RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361441.4

APOBEC3C-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3C, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC3C, Length 2,818 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3C-201ENST00000361441 DEFB109BQ30KR1 87 aa8.35□□□□□ -1.07
APOBEC3C-201ENST00000361441 J3QQQ9 107 aa8.34□□□□□ -1.07
APOBEC3C-201ENST00000361441 HLA-DMBP28068 263 aa8.34□□□□□ -1.07
APOBEC3C-201ENST00000361441 TMEM258P61165 79 aa8.34□□□□□ -1.07
APOBEC3C-201ENST00000361441 GAFA1Q96PS6 74 aa8.34□□□□□ -1.07
APOBEC3C-201ENST00000361441 SLC25A15Q9Y619 301 aa8.34□□□□□ -1.07
APOBEC3C-201ENST00000361441 DCHS2Q6V1P9 2916 aa8.34□□□□□ -1.07
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGLV1-44P01699 117 aa8.34□□□□□ -1.07
APOBEC3C-201ENST00000361441 CGB3P0DN86 165 aa8.34□□□□□ -1.07
APOBEC3C-201ENST00000361441 CGB7P0DN87 165 aa8.34□□□□□ -1.07
APOBEC3C-201ENST00000361441 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
APOBEC3C-201ENST00000361441 Q1RN00 199 aa8.34□□□□□ -1.07
APOBEC3C-201ENST00000361441 C6orf226Q5I0X4 101 aa8.34□□□□□ -1.07
APOBEC3C-201ENST00000361441 TMEM170BQ5T4T1 132 aa8.34□□□□□ -1.07
APOBEC3C-201ENST00000361441 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa8.34□□□□□ -1.07
APOBEC3C-201ENST00000361441 Q9H3A6 140 aa8.34□□□□□ -1.07
APOBEC3C-201ENST00000361441 SPANXCQ9NY87 97 aa8.34□□□□□ -1.07
APOBEC3C-201ENST00000361441 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
APOBEC3C-201ENST00000361441 PLNP26678 52 aa8.33□□□□□ -1.08
APOBEC3C-201ENST00000361441 WT1-ASQ06250 92 aa8.33□□□□□ -1.08
APOBEC3C-201ENST00000361441 CD69Q07108 199 aa8.33□□□□□ -1.08
APOBEC3C-201ENST00000361441 IMUPQ9GZP8 106 aa8.33□□□□□ -1.08
APOBEC3C-201ENST00000361441 ATXN8Q156A1 80 aa8.33□□□□□ -1.08
APOBEC3C-201ENST00000361441 C8orf31Q8N9H6 132 aa8.33□□□□□ -1.08
APOBEC3C-201ENST00000361441 IL17DQ8TAD2 202 aa8.33□□□□□ -1.08
APOBEC3C-201ENST00000361441 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
APOBEC3C-201ENST00000361441 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
APOBEC3C-201ENST00000361441 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa8.32□□□□□ -1.08
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGHV1-46P01743 117 aa8.32□□□□□ -1.08
APOBEC3C-201ENST00000361441 Q8N8P6 123 aa8.32□□□□□ -1.08
APOBEC3C-201ENST00000361441 WFDC11Q8NEX6 87 aa8.32□□□□□ -1.08
APOBEC3C-201ENST00000361441 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
APOBEC3C-201ENST00000361441 RNF7Q9UBF6 113 aa8.32□□□□□ -1.08
APOBEC3C-201ENST00000361441 C1orf195Q5TG92 126 aa8.31□□□□□ -1.08
APOBEC3C-201ENST00000361441 Q6ZS46 218 aa8.31□□□□□ -1.08
APOBEC3C-201ENST00000361441 CRIP1P50238 77 aa8.31□□□□□ -1.08
APOBEC3C-201ENST00000361441 SMCR5Q8TEV8 140 aa8.31□□□□□ -1.08
APOBEC3C-201ENST00000361441 KLK15Q9H2R5 256 aa8.31□□□□□ -1.08
APOBEC3C-201ENST00000361441 APC2O95996 2303 aa8.31□□□□□ -1.08
APOBEC3C-201ENST00000361441 ACACAQ13085 2346 aa8.31□□□□□ -1.08
APOBEC3C-201ENST00000361441 NBASA2RRP1 2371 aa8.31□□□□□ -1.08
APOBEC3C-201ENST00000361441 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa8.3□□□□□ -1.08
APOBEC3C-201ENST00000361441 CGB1A6NKQ9 187 aa8.3□□□□□ -1.08
APOBEC3C-201ENST00000361441 SPRY2O43597 315 aa8.3□□□□□ -1.08
APOBEC3C-201ENST00000361441 LHBP01229 141 aa8.3□□□□□ -1.08
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGLV2-11P01706 119 aa8.3□□□□□ -1.08
APOBEC3C-201ENST00000361441 DEFB123Q8N688 67 aa8.3□□□□□ -1.08
APOBEC3C-201ENST00000361441 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
