RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613965.1

MFGE8-216, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

TSL 5

Gene MFGE8, Length 456 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-216ENST00000613965 ARL14EPLP0DKL9 152 aa6.94□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 ERVFC1-1P60608 527 aa6.94□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 SERF2P84101 59 aa6.94□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa6.94□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 TMED6Q8WW62 240 aa6.94□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 RAB24Q969Q5 203 aa6.94□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 SH3BGRL3Q9H299 93 aa6.94□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa6.94□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa6.93□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 G3V3Q6 166 aa6.93□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 K7EQD1 137 aa6.93□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 EREGO14944 169 aa6.93□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 DNAH10OSP0CZ25 163 aa6.93□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 SRIP30626 198 aa6.93□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 TMEM183BQ1AE95 376 aa6.93□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 Q6AWC8 147 aa6.93□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa6.93□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 NFE4Q86UQ8 179 aa6.93□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 WFDC10BQ8IUB3 73 aa6.93□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 TMEM183AQ8IXX5 376 aa6.93□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 ZNF479Q96JC4 524 aa6.93□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 RPH3ALQ9UNE2 315 aa6.93□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 LY96Q9Y6Y9 160 aa6.93□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa6.92□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 GCHFRP30047 84 aa6.92□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 CDPF1Q6NVV7 123 aa6.92□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 FAM159AQ6UWV7 190 aa6.92□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 IQCF2Q8IXL9 164 aa6.92□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 RASL10AQ92737 203 aa6.92□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 SPXQ9BT56 116 aa6.92□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 DNAH8Q96JB1 4490 aa6.91□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 TRGV11A0A075B6L2 103 aa6.91□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 A0A087WTM6 91 aa6.91□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa6.91□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 EPM2AB3EWF7 344 aa6.91□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 ARPC5O15511 151 aa6.91□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 CXorf1O96002 111 aa6.91□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 GYPEP15421 78 aa6.91□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 GNG5P63218 68 aa6.91□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 TDRG1Q3Y452 100 aa6.91□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 C5orf17Q8NAS9 161 aa6.91□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 SUN5Q8TC36 379 aa6.91□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 TMEM167BQ9NRX6 74 aa6.91□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 NAGKQ9UJ70 344 aa6.91□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa6.9□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 TRAV4A0A0B4J268 109 aa6.9□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 C9JCJ5 164 aa6.9□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 K7EP13 123 aa6.9□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 TAAR5O14804 337 aa6.9□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 ORM1P02763 201 aa6.9□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 EVI2AP22794 236 aa6.9□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 XGP55808 180 aa6.9□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 NDFIP1Q9BT67 221 aa6.9□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 MSRB1Q9NZV6 116 aa6.9□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 TRAV21A0A0B4J279 112 aa6.89□□□□□ -1.31
MFGE8-216ENST00000613965 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa6.89□□□□□ -1.31
MFGE8-216ENST00000613965 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa6.89□□□□□ -1.31
MFGE8-216ENST00000613965 GGTLC3B5MD39 225 aa6.89□□□□□ -1.31
MFGE8-216ENST00000613965 F6UZH7 168 aa6.89□□□□□ -1.31
MFGE8-216ENST00000613965 K7EQM0 130 aa6.89□□□□□ -1.31
MFGE8-216ENST00000613965 GNRH2O43555 120 aa6.89□□□□□ -1.31
MFGE8-216ENST00000613965 TCRAP04437 139 aa6.89□□□□□ -1.31
MFGE8-216ENST00000613965 KRTAP10-1P60331 282 aa6.89□□□□□ -1.31
MFGE8-216ENST00000613965 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa6.89□□□□□ -1.31
MFGE8-216ENST00000613965 OR4C5Q8NGB2 326 aa6.89□□□□□ -1.31
MFGE8-216ENST00000613965 TVP23CQ96ET8 276 aa6.89□□□□□ -1.31
MFGE8-216ENST00000613965 TXNDC17Q9BRA2 123 aa6.89□□□□□ -1.31
MFGE8-216ENST00000613965 TREM1Q9NP99 234 aa6.89□□□□□ -1.31
MFGE8-216ENST00000613965 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa6.88□□□□□ -1.31
MFGE8-216ENST00000613965 A0A1B0GVG6 124 aa6.88□□□□□ -1.31
MFGE8-216ENST00000613965 A0A1W2PRE2 83 aa6.88□□□□□ -1.31
MFGE8-216ENST00000613965 SMLR1H3BR10 107 aa6.88□□□□□ -1.31
MFGE8-216ENST00000613965 M0R2P5 195 aa6.88□□□□□ -1.31
MFGE8-216ENST00000613965 TYMSP04818 313 aa6.88□□□□□ -1.31
MFGE8-216ENST00000613965 CRYGDP07320 174 aa6.88□□□□□ -1.31
MFGE8-216ENST00000613965 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
MFGE8-216ENST00000613965 ZNF345Q14585 488 aa6.88□□□□□ -1.31
MFGE8-216ENST00000613965 ZNF726P1Q15940 193 aa6.88□□□□□ -1.31
MFGE8-216ENST00000613965 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa6.88□□□□□ -1.31
MFGE8-216ENST00000613965 CYTL1Q9NRR1 136 aa6.88□□□□□ -1.31
MFGE8-216ENST00000613965 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa6.87□□□□□ -1.31
MFGE8-216ENST00000613965 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
MFGE8-216ENST00000613965 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
MFGE8-216ENST00000613965 Q5VSD8 79 aa6.87□□□□□ -1.31
MFGE8-216ENST00000613965 C10orf126Q8N4M7 172 aa6.87□□□□□ -1.31
MFGE8-216ENST00000613965 KCNRGQ8N5I3 272 aa6.87□□□□□ -1.31
MFGE8-216ENST00000613965 NHLRC2Q8NBF2 726 aa6.87□□□□□ -1.31
MFGE8-216ENST00000613965 SGK494Q96LW2 274 aa6.87□□□□□ -1.31
MFGE8-216ENST00000613965 SDF2L1Q9HCN8 221 aa6.87□□□□□ -1.31
MFGE8-216ENST00000613965 EPDR1Q9UM22 224 aa6.87□□□□□ -1.31
MFGE8-216ENST00000613965 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa6.86□□□□□ -1.31
MFGE8-216ENST00000613965 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa6.86□□□□□ -1.31
MFGE8-216ENST00000613965 IGLV2-11P01706 119 aa6.86□□□□□ -1.31
MFGE8-216ENST00000613965 INAFM2P0DMQ5 153 aa6.86□□□□□ -1.31
MFGE8-216ENST00000613965 GCSHP23434 173 aa6.86□□□□□ -1.31
MFGE8-216ENST00000613965 TIRAPP58753 221 aa6.86□□□□□ -1.31
MFGE8-216ENST00000613965 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.4 ms