RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325558.10

PGA3-201, Transcript of pepsinogen 3, group I (pepsinogen A), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGA3, Length 1,748 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3-201ENST00000325558 PEMTQ9UBM1 199 aa8.38□□□□□ -1.07
PGA3-201ENST00000325558 ITPR2Q14571 2701 aa8.38□□□□□ -1.07
PGA3-201ENST00000325558 IGLL1P15814 213 aa8.37□□□□□ -1.07
PGA3-201ENST00000325558 RAX2Q96IS3 184 aa8.37□□□□□ -1.07
PGA3-201ENST00000325558 SORL1Q92673 2214 aa8.37□□□□□ -1.07
PGA3-201ENST00000325558 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa8.37□□□□□ -1.07
PGA3-201ENST00000325558 OR4C46A6NHA9 309 aa8.37□□□□□ -1.07
PGA3-201ENST00000325558 M0R381 172 aa8.37□□□□□ -1.07
PGA3-201ENST00000325558 SPRY2O43597 315 aa8.37□□□□□ -1.07
PGA3-201ENST00000325558 HBDP02042 147 aa8.37□□□□□ -1.07
PGA3-201ENST00000325558 FCER1GP30273 86 aa8.37□□□□□ -1.07
PGA3-201ENST00000325558 CDKN1BP46527 198 aa8.37□□□□□ -1.07
PGA3-201ENST00000325558 SMIM15Q7Z3B0 74 aa8.37□□□□□ -1.07
PGA3-201ENST00000325558 TMEM61Q8N0U2 210 aa8.37□□□□□ -1.07
PGA3-201ENST00000325558 ATOH7Q8N100 152 aa8.37□□□□□ -1.07
PGA3-201ENST00000325558 LINC01006Q8NI28 216 aa8.37□□□□□ -1.07
PGA3-201ENST00000325558 DPF1Q92782 380 aa8.37□□□□□ -1.07
PGA3-201ENST00000325558 SNHG12Q9BXW3 62 aa8.37□□□□□ -1.07
PGA3-201ENST00000325558 SONP18583 2426 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
PGA3-201ENST00000325558 CCDC168Q8NDH2 2452 aa8.37□□□□□ -1.07
PGA3-201ENST00000325558 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa8.36□□□□□ -1.07
PGA3-201ENST00000325558 TSPOP30536 169 aa8.36□□□□□ -1.07
PGA3-201ENST00000325558 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa8.36□□□□□ -1.07
PGA3-201ENST00000325558 RASL10AQ92737 203 aa8.36□□□□□ -1.07
PGA3-201ENST00000325558 DUX3Q96PT4 197 aa8.36□□□□□ -1.07
PGA3-201ENST00000325558 DPH3P1Q9H4G8 78 aa8.36□□□□□ -1.07
PGA3-201ENST00000325558 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
PGA3-201ENST00000325558 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa8.36□□□□□ -1.07
PGA3-201ENST00000325558 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PGA3-201ENST00000325558 UNC79Q9P2D8 2635 aa8.35□□□□□ -1.07
PGA3-201ENST00000325558 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PGA3-201ENST00000325558 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PGA3-201ENST00000325558 H3BMM0 161 aa8.35□□□□□ -1.07
PGA3-201ENST00000325558 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PGA3-201ENST00000325558 CD28P10747 220 aa8.35□□□□□ -1.07
PGA3-201ENST00000325558 HLA-DRB4P13762 266 aa8.35□□□□□ -1.07
PGA3-201ENST00000325558 S100A4P26447 101 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PGA3-201ENST00000325558 HILS1P60008 231 aa8.35□□□□□ -1.07
PGA3-201ENST00000325558 LGALS9BQ3B8N2 356 aa8.35□□□□□ -1.07
PGA3-201ENST00000325558 LGALS9CQ6DKI2 356 aa8.35□□□□□ -1.07
PGA3-201ENST00000325558 FAM159AQ6UWV7 190 aa8.35□□□□□ -1.07
PGA3-201ENST00000325558 LURAP1LQ8IV03 231 aa8.35□□□□□ -1.07
PGA3-201ENST00000325558 CLUHP3Q96NS8 147 aa8.35□□□□□ -1.07
PGA3-201ENST00000325558 UQCR10Q9UDW1 63 aa8.35□□□□□ -1.07
PGA3-201ENST00000325558 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa8.35□□□□□ -1.07
PGA3-201ENST00000325558 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa8.34□□□□□ -1.07
PGA3-201ENST00000325558 EREGO14944 169 aa8.34□□□□□ -1.07
PGA3-201ENST00000325558 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa8.34□□□□□ -1.07