APOBEC3C-201ENST00000361441 METTL26Q96S19 204 aa8.3□□□□□ -1.08
APOBEC3C-201ENST00000361441 MSRB1Q9NZV6 116 aa8.3□□□□□ -1.08
APOBEC3C-201ENST00000361441 F8VRH5 84 aa8.3□□□□□ -1.08
APOBEC3C-201ENST00000361441 FSTL3O95633 263 aa8.3□□□□□ -1.08
APOBEC3C-201ENST00000361441 LYPD2Q6UXB3 125 aa8.3□□□□□ -1.08
APOBEC3C-201ENST00000361441 DEFB124Q8NES8 71 aa8.3□□□□□ -1.08
APOBEC3C-201ENST00000361441 S4R3C0 116 aa8.3□□□□□ -1.08
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa8.3□□□□□ -1.08
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APOBEC3C-201ENST00000361441 LINC00311Q8N616 119 aa8.3□□□□□ -1.08
APOBEC3C-201ENST00000361441 CCL17Q92583 94 aa8.3□□□□□ -1.08
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNF714Q96N38 554 aa8.3□□□□□ -1.08
APOBEC3C-201ENST00000361441 DPH3P1Q9H4G8 78 aa8.3□□□□□ -1.08
APOBEC3C-201ENST00000361441 H7C1H1 209 aa8.29□□□□□ -1.08
APOBEC3C-201ENST00000361441 K7ENP7 123 aa8.29□□□□□ -1.08
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGHV3-33P01772 117 aa8.29□□□□□ -1.08
APOBEC3C-201ENST00000361441 ERHP84090 104 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
APOBEC3C-201ENST00000361441 A0A0J9YY99 117 aa8.29□□□□□ -1.08
APOBEC3C-201ENST00000361441 TMEM89A2RUT3 159 aa8.29□□□□□ -1.08
APOBEC3C-201ENST00000361441 H7C423 109 aa8.29□□□□□ -1.08
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGHV3-30P01768 117 aa8.29□□□□□ -1.08
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa8.29□□□□□ -1.08
APOBEC3C-201ENST00000361441 C9orf85Q96MD7 179 aa8.29□□□□□ -1.08
APOBEC3C-201ENST00000361441 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa8.29□□□□□ -1.08
APOBEC3C-201ENST00000361441 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa8.29□□□□□ -1.08
APOBEC3C-201ENST00000361441 MED13LQ71F56 2210 aa8.28□□□□□ -1.08
APOBEC3C-201ENST00000361441 ATP5G1P05496 136 aa8.28□□□□□ -1.08
APOBEC3C-201ENST00000361441 CDSNQ15517 529 aa8.28□□□□□ -1.08
APOBEC3C-201ENST00000361441 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa8.28□□□□□ -1.08
APOBEC3C-201ENST00000361441 FAM215AQ9Y5M1 114 aa8.28□□□□□ -1.08
APOBEC3C-201ENST00000361441 CACNA1BQ00975 2339 aa8.28□□□□□ -1.08
APOBEC3C-201ENST00000361441 BSNQ9UPA5 3926 aa8.28□□□□□ -1.08
APOBEC3C-201ENST00000361441 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
APOBEC3C-201ENST00000361441 NBL1P41271 181 aa8.27□□□□□ -1.09
APOBEC3C-201ENST00000361441 C8orf49Q96NF6 230 aa8.27□□□□□ -1.09
APOBEC3C-201ENST00000361441 NACAE9PAV3 2078 aa8.27□□□□□ -1.09
APOBEC3C-201ENST00000361441 LINC01559Q495D7 138 aa8.27□□□□□ -1.09
APOBEC3C-201ENST00000361441 C4orf48Q5BLP8 95 aa8.27□□□□□ -1.09
APOBEC3C-201ENST00000361441 TMEM200BQ69YZ2 307 aa8.27□□□□□ -1.09
APOBEC3C-201ENST00000361441 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa8.26□□□□□ -1.09
APOBEC3C-201ENST00000361441 A0A0G2JNJ9 132 aa8.26□□□□□ -1.09
APOBEC3C-201ENST00000361441 OTORQ9NRC9 128 aa8.26□□□□□ -1.09
APOBEC3C-201ENST00000361441 Q9UFV3 132 aa8.26□□□□□ -1.09
APOBEC3C-201ENST00000361441 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa8.26□□□□□ -1.09
APOBEC3C-201ENST00000361441 ABCA4P78363 2273 aa8.26□□□□□ -1.09
APOBEC3C-201ENST00000361441 P0DMU3 169 aa8.26□□□□□ -1.09
APOBEC3C-201ENST00000361441 FAM231AP0DMU4 169 aa8.26□□□□□ -1.09
APOBEC3C-201ENST00000361441 FAM231CP0DMU5 169 aa8.26□□□□□ -1.09
APOBEC3C-201ENST00000361441 COX6B1P14854 86 aa8.26□□□□□ -1.09
APOBEC3C-201ENST00000361441 LYZP61626 148 aa8.26□□□□□ -1.09
APOBEC3C-201ENST00000361441 RNF185Q96GF1 192 aa8.26□□□□□ -1.09
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