RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366554.2

OPN3-201, Transcript of opsin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene OPN3, Length 2,620 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-201ENST00000366554 LGALS9O00182 355 aa16.5■□□□□ 0.23
OPN3-201ENST00000366554 PMVKQ15126 192 aa16.5■□□□□ 0.23
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OPN3-201ENST00000366554 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa16.49■□□□□ 0.23
OPN3-201ENST00000366554 SCGB2A1O75556 95 aa16.49■□□□□ 0.23
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OPN3-201ENST00000366554 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
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OPN3-201ENST00000366554 WNK2Q9Y3S1 2297 aa16.43■□□□□ 0.22
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OPN3-201ENST00000366554 TMEM141Q96I45 108 aa16.43■□□□□ 0.22
OPN3-201ENST00000366554 CHCHD5Q9BSY4 110 aa16.43■□□□□ 0.22
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OPN3-201ENST00000366554 DPM3Q9P2X0 92 aa16.43■□□□□ 0.22
OPN3-201ENST00000366554 TIMM17AQ99595 171 aa16.42■□□□□ 0.22
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OPN3-201ENST00000366554 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
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OPN3-201ENST00000366554 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa16.41■□□□□ 0.22
OPN3-201ENST00000366554 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa16.41■□□□□ 0.22
OPN3-201ENST00000366554 TRIAP1O43715 76 aa16.41■□□□□ 0.22
OPN3-201ENST00000366554 POM121L12Q8N7R1 296 aa16.41■□□□□ 0.22
OPN3-201ENST00000366554 YAE1D1Q9NRH1 226 aa16.41■□□□□ 0.22
OPN3-201ENST00000366554 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa16.41■□□□□ 0.22
OPN3-201ENST00000366554 GPR179Q6PRD1 2367 aa16.4■□□□□ 0.22
OPN3-201ENST00000366554 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa16.4■□□□□ 0.22
OPN3-201ENST00000366554 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
OPN3-201ENST00000366554 C2orf82Q6UX34 121 aa16.4■□□□□ 0.22
OPN3-201ENST00000366554 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa16.4■□□□□ 0.22
OPN3-201ENST00000366554 DYNLRB1Q9NP97 96 aa16.4■□□□□ 0.22
OPN3-201ENST00000366554 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa16.39■□□□□ 0.21
OPN3-201ENST00000366554 S100A4P26447 101 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
OPN3-201ENST00000366554 LENEPQ9Y5L5 61 aa16.39■□□□□ 0.21
OPN3-201ENST00000366554 H7C423 109 aa16.39■□□□□ 0.21
OPN3-201ENST00000366554 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
OPN3-201ENST00000366554 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa16.38■□□□□ 0.21
OPN3-201ENST00000366554 A0A087WW49 117 aa16.38■□□□□ 0.21
OPN3-201ENST00000366554 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
OPN3-201ENST00000366554 ZNF56Q15929 161 aa16.38■□□□□ 0.21
OPN3-201ENST00000366554 C3orf56Q8N813 242 aa16.38■□□□□ 0.21
OPN3-201ENST00000366554 LEPROTO15243 131 aa16.38■□□□□ 0.21
OPN3-201ENST00000366554 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa16.38■□□□□ 0.21
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OPN3-201ENST00000366554 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa16.37■□□□□ 0.21
OPN3-201ENST00000366554 LINC00315P59091 139 aa16.37■□□□□ 0.21
OPN3-201ENST00000366554 DEFB121Q5J5C9 76 aa16.37■□□□□ 0.21
OPN3-201ENST00000366554 TMEM223A0PJW6 202 aa16.36■□□□□ 0.21
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OPN3-201ENST00000366554 C15orf32Q32M92 178 aa16.36■□□□□ 0.21
OPN3-201ENST00000366554 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa16.36■□□□□ 0.21
OPN3-201ENST00000366554 J3KRW8 73 aa16.36■□□□□ 0.21
OPN3-201ENST00000366554 MED14OSP0DP75 135 aa16.36■□□□□ 0.21
OPN3-201ENST00000366554 M0R2P5 195 aa16.35■□□□□ 0.21
OPN3-201ENST00000366554 EBI3Q14213 229 aa16.35■□□□□ 0.21
OPN3-201ENST00000366554 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa16.35■□□□□ 0.21
OPN3-201ENST00000366554 TRAV21A0A0B4J279 112 aa16.35■□□□□ 0.21
OPN3-201ENST00000366554 ID1P41134 155 aa16.35■□□□□ 0.21
OPN3-201ENST00000366554 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa16.34■□□□□ 0.21
OPN3-201ENST00000366554 LYNX1G3V0Z9 82 aa16.34■□□□□ 0.21
OPN3-201ENST00000366554 LYNX1P0DP58 116 aa16.34■□□□□ 0.21
OPN3-201ENST00000366554 LY6DQ14210 128 aa16.34■□□□□ 0.21
OPN3-201ENST00000366554 POLEQ07864 2286 aa16.34■□□□□ 0.21
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