RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618610.1

PTPRT-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 3,230 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM133Q9H2Q1 129 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-211ENST00000618610 ZMAT4Q9H898 229 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-211ENST00000618610 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-211ENST00000618610 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-211ENST00000618610 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-211ENST00000618610 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-211ENST00000618610 SH2D1AO60880 128 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-211ENST00000618610 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-211ENST00000618610 GLRXP35754 106 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-211ENST00000618610 EMP1P54849 157 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-211ENST00000618610 TCF15Q12870 199 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-211ENST00000618610 CDSNQ15517 529 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-211ENST00000618610 SEM1Q6ZVN7 128 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-211ENST00000618610 PPP1R27Q86WC6 154 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-211ENST00000618610 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-211ENST00000618610 CCL17Q92583 94 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-211ENST00000618610 RAXQ9Y2V3 346 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-211ENST00000618610 C9JAW5 83 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 TNFRSF6BO95407 300 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 LINC01560Q8TB33 94 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 RITA1Q96K30 269 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 CHCHD5Q9BSY4 110 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 AAMDCQ9H7C9 122 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 DKK4Q9UBT3 224 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 IGHV1-46P01743 117 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM155Q4W5P6 130 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 PLA2G2CQ5R387 149 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 RAX2Q96IS3 184 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 OTORQ9NRC9 128 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 ONECUT1Q9UBC0 465 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 HIGD1AQ9Y241 93 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 U3KQK5 164 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 MXRA5Q9NR99 2828 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 A0A1W2PPI3 338 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF493Q6ZR52 646 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 GAFA1Q96PS6 74 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 SPRY2O43597 315 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP6.38□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 LY6DQ14210 128 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM78Q5T7P6 136 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 SCNM1Q9BWG6 230 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF815PA8K554 130 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 ORM1P02763 201 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 CGB3P0DN86 165 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 CGB7P0DN87 165 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 C15orf53Q8NAA6 179 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 RASL11BQ9BPW5 248 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 SRD5A1P18405 259 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 MYOZ3Q8TDC0 251 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 RNF185Q96GF1 192 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 LHBP01229 141 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 SLC25A16P16260 332 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 IGF2-ASQ6U949 168 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 THAP8Q8NA92 274 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 OR11H6Q8NGC7 330 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 POU2AF1Q16633 256 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 TRGV9Q99603 122 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 SLC25A20O43772 301 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 HLA-DMBP28068 263 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 TAL2Q16559 108 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 PRADC1Q9BSG0 188 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 HIVEP2P31629 2446 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 ITPR2Q14571 2701 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 J3KRW8 73 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 ATP5LO75964 103 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 IGHV4-39P01824 125 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 TRGV3P03979 118 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 CD40P25942 277 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 CNTFRP26992 372 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 PIFOQ8TCI5 191 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 FCN3O75636 299 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 NBL1P41271 181 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 GATD1Q8NB37 220 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 FAM215AQ9Y5M1 114 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 LINC00694P0DN24 101 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 OR4C13Q8NGP0 309 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 TRBV19A0A075B6N1 114 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 B9A039 149 aa6.35□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms