RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557115.5

CIPC-208, Transcript of CLOCK interacting pacemaker, human

TSL 4

Gene CIPC, Length 882 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CIPC-208	ENST00000557115		C9JCJ5	164 aa		14.85	□□□□□ -0.03
CIPC-208	ENST00000557115		K7EQM0	130 aa		14.85	□□□□□ -0.03
CIPC-208	ENST00000557115	MB	P02144	154 aa		14.85	□□□□□ -0.03
CIPC-208	ENST00000557115	KRTAP10-2	P60368	255 aa		14.85	□□□□□ -0.03
CIPC-208	ENST00000557115	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		14.85	□□□□□ -0.03
CIPC-208	ENST00000557115	RAB24	Q969Q5	203 aa		14.85	□□□□□ -0.03
CIPC-208	ENST00000557115	KCNS1	Q96KK3	526 aa		14.85	□□□□□ -0.03
CIPC-208	ENST00000557115	AQP10	Q96PS8	301 aa		14.85	□□□□□ -0.03
CIPC-208	ENST00000557115	TXNDC17	Q9BRA2	123 aa		14.85	□□□□□ -0.03
CIPC-208	ENST00000557115	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	14.85	□□□□□ -0.03
CIPC-208	ENST00000557115	TYMS	P04818	313 aa		14.84	□□□□□ -0.03
CIPC-208	ENST00000557115	STAG3L2	P0CL84	134 aa		14.84	□□□□□ -0.03
CIPC-208	ENST00000557115	STAG3L3	P0CL85	134 aa		14.84	□□□□□ -0.03
CIPC-208	ENST00000557115	ATP6V0C	P27449	155 aa		14.84	□□□□□ -0.03
CIPC-208	ENST00000557115	GCHFR	P30047	84 aa		14.84	□□□□□ -0.03
CIPC-208	ENST00000557115	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		14.84	□□□□□ -0.03
CIPC-208	ENST00000557115	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		14.84	□□□□□ -0.03
CIPC-208	ENST00000557115	ASB13	Q8WXK3	278 aa		14.84	□□□□□ -0.03
CIPC-208	ENST00000557115	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		14.84	□□□□□ -0.03
CIPC-208	ENST00000557115	EREG	O14944	169 aa		14.83	□□□□□ -0.04
CIPC-208	ENST00000557115	SERF2	P84101	59 aa		14.83	□□□□□ -0.04
CIPC-208	ENST00000557115	NFE4	Q86UQ8	179 aa		14.82	□□□□□ -0.04
CIPC-208	ENST00000557115	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	14.82	□□□□□ -0.04
CIPC-208	ENST00000557115	KRTAP4-5	Q9BYR2	181 aa		14.82	□□□□□ -0.04
CIPC-208	ENST00000557115	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	14.82	□□□□□ -0.04
CIPC-208	ENST00000557115	CXorf1	O96002	111 aa		14.81	□□□□□ -0.04
CIPC-208	ENST00000557115	TCRA	P04437	139 aa		14.81	□□□□□ -0.04
CIPC-208	ENST00000557115	ERVFC1-1	P60608	527 aa		14.81	□□□□□ -0.04
CIPC-208	ENST00000557115	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	14.81	□□□□□ -0.04
CIPC-208	ENST00000557115		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	14.81	□□□□□ -0.04
CIPC-208	ENST00000557115	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		14.81	□□□□□ -0.04
CIPC-208	ENST00000557115	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		14.81	□□□□□ -0.04
CIPC-208	ENST00000557115	PSG8	Q9UQ74	426 aa		14.81	□□□□□ -0.04
CIPC-208	ENST00000557115	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		14.81	□□□□□ -0.04
CIPC-208	ENST00000557115	TAAR5	O14804	337 aa		14.8	□□□□□ -0.04
CIPC-208	ENST00000557115	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	14.8	□□□□□ -0.04
CIPC-208	ENST00000557115	EVI2A	P22794	236 aa		14.8	□□□□□ -0.04
CIPC-208	ENST00000557115	ZFP69	Q49AA0	526 aa		14.8	□□□□□ -0.04
CIPC-208	ENST00000557115	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		14.8	□□□□□ -0.04
CIPC-208	ENST00000557115	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		14.8	□□□□□ -0.04
CIPC-208	ENST00000557115		Q5BKY6	102 aa		14.79	□□□□□ -0.04
CIPC-208	ENST00000557115	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		14.79	□□□□□ -0.04
CIPC-208	ENST00000557115	PRNT	Q86SH4	94 aa		14.79	□□□□□ -0.04
CIPC-208	ENST00000557115	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		14.79	□□□□□ -0.04
CIPC-208	ENST00000557115	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		14.78	□□□□□ -0.04
CIPC-208	ENST00000557115	LOC100131303	A0A0U1RQF7	123 aa		14.78	□□□□□ -0.04
CIPC-208	ENST00000557115	GCG	P01275	180 aa		14.78	□□□□□ -0.04
CIPC-208	ENST00000557115	FLI1	Q01543	452 aa	Predicted RBP	14.78	□□□□□ -0.04
CIPC-208	ENST00000557115	ZNF876P	Q49A33	203 aa		14.78	□□□□□ -0.04
CIPC-208	ENST00000557115	SUN5	Q8TC36	379 aa		14.78	□□□□□ -0.04
CIPC-208	ENST00000557115	EPDR1	Q9UM22	224 aa		14.78	□□□□□ -0.04
