RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580828.1

SNHG25-201, Transcript of small nucleolar RNA host gene 25, humanhuman

TSL 2

Gene SNHG25, Length 106 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG25-201ENST00000580828 GGTLC3B5MD39 225 aa8.4□□□□□ -1.06
SNHG25-201ENST00000580828 M0R2P5 195 aa8.4□□□□□ -1.06
SNHG25-201ENST00000580828 ARPC5O15511 151 aa8.4□□□□□ -1.06
SNHG25-201ENST00000580828 GNRH2O43555 120 aa8.4□□□□□ -1.06
SNHG25-201ENST00000580828 IGHV3-53P01767 116 aa8.4□□□□□ -1.06
SNHG25-201ENST00000580828 CRYBA4P53673 196 aa8.4□□□□□ -1.06
SNHG25-201ENST00000580828 FHL2Q14192 279 aa8.4□□□□□ -1.06
SNHG25-201ENST00000580828 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa8.4□□□□□ -1.06
SNHG25-201ENST00000580828 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa8.4□□□□□ -1.06
SNHG25-201ENST00000580828 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
SNHG25-201ENST00000580828 SDF2L1Q9HCN8 221 aa8.4□□□□□ -1.06
SNHG25-201ENST00000580828 PSG8Q9UQ74 426 aa8.4□□□□□ -1.06
SNHG25-201ENST00000580828 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa8.39□□□□□ -1.07
SNHG25-201ENST00000580828 A0A1W2PPQ1 181 aa8.39□□□□□ -1.07
SNHG25-201ENST00000580828 F6UZH7 168 aa8.39□□□□□ -1.07
SNHG25-201ENST00000580828 BTF3P20290 206 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
SNHG25-201ENST00000580828 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
SNHG25-201ENST00000580828 ZNF726P1Q15940 193 aa8.39□□□□□ -1.07
SNHG25-201ENST00000580828 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
SNHG25-201ENST00000580828 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa8.39□□□□□ -1.07
SNHG25-201ENST00000580828 TMEM75Q8N9X5 138 aa8.39□□□□□ -1.07
SNHG25-201ENST00000580828 SGK494Q96LW2 274 aa8.39□□□□□ -1.07
SNHG25-201ENST00000580828 C8orf49Q96NF6 230 aa8.39□□□□□ -1.07
SNHG25-201ENST00000580828 CYTL1Q9NRR1 136 aa8.39□□□□□ -1.07
SNHG25-201ENST00000580828 TRAV4A0A0B4J268 109 aa8.38□□□□□ -1.07
SNHG25-201ENST00000580828 IFNA7P01567 189 aa8.38□□□□□ -1.07
SNHG25-201ENST00000580828 IGLV2-11P01706 119 aa8.38□□□□□ -1.07
SNHG25-201ENST00000580828 PPT1P50897 306 aa8.38□□□□□ -1.07
SNHG25-201ENST00000580828 ZFP69Q49AA0 526 aa8.38□□□□□ -1.07
SNHG25-201ENST00000580828 SMUG1Q53HV7 270 aa8.38□□□□□ -1.07
SNHG25-201ENST00000580828 ZNF479Q96JC4 524 aa8.38□□□□□ -1.07
SNHG25-201ENST00000580828 GCGP01275 180 aa8.37□□□□□ -1.07
SNHG25-201ENST00000580828 ORM1P02763 201 aa8.37□□□□□ -1.07
SNHG25-201ENST00000580828 TYMSP04818 313 aa8.37□□□□□ -1.07
SNHG25-201ENST00000580828 PFN1P07737 140 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
SNHG25-201ENST00000580828 ZNF345Q14585 488 aa8.37□□□□□ -1.07
SNHG25-201ENST00000580828 NEGR1Q7Z3B1 354 aa8.37□□□□□ -1.07
SNHG25-201ENST00000580828 PRNTQ86SH4 94 aa8.37□□□□□ -1.07
SNHG25-201ENST00000580828 KCNRGQ8N5I3 272 aa8.37□□□□□ -1.07
SNHG25-201ENST00000580828 OR4C5Q8NGB2 326 aa8.37□□□□□ -1.07
SNHG25-201ENST00000580828 HMSDA8MTL9 139 aa8.36□□□□□ -1.07
SNHG25-201ENST00000580828 SFTA3P0C7M3 94 aa8.36□□□□□ -1.07
SNHG25-201ENST00000580828 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
SNHG25-201ENST00000580828 STOML3Q8TAV4 291 aa8.36□□□□□ -1.07
SNHG25-201ENST00000580828 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
SNHG25-201ENST00000580828 HIST1H2BAQ96A08 127 aa8.36□□□□□ -1.07
SNHG25-201ENST00000580828 C11orf21Q9P2W6 132 aa8.36□□□□□ -1.07
SNHG25-201ENST00000580828 A0A0D9SG52 128 aa8.35□□□□□ -1.07
SNHG25-201ENST00000580828 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa8.35□□□□□ -1.07
