RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608107.1

ITGB5-211, Transcript of integrin subunit beta 5, humanhuman

TSL 3

Gene ITGB5, Length 548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB5-211ENST00000608107 C19orf71A6NCJ1 209 aa7.38□□□□□ -1.23
ITGB5-211ENST00000608107 CBY3A6NI87 242 aa7.38□□□□□ -1.23
ITGB5-211ENST00000608107 ORM1P02763 201 aa7.38□□□□□ -1.23
ITGB5-211ENST00000608107 TYMSP04818 313 aa7.38□□□□□ -1.23
ITGB5-211ENST00000608107 ADIRFQ15847 76 aa7.38□□□□□ -1.23
ITGB5-211ENST00000608107 RRN3P1Q2M238 152 aa7.38□□□□□ -1.23
ITGB5-211ENST00000608107 FAM159AQ6UWV7 190 aa7.38□□□□□ -1.23
ITGB5-211ENST00000608107 NUDT10Q8NFP7 164 aa7.38□□□□□ -1.23
ITGB5-211ENST00000608107 SMIM12Q96EX1 92 aa7.38□□□□□ -1.23
ITGB5-211ENST00000608107 NUDT11Q96G61 164 aa7.38□□□□□ -1.23
ITGB5-211ENST00000608107 NEU1Q99519 415 aa7.38□□□□□ -1.23
ITGB5-211ENST00000608107 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
ITGB5-211ENST00000608107 ZMAT4Q9H898 229 aa7.38□□□□□ -1.23
ITGB5-211ENST00000608107 NAT8Q9UHE5 227 aa7.38□□□□□ -1.23
ITGB5-211ENST00000608107 LY96Q9Y6Y9 160 aa7.38□□□□□ -1.23
ITGB5-211ENST00000608107 PLAC8L1A1L4L8 177 aa7.37□□□□□ -1.23
ITGB5-211ENST00000608107 GRIFINA4D1Z8 144 aa7.37□□□□□ -1.23
ITGB5-211ENST00000608107 KRBOX1C9JBD0 128 aa7.37□□□□□ -1.23
ITGB5-211ENST00000608107 F8W036 122 aa7.37□□□□□ -1.23
ITGB5-211ENST00000608107 EMP1P54849 157 aa7.37□□□□□ -1.23
ITGB5-211ENST00000608107 C11orf72Q8NBR9 251 aa7.37□□□□□ -1.23
ITGB5-211ENST00000608107 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
ITGB5-211ENST00000608107 LINC00467Q9BRT7 94 aa7.37□□□□□ -1.23
ITGB5-211ENST00000608107 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa7.37□□□□□ -1.23
ITGB5-211ENST00000608107 MDFICQ9P1T7 246 aa7.37□□□□□ -1.23
ITGB5-211ENST00000608107 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa7.36□□□□□ -1.23
ITGB5-211ENST00000608107 A0A0J9YWU9 116 aa7.36□□□□□ -1.23
ITGB5-211ENST00000608107 SMIM9A6NGZ8 99 aa7.36□□□□□ -1.23
ITGB5-211ENST00000608107 B4DEV8 164 aa7.36□□□□□ -1.23
ITGB5-211ENST00000608107 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
ITGB5-211ENST00000608107 GZMBP10144 247 aa7.36□□□□□ -1.23
ITGB5-211ENST00000608107 MIFP14174 115 aa7.36□□□□□ -1.23
ITGB5-211ENST00000608107 TDRG1Q3Y452 100 aa7.36□□□□□ -1.23
ITGB5-211ENST00000608107 LINC01559Q495D7 138 aa7.36□□□□□ -1.23
ITGB5-211ENST00000608107 OR2D3Q8NGH3 330 aa7.36□□□□□ -1.23
ITGB5-211ENST00000608107 ISOC2Q96AB3 205 aa7.36□□□□□ -1.23
ITGB5-211ENST00000608107 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
ITGB5-211ENST00000608107 NACAE9PAV3 2078 aa7.36□□□□□ -1.23
ITGB5-211ENST00000608107 TMEM189A5PLL7 270 aa7.35□□□□□ -1.23
ITGB5-211ENST00000608107 C10orf91Q5T1B1 145 aa7.35□□□□□ -1.23
ITGB5-211ENST00000608107 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
ITGB5-211ENST00000608107 C16orf74Q96GX8 76 aa7.35□□□□□ -1.23
ITGB5-211ENST00000608107 SEC11CQ9BY50 192 aa7.35□□□□□ -1.23
ITGB5-211ENST00000608107 BIN3Q9NQY0 253 aa7.35□□□□□ -1.23
ITGB5-211ENST00000608107 CELA1Q9UNI1 258 aa7.35□□□□□ -1.23
ITGB5-211ENST00000608107 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
ITGB5-211ENST00000608107 GATCO43716 136 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
ITGB5-211ENST00000608107 P01737 135 aa7.34□□□□□ -1.23
ITGB5-211ENST00000608107 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