CIPC-208	ENST00000557115	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		14.77	□□□□□ -0.05
CIPC-208	ENST00000557115	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	14.77	□□□□□ -0.05
CIPC-208	ENST00000557115		K7EP13	123 aa		14.77	□□□□□ -0.05
CIPC-208	ENST00000557115	PPT1	P50897	306 aa		14.77	□□□□□ -0.05
CIPC-208	ENST00000557115	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	14.77	□□□□□ -0.05
CIPC-208	ENST00000557115	SMUG1	Q53HV7	270 aa		14.77	□□□□□ -0.05
CIPC-208	ENST00000557115	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		14.77	□□□□□ -0.05
CIPC-208	ENST00000557115	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		14.77	□□□□□ -0.05
CIPC-208	ENST00000557115	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		14.77	□□□□□ -0.05
CIPC-208	ENST00000557115	GGTLC3	B5MD39	225 aa		14.76	□□□□□ -0.05
CIPC-208	ENST00000557115	PFN1	P07737	140 aa	Known RBP	14.76	□□□□□ -0.05
CIPC-208	ENST00000557115	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	14.76	□□□□□ -0.05
CIPC-208	ENST00000557115	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	14.76	□□□□□ -0.05
CIPC-208	ENST00000557115	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		14.76	□□□□□ -0.05
CIPC-208	ENST00000557115	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		14.75	□□□□□ -0.05
CIPC-208	ENST00000557115	SAPCD1	Q5SSQ6	148 aa		14.75	□□□□□ -0.05
CIPC-208	ENST00000557115	IGLV2-11	P01706	119 aa		14.74	□□□□□ -0.05
CIPC-208	ENST00000557115	CRYGD	P07320	174 aa		14.74	□□□□□ -0.05
CIPC-208	ENST00000557115		Q6ZNX1	250 aa		14.74	□□□□□ -0.05
CIPC-208	ENST00000557115	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		14.74	□□□□□ -0.05
CIPC-208	ENST00000557115	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		14.74	□□□□□ -0.05
CIPC-208	ENST00000557115	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		14.73	□□□□□ -0.05
CIPC-208	ENST00000557115	CIDEA	O60543	219 aa		14.73	□□□□□ -0.05
CIPC-208	ENST00000557115	IFNA7	P01567	189 aa		14.73	□□□□□ -0.05
CIPC-208	ENST00000557115	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		14.73	□□□□□ -0.05
CIPC-208	ENST00000557115	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		14.73	□□□□□ -0.05
CIPC-208	ENST00000557115	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		14.73	□□□□□ -0.05
CIPC-208	ENST00000557115		A0A1W2PRE2	83 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CIPC-208	ENST00000557115	RNF222	A6NCQ9	220 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CIPC-208	ENST00000557115	RS1	O15537	224 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CIPC-208	ENST00000557115	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	14.72	□□□□□ -0.05
CIPC-208	ENST00000557115		Q8N1X5	172 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CIPC-208	ENST00000557115	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CIPC-208	ENST00000557115	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CIPC-208	ENST00000557115		A0A087WTM6	91 aa		14.71	□□□□□ -0.05
CIPC-208	ENST00000557115	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		14.71	□□□□□ -0.05
CIPC-208	ENST00000557115	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		14.71	□□□□□ -0.05
CIPC-208	ENST00000557115	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
CIPC-208	ENST00000557115	UBE2G2	P60604	165 aa		14.71	□□□□□ -0.05
CIPC-208	ENST00000557115	RHOH	Q15669	191 aa		14.71	□□□□□ -0.05
CIPC-208	ENST00000557115	AKR1C8P	Q5T2L2	129 aa		14.71	□□□□□ -0.05
CIPC-208	ENST00000557115	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		14.71	□□□□□ -0.05
CIPC-208	ENST00000557115	LINC00479	Q96M42	142 aa		14.71	□□□□□ -0.05
CIPC-208	ENST00000557115	C9orf85	Q96MD7	179 aa		14.71	□□□□□ -0.05
CIPC-208	ENST00000557115	RYR1	P21817	5038 aa		14.7	□□□□□ -0.06
CIPC-208	ENST00000557115	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		14.7	□□□□□ -0.06
CIPC-208	ENST00000557115	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		14.7	□□□□□ -0.06
CIPC-208	ENST00000557115	TIRAP	P58753	221 aa		14.7	□□□□□ -0.06
CIPC-208	ENST00000557115	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		14.7	□□□□□ -0.06

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