SNHG25-201ENST00000580828 FAM74A7A6NL05 159 aa8.35□□□□□ -1.07
SNHG25-201ENST00000580828 C9JCJ5 164 aa8.35□□□□□ -1.07
SNHG25-201ENST00000580828 SMLR1H3BR10 107 aa8.35□□□□□ -1.07
SNHG25-201ENST00000580828 PEX7O00628 323 aa8.35□□□□□ -1.07
SNHG25-201ENST00000580828 SIVA1O15304 175 aa8.35□□□□□ -1.07
SNHG25-201ENST00000580828 CIDEAO60543 219 aa8.35□□□□□ -1.07
SNHG25-201ENST00000580828 MED14OSP0DP75 135 aa8.35□□□□□ -1.07
SNHG25-201ENST00000580828 SRIP30626 198 aa8.35□□□□□ -1.07
SNHG25-201ENST00000580828 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
SNHG25-201ENST00000580828 UBE2G2P60604 165 aa8.35□□□□□ -1.07
SNHG25-201ENST00000580828 TNP2Q05952 138 aa8.35□□□□□ -1.07
SNHG25-201ENST00000580828 ZNF876PQ49A33 203 aa8.35□□□□□ -1.07
SNHG25-201ENST00000580828 LYPD5Q6UWN5 251 aa8.35□□□□□ -1.07
SNHG25-201ENST00000580828 PTH2Q96A98 100 aa8.35□□□□□ -1.07
SNHG25-201ENST00000580828 LINC00479Q96M42 142 aa8.35□□□□□ -1.07
SNHG25-201ENST00000580828 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa8.35□□□□□ -1.07
SNHG25-201ENST00000580828 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa8.35□□□□□ -1.07
SNHG25-201ENST00000580828 TRAV34A0A0B4J273 112 aa8.34□□□□□ -1.07
SNHG25-201ENST00000580828 FABP5P3A8MUU1 101 aa8.34□□□□□ -1.07
SNHG25-201ENST00000580828 UMAD1C9J7I0 102 aa8.34□□□□□ -1.07
SNHG25-201ENST00000580828 K7EQD1 137 aa8.34□□□□□ -1.07
SNHG25-201ENST00000580828 NXPH4O95158 308 aa8.34□□□□□ -1.07
SNHG25-201ENST00000580828 SEC11BP0C7V7 166 aa8.34□□□□□ -1.07
SNHG25-201ENST00000580828 GYPEP15421 78 aa8.34□□□□□ -1.07
SNHG25-201ENST00000580828 FHITP49789 147 aa8.34□□□□□ -1.07
SNHG25-201ENST00000580828 SH2D6Q7Z4S9 175 aa8.34□□□□□ -1.07
SNHG25-201ENST00000580828 TXNDC17Q9BRA2 123 aa8.34□□□□□ -1.07
SNHG25-201ENST00000580828 TCEAL7Q9BRU2 100 aa8.34□□□□□ -1.07
SNHG25-201ENST00000580828 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
SNHG25-201ENST00000580828 OR11H4Q8NGC9 324 aa8.33□□□□□ -1.08
SNHG25-201ENST00000580828 C9orf85Q96MD7 179 aa8.33□□□□□ -1.08
SNHG25-201ENST00000580828 ZFP30Q9Y2G7 519 aa8.33□□□□□ -1.08
SNHG25-201ENST00000580828 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa8.33□□□□□ -1.08
SNHG25-201ENST00000580828 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa8.32□□□□□ -1.08
SNHG25-201ENST00000580828 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa8.32□□□□□ -1.08
SNHG25-201ENST00000580828 K7EP13 123 aa8.32□□□□□ -1.08
SNHG25-201ENST00000580828 RS1O15537 224 aa8.32□□□□□ -1.08
SNHG25-201ENST00000580828 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
SNHG25-201ENST00000580828 CFAP126Q5VTH2 177 aa8.32□□□□□ -1.08
SNHG25-201ENST00000580828 COX8CQ7Z4L0 72 aa8.32□□□□□ -1.08
SNHG25-201ENST00000580828 MBD3L1Q8WWY6 194 aa8.32□□□□□ -1.08
SNHG25-201ENST00000580828 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa8.31□□□□□ -1.08
SNHG25-201ENST00000580828 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa8.31□□□□□ -1.08
SNHG25-201ENST00000580828 BCL2L11O43521 198 aa8.31□□□□□ -1.08
SNHG25-201ENST00000580828 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
SNHG25-201ENST00000580828 S100A4P26447 101 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
SNHG25-201ENST00000580828 TIRAPP58753 221 aa8.31□□□□□ -1.08
SNHG25-201ENST00000580828 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa8.31□□□□□ -1.08
SNHG25-201ENST00000580828 CST9LP1Q5W188 147 aa8.31□□□□□ -1.08
SNHG25-201ENST00000580828 DPPA3Q6W0C5 159 aa8.31□□□□□ -1.08
SNHG25-201ENST00000580828 Q86TA4 180 aa8.31□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 99.6 ms