RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293845.7

CCDC42-201, Transcript of coiled-coil domain containing 42, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCDC42, Length 1,374 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42-201ENST00000293845 ARMS2P0C7Q2 107 aa9.37□□□□□ -0.91
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CCDC42-201ENST00000293845 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
CCDC42-201ENST00000293845 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
CCDC42-201ENST00000293845 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa9.36□□□□□ -0.91
CCDC42-201ENST00000293845 SNAI2O43623 268 aa9.36□□□□□ -0.91
CCDC42-201ENST00000293845 ATP5G1P05496 136 aa9.36□□□□□ -0.91
CCDC42-201ENST00000293845 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa9.36□□□□□ -0.91
CCDC42-201ENST00000293845 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
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CCDC42-201ENST00000293845 XKRY2A2RUG3 117 aa9.35□□□□□ -0.91
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CCDC42-201ENST00000293845 ZNF876PQ49A33 203 aa9.35□□□□□ -0.91
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CCDC42-201ENST00000293845 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
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CCDC42-201ENST00000293845 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa9.32□□□□□ -0.92
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CCDC42-201ENST00000293845 SEC11CQ9BY50 192 aa9.31□□□□□ -0.92
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CCDC42-201ENST00000293845 ZNF479Q96JC4 524 aa9.3□□□□□ -0.92
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CCDC42-201ENST00000293845 C10orf91Q5T1B1 145 aa9.28□□□□□ -0.92
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM88Q6PEY1 159 aa9.28□□□□□ -0.92
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CCDC42-201ENST00000293845 TENM2Q9NT68 2774 aa9.28□□□□□ -0.92
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CCDC42-201ENST00000293845 MUC21A0A140T8X8 626 aa9.26□□□□□ -0.93
CCDC42-201ENST00000293845 HIGD1CA8MV81 97 aa9.26□□□□□ -0.93
CCDC42-201ENST00000293845 PPP1R2P9O14990 202 aa9.26□□□□□ -0.93
CCDC42-201ENST00000293845 CRYGDP07320 174 aa9.26□□□□□ -0.93
CCDC42-201ENST00000293845 CRYBA4P53673 196 aa9.26□□□□□ -0.93
CCDC42-201ENST00000293845 C15orf53Q8NAA6 179 aa9.26□□□□□ -0.93
CCDC42-201ENST00000293845 VSIG2Q96IQ7 327 aa9.26□□□□□ -0.93
CCDC42-201ENST00000293845 SAMD10Q9BYL1 202 aa9.26□□□□□ -0.93
CCDC42-201ENST00000293845 HHLA3Q9XRX5 114 aa9.26□□□□□ -0.93
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