RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638481.1

SPIN3-208, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5

Gene SPIN3, Length 2,050 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-208	ENST00000638481	MUC21	A0A0G2JKD1	596 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SPIN3-208	ENST00000638481	MUC21	A0A140T8X8	626 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SPIN3-208	ENST00000638481	TMEM89	A2RUT3	159 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SPIN3-208	ENST00000638481	COX8A	P10176	69 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SPIN3-208	ENST00000638481	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
SPIN3-208	ENST00000638481	S100A7	P31151	101 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SPIN3-208	ENST00000638481	MUC21	Q5SSG8	566 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SPIN3-208	ENST00000638481	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SPIN3-208	ENST00000638481	ASCL2	Q99929	193 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SPIN3-208	ENST00000638481	RABAC1	Q9UI14	185 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SPIN3-208	ENST00000638481	TIMM8B	Q9Y5J9	83 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
SPIN3-208	ENST00000638481	CLPSL1	A2RUU4	121 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SPIN3-208	ENST00000638481	SH2D1A	O60880	128 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SPIN3-208	ENST00000638481	FOXE3	Q13461	319 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SPIN3-208	ENST00000638481	FAM104B	Q5XKR9	115 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SPIN3-208	ENST00000638481	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SPIN3-208	ENST00000638481	INAFM1	C9JVW0	142 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SPIN3-208	ENST00000638481	PRELID3A	Q96N28	172 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SPIN3-208	ENST00000638481		D6R8Y8	96 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SPIN3-208	ENST00000638481	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
SPIN3-208	ENST00000638481	ELANE	P08246	267 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SPIN3-208	ENST00000638481	C2orf91	Q6ZV80	131 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SPIN3-208	ENST00000638481	ORMDL3	Q8N138	153 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SPIN3-208	ENST00000638481	ZNF418	Q8TF45	676 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
SPIN3-208	ENST00000638481	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
SPIN3-208	ENST00000638481	HILS1	P60008	231 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SPIN3-208	ENST00000638481	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SPIN3-208	ENST00000638481	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SPIN3-208	ENST00000638481	BMI1	P35226	326 aa		11.38	□□□□□ -0.59
SPIN3-208	ENST00000638481	IFI27	P40305	119 aa	Predicted RBP	11.38	□□□□□ -0.59
SPIN3-208	ENST00000638481	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
SPIN3-208	ENST00000638481	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		11.38	□□□□□ -0.59
SPIN3-208	ENST00000638481	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
SPIN3-208	ENST00000638481	TMSB15B	A0A087X1C1	80 aa		11.37	□□□□□ -0.59
SPIN3-208	ENST00000638481	RNF152	Q8N8N0	203 aa		11.37	□□□□□ -0.59
SPIN3-208	ENST00000638481	PRR25	Q96S07	402 aa		11.37	□□□□□ -0.59
SPIN3-208	ENST00000638481	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		11.37	□□□□□ -0.59
SPIN3-208	ENST00000638481	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	11.37	□□□□□ -0.59
SPIN3-208	ENST00000638481	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		11.37	□□□□□ -0.59
SPIN3-208	ENST00000638481	IGHV3-74	A0A0B4J1X5	117 aa		11.37	□□□□□ -0.59
SPIN3-208	ENST00000638481	TMEM213	A2RRL7	107 aa		11.37	□□□□□ -0.59
SPIN3-208	ENST00000638481	NDUFA4	O00483	81 aa		11.37	□□□□□ -0.59
SPIN3-208	ENST00000638481	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	11.37	□□□□□ -0.59
SPIN3-208	ENST00000638481	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
SPIN3-208	ENST00000638481	CST9L	Q9H4G1	147 aa		11.37	□□□□□ -0.59
SPIN3-208	ENST00000638481		A0A087X0K7	114 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SPIN3-208	ENST00000638481	IGHV3-66	A0A0C4DH42	116 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SPIN3-208	ENST00000638481	BUB3	O43684	328 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SPIN3-208	ENST00000638481	SEC11A	P67812	179 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SPIN3-208	ENST00000638481	LGALS9B	Q3B8N2	356 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SPIN3-208	ENST00000638481	LGALS9C	Q6DKI2	356 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SPIN3-208	ENST00000638481	AMN1	Q8IY45	258 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SPIN3-208	ENST00000638481	OR1N2	Q8NGR9	330 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SPIN3-208	ENST00000638481	METTL26	Q96S19	204 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SPIN3-208	ENST00000638481		A0A096LNJ9	63 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SPIN3-208	ENST00000638481	LOC389332	A0A1B0GUA5	103 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SPIN3-208	ENST00000638481	NCR2	O95944	276 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SPIN3-208	ENST00000638481	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
SPIN3-208	ENST00000638481	FGF6	P10767	208 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SPIN3-208	ENST00000638481	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
SPIN3-208	ENST00000638481	AMMECR1L	Q6DCA0	310 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SPIN3-208	ENST00000638481	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SPIN3-208	ENST00000638481	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SPIN3-208	ENST00000638481	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SPIN3-208	ENST00000638481	HBD	P02042	147 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SPIN3-208	ENST00000638481	COTL1	Q14019	142 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SPIN3-208	ENST00000638481	OCIAD2	Q56VL3	154 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SPIN3-208	ENST00000638481	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SPIN3-208	ENST00000638481	ERAS	Q7Z444	233 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SPIN3-208	ENST00000638481	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SPIN3-208	ENST00000638481	LGALS1	P09382	135 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
SPIN3-208	ENST00000638481	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SPIN3-208	ENST00000638481	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SPIN3-208	ENST00000638481	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SPIN3-208	ENST00000638481	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	11.34	□□□□□ -0.59
SPIN3-208	ENST00000638481	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SPIN3-208	ENST00000638481	CBY3	A6NI87	242 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SPIN3-208	ENST00000638481	CKS2	P33552	79 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SPIN3-208	ENST00000638481	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SPIN3-208	ENST00000638481		U3KQE9	123 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SPIN3-208	ENST00000638481	IGLC6	P0CF74	106 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SPIN3-208	ENST00000638481	TWIST1	Q15672	202 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SPIN3-208	ENST00000638481	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SPIN3-208	ENST00000638481	LINC01006	Q8NI28	216 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SPIN3-208	ENST00000638481	WNK1	Q9H4A3	2382 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SPIN3-208	ENST00000638481	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SPIN3-208	ENST00000638481		A0A087WW49	117 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SPIN3-208	ENST00000638481	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SPIN3-208	ENST00000638481	VGLL1	Q99990	258 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SPIN3-208	ENST00000638481	C7orf71	A4D174	169 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SPIN3-208	ENST00000638481	DEFB136	Q30KP8	78 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SPIN3-208	ENST00000638481	TM4SF20	Q53R12	229 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SPIN3-208	ENST00000638481	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SPIN3-208	ENST00000638481		Q8TAT8	98 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SPIN3-208	ENST00000638481	JMJD8	Q96S16	334 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SPIN3-208	ENST00000638481	C16orf95	Q9H693	158 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SPIN3-208	ENST00000638481	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
SPIN3-208	ENST00000638481	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SPIN3-208	ENST00000638481	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SPIN3-208	ENST00000638481	SIVA1	O15304	175 aa		11.31	□□□□□ -0.6

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