RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555562.1

FOXN3-AS1-201, FOXN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXN3-AS1, Length 1,077 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa13.54□□□□□ -0.24
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CDK2AP2O75956 126 aa13.54□□□□□ -0.24
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PRR9Q5T870 116 aa13.54□□□□□ -0.24
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DNAH5Q8TE73 4624 aa13.53□□□□□ -0.24
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa13.53□□□□□ -0.24
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IGLV2-11P01706 119 aa13.53□□□□□ -0.24
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 UBE2G2P60604 165 aa13.53□□□□□ -0.24
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAM159AQ6UWV7 190 aa13.53□□□□□ -0.24
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 APOBP04114 4563 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.24
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GAGE12BA1L429 117 aa13.52□□□□□ -0.25
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GAGE7O76087 117 aa13.52□□□□□ -0.25
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GAGE12FP0CL80 117 aa13.52□□□□□ -0.25
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GAGE12GP0CL81 117 aa13.52□□□□□ -0.25
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GAGE12IP0CL82 117 aa13.52□□□□□ -0.25
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF415Q09FC8 603 aa13.52□□□□□ -0.25
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TVP23CQ96ET8 276 aa13.52□□□□□ -0.25
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TREM1Q9NP99 234 aa13.52□□□□□ -0.25
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa13.52□□□□□ -0.25
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TRGV2A0A075B6R0 118 aa13.51□□□□□ -0.25
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IFNA7P01567 189 aa13.51□□□□□ -0.25
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PPT1P50897 306 aa13.51□□□□□ -0.25
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CCL20P78556 96 aa13.51□□□□□ -0.25
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa13.51□□□□□ -0.25
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TRGV11A0A075B6L2 103 aa13.5□□□□□ -0.25
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa13.5□□□□□ -0.25
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TRAV21A0A0B4J279 112 aa13.5□□□□□ -0.25
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TCL1AP56279 114 aa13.5□□□□□ -0.25
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 Q6AWC8 147 aa13.5□□□□□ -0.25
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMEM75Q8N9X5 138 aa13.5□□□□□ -0.25
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HIST1H2BAQ96A08 127 aa13.5□□□□□ -0.25
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TCEAL7Q9BRU2 100 aa13.5□□□□□ -0.25
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 Q9H8V8 135 aa13.5□□□□□ -0.25
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PAGE4O60829 102 aa13.49□□□□□ -0.25
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OR5I1Q13606 314 aa13.49□□□□□ -0.25
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 Q6ZQT7 251 aa13.49□□□□□ -0.25
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LINC00612Q8N6U2 182 aa13.49□□□□□ -0.25
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C11orf72Q8NBR9 251 aa13.49□□□□□ -0.25
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NAGKQ9UJ70 344 aa13.49□□□□□ -0.25
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 A0A1B0GV50 99 aa13.48□□□□□ -0.25
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PEX7O00628 323 aa13.48□□□□□ -0.25
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MUC21Q5SSG8 566 aa13.48□□□□□ -0.25
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ALKAL2Q6UX46 152 aa13.48□□□□□ -0.25
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa13.47□□□□□ -0.25
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 F6UZH7 168 aa13.47□□□□□ -0.25
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa13.47□□□□□ -0.25
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 Q6ZTI0 123 aa13.47□□□□□ -0.25
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KCNS1Q96KK3 526 aa13.47□□□□□ -0.25
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SGK494Q96LW2 274 aa13.47□□□□□ -0.25
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LINC00479Q96M42 142 aa13.47□□□□□ -0.25
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PSG8Q9UQ74 426 aa13.47□□□□□ -0.25
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KLF12Q9Y4X4 402 aa13.47□□□□□ -0.25
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMEM183BQ1AE95 376 aa13.46□□□□□ -0.25
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TTC32Q5I0X7 151 aa13.46□□□□□ -0.25
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CST9LP1Q5W188 147 aa13.46□□□□□ -0.25
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMEM183AQ8IXX5 376 aa13.46□□□□□ -0.25
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa13.46□□□□□ -0.25
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SPXQ9BT56 116 aa13.46□□□□□ -0.25
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SPINK4O60575 86 aa13.45□□□□□ -0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SMUG1Q53HV7 270 aa13.45□□□□□ -0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PRNTQ86SH4 94 aa13.45□□□□□ -0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LYPD6BQ8NI32 183 aa13.45□□□□□ -0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C18orf15Q96N68 181 aa13.45□□□□□ -0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SDF2L1Q9HCN8 221 aa13.45□□□□□ -0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MANBALQ9NQG1 85 aa13.45□□□□□ -0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa13.45□□□□□ -0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TRAV34A0A0B4J273 112 aa13.44□□□□□ -0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa13.44□□□□□ -0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 H3BNG1 76 aa13.44□□□□□ -0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TEX46H3BTG2 121 aa13.44□□□□□ -0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TDRG1Q3Y452 100 aa13.44□□□□□ -0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 UPK3BQ9BT76 320 aa13.44□□□□□ -0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 A0A0J9YY99 117 aa13.43□□□□□ -0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HOXA5P20719 270 aa13.43□□□□□ -0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ESRGQ1W209 222 aa13.43□□□□□ -0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 COX8CQ7Z4L0 72 aa13.43□□□□□ -0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SPATA12Q7Z6I5 190 aa13.43□□□□□ -0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C8orf49Q96NF6 230 aa13.43□□□□□ -0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GNG13Q9P2W3 67 aa13.43□□□□□ -0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 A0A1W2PPQ1 181 aa13.42□□□□□ -0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GCGP01275 180 aa13.42□□□□□ -0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BTF3P20290 206 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 Q86TA4 180 aa13.42□□□□□ -0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TXNDC17Q9BRA2 123 aa13.42□□□□□ -0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 UBE2G1P62253 170 aa13.41□□□□□ -0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BLOC1S1P78537 153 aa13.41□□□□□ -0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLAQ13239 276 aa13.41□□□□□ -0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 Q8N1X5 172 aa13.41□□□□□ -0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C11orf52Q96A22 123 aa13.41□□□□□ -0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FMC1Q96HJ9 113 aa13.41□□□□□ -0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa13.41□□□□□ -0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SCO2A0A1W2PP80 73 aa13.4□□□□□ -0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PFN1P07737 140 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MDFICQ9P1T7 246 aa13.4□□□□□ -0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZFP30Q9Y2G7 519 aa13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.2 ms