3EP07766 207 aa2.69□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 EDN2P20800 178 aa2.69□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 CKS2P33552 79 aa2.69□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 Q6ZS46 218 aa2.69□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 SIGMAR1Q99720 223 aa2.69□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 C20orf78Q9BR46 151 aa2.69□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC25A16P16260 332 aa2.69□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 Q9UF83 564 aa2.69□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 C22orf24Q9Y442 160 aa2.69□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 C11orf86A6NJI1 115 aa2.69□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 ELANEP08246 267 aa2.69□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 LEPP41159 167 aa2.69□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 SDIM1Q6ZPB5 146 aa2.69□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 C9orf85Q96MD7 179 aa2.69□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 BMI1P35226 326 aa2.69□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 GTSCR1Q86UQ5 136 aa2.69□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 ENSAO43768 121 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 AVPP01185 164 aa2.69□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 SH2D6Q7Z4S9 175 aa2.69□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 A6NDN8 102 aa2.69□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 UQCRFS1P47985 274 aa2.69□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 SAMD5Q5TGI4 173 aa2.69□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 CEND1Q8N111 149 aa2.69□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 GOSR1O95249 250 aa2.68□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 SAA4P35542 130 aa2.68□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP2.68□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa2.68□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa2.68□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 COTL1Q14019 142 aa2.68□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF876PQ49A33 203 aa2.68□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa2.68□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 C2orf66Q6UXQ4 117 aa2.68□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 KLK15Q9H2R5 256 aa2.68□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM90A27PA6NNH2 459 aa2.68□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 H3BMG7 143 aa2.68□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 IGHV3-23P01764 117 aa2.68□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 IGKCP01834 107 aa2.68□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP2.68□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 C10orf126Q8N4M7 172 aa2.68□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 MRAP2Q96G30 205 aa2.68□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 JPT2Q9H910 190 aa2.68□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 DYNLRB1Q9NP97 96 aa2.68□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa2.68□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 DPM2O94777 84 aa2.68□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 IGHV3-30P01768 117 aa2.68□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa2.68□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 RAB9AP51151 201 aa2.68□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 C9orf139Q6ZV77 190 aa2.68□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP2.68□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 FSHBP01225 129 aa2.68□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 IGHV4-39P01824 125 aa2.68□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 XGP55808 180 aa2.68□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 ZFP2Q6ZN57 461 aa2.68□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC25A29Q8N8R3 303 aa2.68□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.7 ms