RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 LENEPQ9Y5L5 61 aa18.14■□□□□ 0.49
CAPNS1-217ENST00000629983 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
CAPNS1-217ENST00000629983 LAGE3Q14657 143 aa18.13■□□□□ 0.49
CAPNS1-217ENST00000629983 LELP1Q5T871 98 aa18.13■□□□□ 0.49
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC25A29Q8N8R3 303 aa18.13■□□□□ 0.49
CAPNS1-217ENST00000629983 RPH3ALQ9UNE2 315 aa18.13■□□□□ 0.49
CAPNS1-217ENST00000629983 RHOHQ15669 191 aa18.12■□□□□ 0.49
CAPNS1-217ENST00000629983 TDRG1Q3Y452 100 aa18.12■□□□□ 0.49
CAPNS1-217ENST00000629983 HYLS1Q96M11 299 aa18.12■□□□□ 0.49
CAPNS1-217ENST00000629983 ATP5SQ99766 215 aa18.12■□□□□ 0.49
CAPNS1-217ENST00000629983 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa18.12■□□□□ 0.49
CAPNS1-217ENST00000629983 TRAV6A0A075B6T7 132 aa18.11■□□□□ 0.49
CAPNS1-217ENST00000629983 DIRC3C9JPN6 131 aa18.11■□□□□ 0.49
CAPNS1-217ENST00000629983 SCXQ7RTU7 201 aa18.11■□□□□ 0.49
CAPNS1-217ENST00000629983 SDF2L1Q9HCN8 221 aa18.11■□□□□ 0.49
CAPNS1-217ENST00000629983 KCNIP2Q9NS61 270 aa18.11■□□□□ 0.49
CAPNS1-217ENST00000629983 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa18.1■□□□□ 0.49
CAPNS1-217ENST00000629983 TYMSP04818 313 aa18.1■□□□□ 0.49
CAPNS1-217ENST00000629983 IL7P13232 177 aa18.1■□□□□ 0.49
CAPNS1-217ENST00000629983 LINC01620Q4KN68 170 aa18.1■□□□□ 0.49
CAPNS1-217ENST00000629983 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
CAPNS1-217ENST00000629983 TRAV21A0A0B4J279 112 aa18.09■□□□□ 0.49
CAPNS1-217ENST00000629983 F6UZH7 168 aa18.09■□□□□ 0.49
CAPNS1-217ENST00000629983 OR5C1Q8NGR4 320 aa18.09■□□□□ 0.49
CAPNS1-217ENST00000629983 NHLH2Q02577 135 aa18.08■□□□□ 0.48
CAPNS1-217ENST00000629983 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa18.08■□□□□ 0.48
CAPNS1-217ENST00000629983 GTSF1LQ9H1H1 148 aa18.08■□□□□ 0.48
CAPNS1-217ENST00000629983 Q8N3U1 123 aa18.07■□□□□ 0.48
CAPNS1-217ENST00000629983 CMTM2Q8TAZ6 248 aa18.07■□□□□ 0.48
CAPNS1-217ENST00000629983 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
CAPNS1-217ENST00000629983 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa18.06■□□□□ 0.48
CAPNS1-217ENST00000629983 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa18.06■□□□□ 0.48
CAPNS1-217ENST00000629983 TCRBP04435 133 aa18.06■□□□□ 0.48
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF876PQ49A33 203 aa18.06■□□□□ 0.48
CAPNS1-217ENST00000629983 TMED6Q8WW62 240 aa18.06■□□□□ 0.48
CAPNS1-217ENST00000629983 KCNS1Q96KK3 526 aa18.06■□□□□ 0.48
CAPNS1-217ENST00000629983 NUDT15Q9NV35 164 aa18.06■□□□□ 0.48
CAPNS1-217ENST00000629983 RBFOX3A6NFN3 312 aa18.05■□□□□ 0.48
CAPNS1-217ENST00000629983 C17orf112F2Z3M2 114 aa18.05■□□□□ 0.48
CAPNS1-217ENST00000629983 LYRM1O43325 122 aa18.05■□□□□ 0.48
CAPNS1-217ENST00000629983 OXTP01178 125 aa18.05■□□□□ 0.48
CAPNS1-217ENST00000629983 ASB13Q8WXK3 278 aa18.05■□□□□ 0.48
CAPNS1-217ENST00000629983 BAALCQ8WXS3 180 aa18.05■□□□□ 0.48
CAPNS1-217ENST00000629983 NMES1Q9C002 83 aa18.05■□□□□ 0.48
CAPNS1-217ENST00000629983 IL15RAQ13261 267 aa18.04■□□□□ 0.48
CAPNS1-217ENST00000629983 TOR2AQ5JU69 321 aa18.04■□□□□ 0.48
CAPNS1-217ENST00000629983 CFAP126Q5VTH2 177 aa18.04■□□□□ 0.48
CAPNS1-217ENST00000629983 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa18.04■□□□□ 0.48
CAPNS1-217ENST00000629983 RS1O15537 224 aa18.03■□□□□ 0.48
CAPNS1-217ENST00000629983 KHDC3LQ587J8 217 aa18.03■□□□□ 0.48
