RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293683.9

PDE4A-201, Transcript of phosphodiesterase 4A, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4A, Length 2,583 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4A-201ENST00000293683 ETDBQ3ZM63 59 aa13.08□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa13.07□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 PRSS29PA6NIE9 313 aa13.07□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 EMP1P54849 157 aa13.07□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 LINC00477Q96M19 166 aa13.07□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 PRADC1Q9BSG0 188 aa13.07□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 GTSF1LQ9H1H1 148 aa13.07□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 MOB4Q9Y3A3 225 aa13.07□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 SRD5A1P18405 259 aa13.06□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 RRN3P1Q2M238 152 aa13.06□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 SPOCK3Q9BQ16 436 aa13.06□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 LENEPQ9Y5L5 61 aa13.06□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 WFDC12Q8WWY7 111 aa13.06□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 PLEKHB2Q96CS7 222 aa13.06□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 CELSR2Q9HCU4 2923 aa13.06□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 FAM223BA6NKX1 122 aa13.05□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 EDN2P20800 178 aa13.05□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 LY6EQ16553 131 aa13.05□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 FAM223AQ8IWN6 122 aa13.05□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 C20orf78Q9BR46 151 aa13.05□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 JPT2Q9H910 190 aa13.05□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 F8W1H4 67 aa13.04□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 SFTA2Q6UW10 78 aa13.04□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa13.04□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 SLC25A16P16260 332 aa13.04□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 INSL3P51460 131 aa13.04□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 ZNF815PA8K554 130 aa13.03□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 PRO0461Q9UI25 63 aa13.03□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 A0A1B0GWB2 263 aa13.03□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 OVOL1O14753 267 aa13.03□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 CRYGDP07320 174 aa13.02□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 AZU1P20160 251 aa13.02□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 SCGB2A2Q13296 93 aa13.02□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 Q6ZS46 218 aa13.02□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 FAM19A4Q96LR4 140 aa13.02□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa13.02□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 ITPR1Q14643 2758 aa13.02□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 NDUFA4O00483 81 aa13.02□□□□□ -0.33
PDE4A-201ENST00000293683 TSHBP01222 138 aa13.02□□□□□ -0.33
PDE4A-201ENST00000293683 SMAGPQ0VAQ4 97 aa13.02□□□□□ -0.33
PDE4A-201ENST00000293683 SAMD13Q5VXD3 122 aa13.02□□□□□ -0.33
PDE4A-201ENST00000293683 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
PDE4A-201ENST00000293683 SPG11Q96JI7 2443 aa13.01□□□□□ -0.33
PDE4A-201ENST00000293683 GAGE13Q4V321 117 aa13.01□□□□□ -0.33
PDE4A-201ENST00000293683 SCGB1D4Q6XE38 83 aa13.01□□□□□ -0.33
PDE4A-201ENST00000293683 RPL39P62891 51 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
PDE4A-201ENST00000293683 C11orf86A6NJI1 115 aa13□□□□□ -0.33
PDE4A-201ENST00000293683 COX6B1P14854 86 aa13□□□□□ -0.33
PDE4A-201ENST00000293683 LINC00315P59091 139 aa13□□□□□ -0.33
PDE4A-201ENST00000293683 CSMD2Q7Z408 3487 aa13□□□□□ -0.33
PDE4A-201ENST00000293683 A0A087WWL8 130 aa13□□□□□ -0.33
PDE4A-201ENST00000293683 C19orf84I3L1E1 186 aa13□□□□□ -0.33
PDE4A-201ENST00000293683 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
PDE4A-201ENST00000293683 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa13□□□□□ -0.33
PDE4A-201ENST00000293683 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa13□□□□□ -0.33
PDE4A-201ENST00000293683 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa12.99□□□□□ -0.33
PDE4A-201ENST00000293683 PF4V1P10720 104 aa12.99□□□□□ -0.33
PDE4A-201ENST00000293683 BLCAPP62952 87 aa12.99□□□□□ -0.33
PDE4A-201ENST00000293683 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
PDE4A-201ENST00000293683 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa12.99□□□□□ -0.33
PDE4A-201ENST00000293683 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP12.99□□□□□ -0.331e-6■■■■□ 22
PDE4A-201ENST00000293683 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa12.99□□□□□ -0.33
PDE4A-201ENST00000293683 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa12.99□□□□□ -0.33
PDE4A-201ENST00000293683 GAGE12HA6NDE8 117 aa12.99□□□□□ -0.33
PDE4A-201ENST00000293683 LINC01619G3V211 115 aa12.99□□□□□ -0.33
PDE4A-201ENST00000293683 IGHV1-69P01742 117 aa12.99□□□□□ -0.33
PDE4A-201ENST00000293683 LINC01549A6NIU2 74 aa12.98□□□□□ -0.33
PDE4A-201ENST00000293683 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
PDE4A-201ENST00000293683 IGHV4-39P01824 125 aa12.98□□□□□ -0.33
PDE4A-201ENST00000293683 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP12.97□□□□□ -0.33
PDE4A-201ENST00000293683 ATP6V0BQ99437 205 aa12.97□□□□□ -0.33
PDE4A-201ENST00000293683 LY6DQ14210 128 aa12.97□□□□□ -0.33
PDE4A-201ENST00000293683 SUMO4Q6EEV6 95 aa12.97□□□□□ -0.33
PDE4A-201ENST00000293683 APRG1Q8IVJ8 170 aa12.97□□□□□ -0.33
PDE4A-201ENST00000293683 SIGMAR1Q99720 223 aa12.97□□□□□ -0.33
PDE4A-201ENST00000293683 H3BUX3 64 aa12.96□□□□□ -0.33
PDE4A-201ENST00000293683 UCNP55089 124 aa12.96□□□□□ -0.33
PDE4A-201ENST00000293683 TSPEAR-AS2P59090 65 aa12.96□□□□□ -0.33
PDE4A-201ENST00000293683 APOMO95445 188 aa12.96□□□□□ -0.34
PDE4A-201ENST00000293683 MED14OSP0DP75 135 aa12.96□□□□□ -0.34
PDE4A-201ENST00000293683 ZFP2Q6ZN57 461 aa12.96□□□□□ -0.34
PDE4A-201ENST00000293683 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa12.95□□□□□ -0.34
PDE4A-201ENST00000293683 IGIPA6NJ69 53 aa12.95□□□□□ -0.34
PDE4A-201ENST00000293683 CSPG4Q6UVK1 2322 aa12.95□□□□□ -0.34
PDE4A-201ENST00000293683 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa12.95□□□□□ -0.34
PDE4A-201ENST00000293683 F5H697 171 aa12.95□□□□□ -0.34
PDE4A-201ENST00000293683 NXPH4O95158 308 aa12.95□□□□□ -0.34
PDE4A-201ENST00000293683 TSPAN13O95857 204 aa12.95□□□□□ -0.34
PDE4A-201ENST00000293683 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
PDE4A-201ENST00000293683 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa12.94□□□□□ -0.34
PDE4A-201ENST00000293683 UBE2D1P51668 147 aa12.94□□□□□ -0.34
PDE4A-201ENST00000293683 FAM74A4Q5TZK3 123 aa12.94□□□□□ -0.34
PDE4A-201ENST00000293683 ARL17AQ8IVW1 177 aa12.94□□□□□ -0.34
PDE4A-201ENST00000293683 POM121L12Q8N7R1 296 aa12.94□□□□□ -0.34
PDE4A-201ENST00000293683 SORL1Q92673 2214 aa12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 103.8 ms