RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 KLK15Q9H2R5 256 aa14.19□□□□□ -0.14
SH3BP1-202ENST00000417536 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa14.19□□□□□ -0.14
SH3BP1-202ENST00000417536 PRSS47A8MTI9 375 aa14.19□□□□□ -0.14
SH3BP1-202ENST00000417536 C9orf139Q6ZV77 190 aa14.19□□□□□ -0.14
SH3BP1-202ENST00000417536 MOB4Q9Y3A3 225 aa14.19□□□□□ -0.14
SH3BP1-202ENST00000417536 FABP2P12104 132 aa14.18□□□□□ -0.14
SH3BP1-202ENST00000417536 COTL1Q14019 142 aa14.18□□□□□ -0.14
SH3BP1-202ENST00000417536 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa14.18□□□□□ -0.14
SH3BP1-202ENST00000417536 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
SH3BP1-202ENST00000417536 NF1P21359 2839 aa14.17□□□□□ -0.14
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A087WX48 190 aa14.17□□□□□ -0.14
SH3BP1-202ENST00000417536 GPHB5Q86YW7 130 aa14.17□□□□□ -0.14
SH3BP1-202ENST00000417536 SMIM2Q9BVW6 85 aa14.17□□□□□ -0.14
SH3BP1-202ENST00000417536 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa14.16□□□□□ -0.14
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM223BA6NKX1 122 aa14.16□□□□□ -0.14
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SH3BP1-202ENST00000417536 FAM223AQ8IWN6 122 aa14.16□□□□□ -0.14
SH3BP1-202ENST00000417536 AVPP01185 164 aa14.16□□□□□ -0.14
SH3BP1-202ENST00000417536 RPL11P62913 178 aaKnown RBP14.16□□□□□ -0.14
SH3BP1-202ENST00000417536 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP14.16□□□□□ -0.14
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SH3BP1-202ENST00000417536 CEND1Q8N111 149 aa14.16□□□□□ -0.14
SH3BP1-202ENST00000417536 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa14.16□□□□□ -0.14
SH3BP1-202ENST00000417536 MRAP2Q96G30 205 aa14.16□□□□□ -0.14
SH3BP1-202ENST00000417536 MTORP42345 2549 aa14.15□□□□□ -0.14
SH3BP1-202ENST00000417536 IGHV3-11P01762 117 aa14.15□□□□□ -0.14
SH3BP1-202ENST00000417536 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP14.15□□□□□ -0.14
SH3BP1-202ENST00000417536 OR5A1Q8NGJ0 315 aa14.15□□□□□ -0.14
SH3BP1-202ENST00000417536 OR10J6PQ8NGY7 276 aa14.15□□□□□ -0.14
SH3BP1-202ENST00000417536 SPOCK3Q9BQ16 436 aa14.15□□□□□ -0.14
SH3BP1-202ENST00000417536 C19orf54Q5BKX5 351 aa14.15□□□□□ -0.14
SH3BP1-202ENST00000417536 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP14.15□□□□□ -0.14
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SH3BP1-202ENST00000417536 LINC00477Q96M19 166 aa14.14□□□□□ -0.15
SH3BP1-202ENST00000417536 AGRNO00468 2067 aa14.14□□□□□ -0.15
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SH3BP1-202ENST00000417536 LENEPQ9Y5L5 61 aa14.14□□□□□ -0.15
SH3BP1-202ENST00000417536 TRAV21A0A0B4J279 112 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP1-202ENST00000417536 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP1-202ENST00000417536 MGPP08493 103 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP1-202ENST00000417536 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP14.13□□□□□ -0.15
SH3BP1-202ENST00000417536 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP1-202ENST00000417536 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP14.13□□□□□ -0.15
SH3BP1-202ENST00000417536 TM2D2Q9BX73 214 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP1-202ENST00000417536 PLNP26678 52 aa14.12□□□□□ -0.15
SH3BP1-202ENST00000417536 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP14.12□□□□□ -0.15