ITGB5-211ENST00000608107 TCL1AP56279 114 aa7.34□□□□□ -1.23
ITGB5-211ENST00000608107 ERVFC1-1P60608 527 aa7.34□□□□□ -1.23
ITGB5-211ENST00000608107 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
ITGB5-211ENST00000608107 ZNF493Q6ZR52 646 aa7.34□□□□□ -1.23
ITGB5-211ENST00000608107 KCNS1Q96KK3 526 aa7.34□□□□□ -1.23
ITGB5-211ENST00000608107 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
ITGB5-211ENST00000608107 U3KQK5 164 aa7.34□□□□□ -1.23
ITGB5-211ENST00000608107 TRGV11A0A075B6L2 103 aa7.33□□□□□ -1.24
ITGB5-211ENST00000608107 H3BVH4 76 aa7.33□□□□□ -1.24
ITGB5-211ENST00000608107 ZNF415Q09FC8 603 aa7.33□□□□□ -1.24
ITGB5-211ENST00000608107 NDUFA5Q16718 116 aa7.33□□□□□ -1.24
ITGB5-211ENST00000608107 FAM231DQ6ZW35 169 aa7.33□□□□□ -1.24
ITGB5-211ENST00000608107 OR10G8Q8NGN5 311 aa7.33□□□□□ -1.24
ITGB5-211ENST00000608107 IL17DQ8TAD2 202 aa7.33□□□□□ -1.24
ITGB5-211ENST00000608107 SFRP2Q96HF1 295 aa7.33□□□□□ -1.24
ITGB5-211ENST00000608107 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
ITGB5-211ENST00000608107 OSTCQ9NRP0 149 aa7.33□□□□□ -1.24
ITGB5-211ENST00000608107 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
ITGB5-211ENST00000608107 V9GYV3 84 aa7.33□□□□□ -1.24
ITGB5-211ENST00000608107 TGP01266 2768 aa7.33□□□□□ -1.24
ITGB5-211ENST00000608107 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa7.32□□□□□ -1.24
ITGB5-211ENST00000608107 MUC21A0A140T8X8 626 aa7.32□□□□□ -1.24
ITGB5-211ENST00000608107 ARMS2P0C7Q2 107 aa7.32□□□□□ -1.24
ITGB5-211ENST00000608107 S100A4P26447 101 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
ITGB5-211ENST00000608107 ASIPP42127 132 aa7.32□□□□□ -1.24
ITGB5-211ENST00000608107 RNF212Q495C1 297 aa7.32□□□□□ -1.24
ITGB5-211ENST00000608107 DNLZQ5SXM8 178 aa7.32□□□□□ -1.24
ITGB5-211ENST00000608107 FAM222AQ5U5X8 452 aa7.32□□□□□ -1.24
ITGB5-211ENST00000608107 Q6ZTI0 123 aa7.32□□□□□ -1.24
ITGB5-211ENST00000608107 C9orf85Q96MD7 179 aa7.32□□□□□ -1.24
ITGB5-211ENST00000608107 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
ITGB5-211ENST00000608107 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
ITGB5-211ENST00000608107 STAB2Q8WWQ8 2551 aa7.32□□□□□ -1.24
ITGB5-211ENST00000608107 GAGE12BA1L429 117 aa7.31□□□□□ -1.24
ITGB5-211ENST00000608107 SNURFLB1AK76 121 aa7.31□□□□□ -1.24
ITGB5-211ENST00000608107 GAGE7O76087 117 aa7.31□□□□□ -1.24
ITGB5-211ENST00000608107 GAGE12FP0CL80 117 aa7.31□□□□□ -1.24
ITGB5-211ENST00000608107 GAGE12GP0CL81 117 aa7.31□□□□□ -1.24
ITGB5-211ENST00000608107 GAGE12IP0CL82 117 aa7.31□□□□□ -1.24
ITGB5-211ENST00000608107 SSTP61278 116 aa7.31□□□□□ -1.24
ITGB5-211ENST00000608107 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
ITGB5-211ENST00000608107 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
ITGB5-211ENST00000608107 C15orf54Q8N8G6 183 aa7.31□□□□□ -1.24
ITGB5-211ENST00000608107 EDA2RQ9HAV5 297 aa7.31□□□□□ -1.24
ITGB5-211ENST00000608107 DKK2Q9UBU2 259 aa7.31□□□□□ -1.24
ITGB5-211ENST00000608107 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa7.3□□□□□ -1.24
ITGB5-211ENST00000608107 APOC3P02656 99 aa7.3□□□□□ -1.24
ITGB5-211ENST00000608107 CXCL1P09341 107 aa7.3□□□□□ -1.24
ITGB5-211ENST00000608107 IGLC6P0CF74 106 aa7.3□□□□□ -1.24
ITGB5-211ENST00000608107 RPS20P60866 119 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
ITGB5-211ENST00000608107 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa7.3□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 107.6 ms