RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641901.1

SAMMSON-222, survival associated mitochondrial melanoma specific oncogenic non-coding RNA, human

BASIC

Gene SAMMSON, Length 2,727 nt, Biotype lincRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SAMMSON-222	ENST00000641901	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SAMMSON-222	ENST00000641901	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SAMMSON-222	ENST00000641901		A0A096LNT2	108 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SAMMSON-222	ENST00000641901	RBAKDN	A6NC62	111 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SAMMSON-222	ENST00000641901	FAM223B	A6NKX1	122 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SAMMSON-222	ENST00000641901	NPY	P01303	97 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SAMMSON-222	ENST00000641901	CKS2	P33552	79 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SAMMSON-222	ENST00000641901	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
SAMMSON-222	ENST00000641901	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
SAMMSON-222	ENST00000641901	SMIM15	Q7Z3B0	74 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SAMMSON-222	ENST00000641901	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SAMMSON-222	ENST00000641901	ZNF747	Q9BV97	191 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SAMMSON-222	ENST00000641901	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SAMMSON-222	ENST00000641901	C20orf202	A1L168	122 aa		5.71	□□□□□ -1.49
SAMMSON-222	ENST00000641901	IGF1	P05019	195 aa		5.71	□□□□□ -1.49
SAMMSON-222	ENST00000641901	MSMB	P08118	114 aa		5.71	□□□□□ -1.49
SAMMSON-222	ENST00000641901	PET117	Q6UWS5	81 aa		5.71	□□□□□ -1.49
SAMMSON-222	ENST00000641901	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		5.71	□□□□□ -1.49
SAMMSON-222	ENST00000641901	RNF185	Q96GF1	192 aa		5.71	□□□□□ -1.49
SAMMSON-222	ENST00000641901	C16orf92	Q96LL3	132 aa		5.71	□□□□□ -1.49
SAMMSON-222	ENST00000641901	C20orf173	Q96LM9	149 aa		5.71	□□□□□ -1.49
SAMMSON-222	ENST00000641901		A6NDX4	124 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SAMMSON-222	ENST00000641901	DEFB1	P60022	68 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SAMMSON-222	ENST00000641901	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
SAMMSON-222	ENST00000641901	FOXE3	Q13461	319 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SAMMSON-222	ENST00000641901	COL5A1-AS1	Q5SY13	56 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SAMMSON-222	ENST00000641901	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SAMMSON-222	ENST00000641901	GLMP	Q8WWB7	406 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SAMMSON-222	ENST00000641901	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SAMMSON-222	ENST00000641901	IGHG2	P01859	326 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SAMMSON-222	ENST00000641901	LINC01545	Q5VT33	79 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SAMMSON-222	ENST00000641901	GPHB5	Q86YW7	130 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SAMMSON-222	ENST00000641901	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SAMMSON-222	ENST00000641901	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
SAMMSON-222	ENST00000641901	JMJD1C	Q15652	2540 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SAMMSON-222	ENST00000641901		J3KRW8	73 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SAMMSON-222	ENST00000641901	PF4V1	P10720	104 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SAMMSON-222	ENST00000641901	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
SAMMSON-222	ENST00000641901	PRR9	Q5T870	116 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SAMMSON-222	ENST00000641901	CNFN	Q9BYD5	112 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SAMMSON-222	ENST00000641901	ST20	Q9HBF5	79 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SAMMSON-222	ENST00000641901	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SAMMSON-222	ENST00000641901	TCF21	O43680	179 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SAMMSON-222	ENST00000641901	TGFA	P01135	160 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SAMMSON-222	ENST00000641901	IGHV4-31	P0DP07	118 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SAMMSON-222	ENST00000641901	EVI2A	P22794	236 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SAMMSON-222	ENST00000641901	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SAMMSON-222	ENST00000641901	CFAP161	Q6P656	301 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SAMMSON-222	ENST00000641901	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SAMMSON-222	ENST00000641901		Q6ZVH6	145 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SAMMSON-222	ENST00000641901	ZNF738	Q8NE65	137 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SAMMSON-222	ENST00000641901	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
SAMMSON-222	ENST00000641901	FN1	P02751	2386 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
SAMMSON-222	ENST00000641901	NDUFA4	O00483	81 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SAMMSON-222	ENST00000641901	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
SAMMSON-222	ENST00000641901	WFDC3	Q8IUB2	231 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SAMMSON-222	ENST00000641901	OR4X2	Q8NGF9	303 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SAMMSON-222	ENST00000641901	ATP6V0B	Q99437	205 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SAMMSON-222	ENST00000641901	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SAMMSON-222	ENST00000641901	IGHV7-4-1	A0A0J9YVY3	117 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SAMMSON-222	ENST00000641901		B4DSR2	109 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SAMMSON-222	ENST00000641901	LY6G6D	O95868	133 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SAMMSON-222	ENST00000641901	EDN2	P20800	178 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SAMMSON-222	ENST00000641901	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
SAMMSON-222	ENST00000641901	SPRY2	O43597	315 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SAMMSON-222	ENST00000641901	HBD	P02042	147 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SAMMSON-222	ENST00000641901	TCTA	P57738	103 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SAMMSON-222	ENST00000641901	TM4SF20	Q53R12	229 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SAMMSON-222	ENST00000641901	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SAMMSON-222	ENST00000641901	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SAMMSON-222	ENST00000641901	RNASE8	Q8TDE3	154 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
SAMMSON-222	ENST00000641901	DUX5	Q96PT3	197 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SAMMSON-222	ENST00000641901	YAE1D1	Q9NRH1	226 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SAMMSON-222	ENST00000641901	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SAMMSON-222	ENST00000641901		F6UB75	175 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SAMMSON-222	ENST00000641901	SOCS3	O14543	225 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SAMMSON-222	ENST00000641901	TNFRSF6B	O95407	300 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SAMMSON-222	ENST00000641901	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SAMMSON-222	ENST00000641901	MPV17L2	Q567V2	206 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SAMMSON-222	ENST00000641901	SLC25A34	Q6PIV7	304 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SAMMSON-222	ENST00000641901	USMG5	Q96IX5	58 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SAMMSON-222	ENST00000641901	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SAMMSON-222	ENST00000641901	WNK1	Q9H4A3	2382 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SAMMSON-222	ENST00000641901	SNAI2	O43623	268 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SAMMSON-222	ENST00000641901	IGLV1-40	P01703	118 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SAMMSON-222	ENST00000641901	SRD5A1	P18405	259 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SAMMSON-222	ENST00000641901	CACNG7	P62955	275 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SAMMSON-222	ENST00000641901	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SAMMSON-222	ENST00000641901	C18orf15	Q96N68	181 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SAMMSON-222	ENST00000641901	MAP1LC3A	Q9H492	121 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SAMMSON-222	ENST00000641901		H3BUA1	57 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SAMMSON-222	ENST00000641901		H3BVH4	76 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SAMMSON-222	ENST00000641901	IGHV4-59	P01825	116 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SAMMSON-222	ENST00000641901	KIR3DS1	Q14943	382 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SAMMSON-222	ENST00000641901	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SAMMSON-222	ENST00000641901	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SAMMSON-222	ENST00000641901	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SAMMSON-222	ENST00000641901	CD5L	O43866	347 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SAMMSON-222	ENST00000641901	BRI3	O95415	125 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SAMMSON-222	ENST00000641901	PPBP	P02775	128 aa		5.66	□□□□□ -1.5

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