RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403084.1

CLDN5-201, Transcript of claudin 5, humanhuman

BASIC

Gene CLDN5, Length 2,357 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN5-201ENST00000403084 IGFL3Q6UXB1 125 aa16.58■□□□□ 0.24
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CLDN5-201ENST00000403084 FAM231AP0DMU4 169 aa16.57■□□□□ 0.24
CLDN5-201ENST00000403084 FAM231CP0DMU5 169 aa16.57■□□□□ 0.24
CLDN5-201ENST00000403084 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
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CLDN5-201ENST00000403084 IGIPA6NJ69 53 aa16.57■□□□□ 0.24
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CLDN5-201ENST00000403084 Q8N6K4 173 aa16.56■□□□□ 0.24
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CLDN5-201ENST00000403084 C15orf32Q32M92 178 aa16.54■□□□□ 0.24
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CLDN5-201ENST00000403084 POM121L12Q8N7R1 296 aa16.54■□□□□ 0.24
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CLDN5-201ENST00000403084 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa16.53■□□□□ 0.24
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CLDN5-201ENST00000403084 KLK9Q9UKQ9 250 aa16.53■□□□□ 0.24
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CLDN5-201ENST00000403084 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa16.52■□□□□ 0.24
CLDN5-201ENST00000403084 J3QQQ9 107 aa16.52■□□□□ 0.24
CLDN5-201ENST00000403084 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa16.52■□□□□ 0.24
CLDN5-201ENST00000403084 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa16.52■□□□□ 0.24
CLDN5-201ENST00000403084 B9A039 149 aa16.52■□□□□ 0.23
CLDN5-201ENST00000403084 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.23
CLDN5-201ENST00000403084 ATXN8Q156A1 80 aa16.51■□□□□ 0.23
CLDN5-201ENST00000403084 TMEM170BQ5T4T1 132 aa16.51■□□□□ 0.23
CLDN5-201ENST00000403084 TIMM17AQ99595 171 aa16.51■□□□□ 0.23
CLDN5-201ENST00000403084 ASPMQ8IZT6 3477 aa16.51■□□□□ 0.23
CLDN5-201ENST00000403084 S100A4P26447 101 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
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CLDN5-201ENST00000403084 EBI3Q14213 229 aa16.5■□□□□ 0.23
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CLDN5-201ENST00000403084 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
CLDN5-201ENST00000403084 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa16.5■□□□□ 0.23
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CLDN5-201ENST00000403084 ZNF876PQ49A33 203 aa16.5■□□□□ 0.23
CLDN5-201ENST00000403084 U3KQE9 123 aa16.5■□□□□ 0.23
CLDN5-201ENST00000403084 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
CLDN5-201ENST00000403084 METTL26Q96S19 204 aa16.49■□□□□ 0.23
CLDN5-201ENST00000403084 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
CLDN5-201ENST00000403084 SMIM20Q8N5G0 67 aa16.49■□□□□ 0.23
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CLDN5-201ENST00000403084 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa16.48■□□□□ 0.23
CLDN5-201ENST00000403084 A0A087WW49 117 aa16.48■□□□□ 0.23
CLDN5-201ENST00000403084 C15orf53Q8NAA6 179 aa16.48■□□□□ 0.23
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CLDN5-201ENST00000403084 M0R1W7 72 aa16.48■□□□□ 0.23
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CLDN5-201ENST00000403084 OR10J6PQ8NGY7 276 aa16.46■□□□□ 0.23
CLDN5-201ENST00000403084 C20orf173Q96LM9 149 aa16.46■□□□□ 0.23
CLDN5-201ENST00000403084 J3KRW8 73 aa16.46■□□□□ 0.23
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CLDN5-201ENST00000403084 CLEC19AQ6UXS0 136 aa16.46■□□□□ 0.23
CLDN5-201ENST00000403084 C9orf139Q6ZV77 190 aa16.46■□□□□ 0.23
CLDN5-201ENST00000403084 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa16.46■□□□□ 0.23
CLDN5-201ENST00000403084 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
CLDN5-201ENST00000403084 LEPROTO15243 131 aa16.45■□□□□ 0.22
CLDN5-201ENST00000403084 NXPH4O95158 308 aa16.45■□□□□ 0.22
CLDN5-201ENST00000403084 LINC00315P59091 139 aa16.45■□□□□ 0.22
CLDN5-201ENST00000403084 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
CLDN5-201ENST00000403084 SPTBN4Q9H254 2564 aa16.45■□□□□ 0.22
CLDN5-201ENST00000403084 MUSTN1Q8IVN3 82 aa16.45■□□□□ 0.22
CLDN5-201ENST00000403084 Q8N9W7 124 aa16.45■□□□□ 0.22
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