RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 CDPF1Q6NVV7 123 aa3.87□□□□□ -1.79
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PTPRD-201ENST00000355233 MLST8Q9BVC4 326 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 C1orf43Q9BWL3 253 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 J3KRW8 73 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 GP9P14770 177 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 Q6ZUT4 128 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 PTH2Q96A98 100 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
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PTPRD-201ENST00000355233 YPEL4Q96NS1 127 aa3.87□□□□□ -1.79
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PTPRD-201ENST00000355233 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa3.86□□□□□ -1.79
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PTPRD-201ENST00000355233 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP3.86□□□□□ -1.79
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PTPRD-201ENST00000355233 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
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PTPRD-201ENST00000355233 CEP250Q9BV73 2442 aa3.84□□□□□ -1.79
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PTPRD-201ENST00000355233 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa3.83□□□□□ -1.8
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PTPRD-201ENST00000355233 UBE2E2Q96LR5 201 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRD-201ENST00000355233 Q96MF0 132 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRD-201ENST00000355233 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRD-201ENST00000355233 AKAP6Q13023 2319 aa3.83□□□□□ -1.8
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