RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 PRSS29PA6NIE9 313 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRJ-201ENST00000418331 F8WEM9 126 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRJ-201ENST00000418331 K7EMI3 77 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRJ-201ENST00000418331 NXPH4O95158 308 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRJ-201ENST00000418331 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM131Q92545 1883 aa16.61■□□□□ 0.25
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PTPRJ-201ENST00000418331 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
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PTPRJ-201ENST00000418331 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
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PTPRJ-201ENST00000418331 SUMO4Q6EEV6 95 aa16.54■□□□□ 0.24
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PTPRJ-201ENST00000418331 FANCD2OSQ96PS1 177 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRJ-201ENST00000418331 GTSF1Q8WW33 167 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRJ-201ENST00000418331 C9orf66Q5T8R8 295 aa16.53■□□□□ 0.24
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PTPRJ-201ENST00000418331 SPANXA1Q9NS26 97 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRJ-201ENST00000418331 K7EP34 96 aa16.5■□□□□ 0.23
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PTPRJ-201ENST00000418331 PCNX3Q9H6A9 2034 aa16.49■□□□□ 0.23
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PTPRJ-201ENST00000418331 SOCS3O14543 225 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRJ-201ENST00000418331 BRWD1-AS2P59051 145 aa16.49■□□□□ 0.23
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PTPRJ-201ENST00000418331 C16orf74Q96GX8 76 aa16.49■□□□□ 0.23
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PTPRJ-201ENST00000418331 ZFP2Q6ZN57 461 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRJ-201ENST00000418331 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa16.47■□□□□ 0.23
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PTPRJ-201ENST00000418331 Q6ZQT7 251 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRJ-201ENST00000418331 LURAP1LQ8IV03 231 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRJ-201ENST00000418331 C12orf74Q32Q52 190 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRJ-201ENST00000418331 Q9H8V8 135 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRJ-201ENST00000418331 MED12LQ86YW9 2145 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRJ-201ENST00000418331 ZMAT4Q9H898 229 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRJ-201ENST00000418331 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa16.45■□□□□ 0.22
PTPRJ-201ENST00000418331 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa16.45■□□□□ 0.22
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