SH3BP1-202ENST00000417536 SCGB3A1Q96QR1 104 aa14.12□□□□□ -0.15
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SH3BP1-202ENST00000417536 SORL1Q92673 2214 aa14.12□□□□□ -0.15
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SH3BP1-202ENST00000417536 NEGR1Q7Z3B1 354 aa14.12□□□□□ -0.15
SH3BP1-202ENST00000417536 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa14.12□□□□□ -0.15
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SH3BP1-202ENST00000417536 IGHV1-69P01742 117 aa14.11□□□□□ -0.15
SH3BP1-202ENST00000417536 LCNL1Q6ZST4 164 aa14.11□□□□□ -0.15
SH3BP1-202ENST00000417536 DPH3P1Q9H4G8 78 aa14.11□□□□□ -0.15
SH3BP1-202ENST00000417536 RNF223E7ERA6 249 aa14.11□□□□□ -0.15
SH3BP1-202ENST00000417536 SOCS3O14543 225 aa14.11□□□□□ -0.15
SH3BP1-202ENST00000417536 OVOL1O14753 267 aa14.11□□□□□ -0.15
SH3BP1-202ENST00000417536 GNRH2O43555 120 aa14.11□□□□□ -0.15
SH3BP1-202ENST00000417536 ORMDL2Q53FV1 153 aa14.11□□□□□ -0.15
SH3BP1-202ENST00000417536 ATP6V0BQ99437 205 aa14.11□□□□□ -0.15
SH3BP1-202ENST00000417536 CSTL1Q9H114 145 aa14.11□□□□□ -0.15
SH3BP1-202ENST00000417536 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
SH3BP1-202ENST00000417536 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa14.1□□□□□ -0.15
SH3BP1-202ENST00000417536 TOMM6Q96B49 74 aa14.09□□□□□ -0.15
SH3BP1-202ENST00000417536 HIST1H4GQ99525 98 aa14.09□□□□□ -0.15
SH3BP1-202ENST00000417536 NOTCH3Q9UM47 2321 aa14.09□□□□□ -0.15
SH3BP1-202ENST00000417536 MSMBP08118 114 aa14.09□□□□□ -0.15
SH3BP1-202ENST00000417536 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP14.09□□□□□ -0.15
SH3BP1-202ENST00000417536 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa14.08□□□□□ -0.15
SH3BP1-202ENST00000417536 PF4V1P10720 104 aa14.08□□□□□ -0.15
SH3BP1-202ENST00000417536 SRD5A1P18405 259 aa14.08□□□□□ -0.16
SH3BP1-202ENST00000417536 CR1P17927 2039 aa14.08□□□□□ -0.16
SH3BP1-202ENST00000417536 C20orf78Q9BR46 151 aa14.08□□□□□ -0.16
SH3BP1-202ENST00000417536 OR11H12B2RN74 326 aa14.07□□□□□ -0.16
SH3BP1-202ENST00000417536 RPL24P83731 157 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
SH3BP1-202ENST00000417536 C2orf66Q6UXQ4 117 aa14.07□□□□□ -0.16
SH3BP1-202ENST00000417536 OR11H1Q8NG94 326 aa14.07□□□□□ -0.16
SH3BP1-202ENST00000417536 OR11H2Q8NH07 326 aa14.07□□□□□ -0.16
SH3BP1-202ENST00000417536 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa14.07□□□□□ -0.16
SH3BP1-202ENST00000417536 IGLL5B9A064 214 aa14.06□□□□□ -0.16
SH3BP1-202ENST00000417536 Q6ZS46 218 aa14.06□□□□□ -0.16
SH3BP1-202ENST00000417536 H3BUX3 64 aa14.06□□□□□ -0.16
SH3BP1-202ENST00000417536 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP14.06□□□□□ -0.16
SH3BP1-202ENST00000417536 BLCAPP62952 87 aa14.06□□□□□ -0.16
SH3BP1-202ENST00000417536 C12orf74Q32Q52 190 aa14.06□□□□□ -0.16
SH3BP1-202ENST00000417536 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa14.06□□□□□ -0.16
SH3BP1-202ENST00000417536 BAALCQ8WXS3 180 aa14.05□□□□□ -0.16
SH3BP1-202ENST00000417536 TGFAP01135 160 aa14.05□□□□□ -0.16
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC25A16P16260 332 aa14.05□□□□□ -0.16
SH3BP1-202ENST00000417536 TAL2Q16559 108 aa14.05□□□□□ -0.16
SH3BP1-202ENST00000417536 WFDC12Q8WWY7 111 aa14.05□□□□□ -0.16
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF479Q96JC4 524 aa14.05□□□□□ -0.16
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