CAPNS1-217ENST00000629983 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
CAPNS1-217ENST00000629983 TREM1Q9NP99 234 aa18.03■□□□□ 0.48
CAPNS1-217ENST00000629983 PLA2G10O15496 165 aa18.02■□□□□ 0.48
CAPNS1-217ENST00000629983 CIDEAO60543 219 aa18.02■□□□□ 0.48
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM74A1Q5RGS3 127 aa18.02■□□□□ 0.48
CAPNS1-217ENST00000629983 OTORQ9NRC9 128 aa18.02■□□□□ 0.48
CAPNS1-217ENST00000629983 PGPA6NDG6 321 aa18.01■□□□□ 0.47
CAPNS1-217ENST00000629983 TAS2R45P59539 299 aa18.01■□□□□ 0.47
CAPNS1-217ENST00000629983 DPPA3Q6W0C5 159 aa18.01■□□□□ 0.47
CAPNS1-217ENST00000629983 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
CAPNS1-217ENST00000629983 CHAC1Q9BUX1 264 aa18.01■□□□□ 0.47
CAPNS1-217ENST00000629983 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
CAPNS1-217ENST00000629983 GGTLC3B5MD39 225 aa18■□□□□ 0.47
CAPNS1-217ENST00000629983 FFAR4Q5NUL3 377 aa18■□□□□ 0.47
CAPNS1-217ENST00000629983 SH3BGRL3Q9H299 93 aa18■□□□□ 0.47
CAPNS1-217ENST00000629983 FAT3Q8TDW7 4589 aa17.99■□□□□ 0.47
CAPNS1-217ENST00000629983 COX11Q9Y6N1 276 aa17.99■□□□□ 0.47
CAPNS1-217ENST00000629983 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa17.98■□□□□ 0.47
CAPNS1-217ENST00000629983 GAGE12JA6NER3 117 aa17.98■□□□□ 0.47
CAPNS1-217ENST00000629983 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP17.98■□□□□ 0.47
CAPNS1-217ENST00000629983 H2AFB2P0C5Z0 115 aa17.98■□□□□ 0.47
CAPNS1-217ENST00000629983 MGST1P10620 155 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
CAPNS1-217ENST00000629983 GAGE1Q13065 139 aa17.98■□□□□ 0.47
CAPNS1-217ENST00000629983 GAGE4Q13068 117 aa17.98■□□□□ 0.47
CAPNS1-217ENST00000629983 GAGE5Q13069 117 aa17.98■□□□□ 0.47
CAPNS1-217ENST00000629983 ASAH1Q13510 395 aa17.98■□□□□ 0.47
CAPNS1-217ENST00000629983 GAGE13Q4V321 117 aa17.98■□□□□ 0.47
CAPNS1-217ENST00000629983 TVP23CQ96ET8 276 aa17.98■□□□□ 0.47
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
CAPNS1-217ENST00000629983 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa17.97■□□□□ 0.47
CAPNS1-217ENST00000629983 Q8N976 141 aa17.97■□□□□ 0.47
CAPNS1-217ENST00000629983 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa17.97■□□□□ 0.47
CAPNS1-217ENST00000629983 RMI2Q96E14 147 aa17.97■□□□□ 0.47
CAPNS1-217ENST00000629983 MBD2Q9UBB5 411 aa17.97■□□□□ 0.47
CAPNS1-217ENST00000629983 NDFIP1Q9BT67 221 aa17.96■□□□□ 0.47
CAPNS1-217ENST00000629983 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF506Q5JVG8 444 aa17.95■□□□□ 0.46
CAPNS1-217ENST00000629983 OR5AC2Q9NZP5 309 aa17.95■□□□□ 0.46
CAPNS1-217ENST00000629983 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa17.94■□□□□ 0.46
CAPNS1-217ENST00000629983 GNG5P63218 68 aa17.94■□□□□ 0.46
CAPNS1-217ENST00000629983 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
CAPNS1-217ENST00000629983 SGK494Q96LW2 274 aa17.94■□□□□ 0.46
CAPNS1-217ENST00000629983 PGPEP1LA6NFU8 196 aa17.93■□□□□ 0.46
CAPNS1-217ENST00000629983 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa17.93■□□□□ 0.46
CAPNS1-217ENST00000629983 SIX6O95475 246 aa17.92■□□□□ 0.46
CAPNS1-217ENST00000629983 IGLV2-8P01709 118 aa17.92■□□□□ 0.46
CAPNS1-217ENST00000629983 C9orf85Q96MD7 179 aa17.91■□□□□ 0.46
CAPNS1-217ENST00000629983 C11orf21Q9P2W6 132 aa17.91■□□□□ 0.46
CAPNS1-217ENST00000629983 SCGB1C1Q8TD33 95 aa17.9■□□□□ 0.46
CAPNS1-217ENST00000629983 RNF222A6NCQ9 220 aa17.89■□□□□ 0.45
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