PGA3-201ENST00000325558 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
PGA3-201ENST00000325558 C20orf78Q9BR46 151 aa8.34□□□□□ -1.07
PGA3-201ENST00000325558 ST20Q9HBF5 79 aa8.34□□□□□ -1.07
PGA3-201ENST00000325558 TRAV25A0A0B4J276 109 aa8.34□□□□□ -1.07
PGA3-201ENST00000325558 NDUFA7O95182 113 aa8.34□□□□□ -1.07
PGA3-201ENST00000325558 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PGA3-201ENST00000325558 RBMY1CP0DJD4 496 aa8.34□□□□□ -1.07
PGA3-201ENST00000325558 FXYD7P58549 80 aa8.34□□□□□ -1.07
PGA3-201ENST00000325558 RPL32P62910 135 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PGA3-201ENST00000325558 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PGA3-201ENST00000325558 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
PGA3-201ENST00000325558 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PGA3-201ENST00000325558 ZMAT4Q9H898 229 aa8.34□□□□□ -1.07
PGA3-201ENST00000325558 MDFICQ9P1T7 246 aa8.34□□□□□ -1.07
PGA3-201ENST00000325558 ACANP16112 2415 aa8.34□□□□□ -1.08
PGA3-201ENST00000325558 MYO9AB2RTY4 2548 aa8.33□□□□□ -1.08
PGA3-201ENST00000325558 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa8.33□□□□□ -1.08
PGA3-201ENST00000325558 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa8.33□□□□□ -1.08
PGA3-201ENST00000325558 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa8.33□□□□□ -1.08
PGA3-201ENST00000325558 M0R143 59 aa8.33□□□□□ -1.08
PGA3-201ENST00000325558 DEFB131AP59861 70 aa8.33□□□□□ -1.08
PGA3-201ENST00000325558 SPINK13Q1W4C9 94 aa8.33□□□□□ -1.08
PGA3-201ENST00000325558 IFI27L1Q96BM0 104 aa8.33□□□□□ -1.08
PGA3-201ENST00000325558 MAP6D1Q9H9H5 199 aa8.33□□□□□ -1.08
PGA3-201ENST00000325558 hDV102S1A0JD36 115 aa8.32□□□□□ -1.08
PGA3-201ENST00000325558 KNCNA6PVL3 124 aa8.32□□□□□ -1.08
PGA3-201ENST00000325558 K7EMI3 77 aa8.32□□□□□ -1.08
PGA3-201ENST00000325558 CCL24O00175 119 aa8.32□□□□□ -1.08
PGA3-201ENST00000325558 CD7P09564 240 aa8.32□□□□□ -1.08
PGA3-201ENST00000325558 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PGA3-201ENST00000325558 Q8N1Y9 231 aa8.32□□□□□ -1.08
PGA3-201ENST00000325558 AP1S3Q96PC3 154 aa8.32□□□□□ -1.08
PGA3-201ENST00000325558 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PGA3-201ENST00000325558 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PGA3-201ENST00000325558 LINC00467Q9BRT7 94 aa8.32□□□□□ -1.08
PGA3-201ENST00000325558 SMIM2Q9BVW6 85 aa8.32□□□□□ -1.08
PGA3-201ENST00000325558 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PGA3-201ENST00000325558 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PGA3-201ENST00000325558 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PGA3-201ENST00000325558 IGKV3-20P01619 116 aa8.32□□□□□ -1.08
PGA3-201ENST00000325558 CRYGDP07320 174 aa8.32□□□□□ -1.08
PGA3-201ENST00000325558 PROK1P58294 105 aa8.32□□□□□ -1.08
PGA3-201ENST00000325558 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PGA3-201ENST00000325558 SCGB2A2Q13296 93 aa8.32□□□□□ -1.08
PGA3-201ENST00000325558 CUBNO60494 3623 aa8.31□□□□□ -1.08
PGA3-201ENST00000325558 LAGE3Q14657 143 aa8.31□□□□□ -1.08
PGA3-201ENST00000325558 TMEM158Q8WZ71 300 aa8.31□□□□□ -1.08
PGA3-201ENST00000325558 SMR3AQ99954 134 aa8.31□□□□□ -1.08
PGA3-201ENST00000325558 JPT2Q9H910 190 aa8.31□□□□□ -1.08
PGA3-201ENST00000325558 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa8.3□□□□□ -1.08
PGA3-201ENST00000325558 PPP1R17O96001 155 aa8.3□□□□□ -1.08
PGA3-201ENST00000325558 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.7 ms