RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551968.5

CS-230, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 542 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-230ENST00000551968 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CS-230ENST00000551968 FFAR4Q5NUL3 377 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-230ENST00000551968 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CS-230ENST00000551968 DIRAS2Q96HU8 199 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-230ENST00000551968 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CS-230ENST00000551968 SLC39A9Q9NUM3 307 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-230ENST00000551968 TSC22D2O75157 780 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-230ENST00000551968 SCGB1D2O95969 90 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-230ENST00000551968 CHTF8P0CG12 524 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-230ENST00000551968 ZNF876PQ49A33 203 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-230ENST00000551968 C14orf177Q52M58 125 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-230ENST00000551968 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-230ENST00000551968 PHYHIPLQ96FC7 376 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-230ENST00000551968 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-230ENST00000551968 PFDN5Q99471 154 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-230ENST00000551968 GGACTQ9BVM4 153 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-230ENST00000551968 SAMD10Q9BYL1 202 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-230ENST00000551968 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
CS-230ENST00000551968 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-230ENST00000551968 H3BMQ9 156 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-230ENST00000551968 INPP1P49441 399 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-230ENST00000551968 ENHOQ6UWT2 76 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-230ENST00000551968 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-230ENST00000551968 C2orf50Q96LR7 162 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-230ENST00000551968 OR51M1Q9H341 326 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-230ENST00000551968 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
CS-230ENST00000551968 WDR83OSQ9Y284 106 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-230ENST00000551968 A0A087WYN8 130 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-230ENST00000551968 C7orf66A4D0T2 115 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-230ENST00000551968 PGPEP1LA6NFU8 196 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-230ENST00000551968 NBEAP1P0C6P0 100 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-230ENST00000551968 RAB31Q13636 194 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-230ENST00000551968 MIR17HGQ75NE6 70 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-230ENST00000551968 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
CS-230ENST00000551968 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-230ENST00000551968 F6UZH7 168 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-230ENST00000551968 MGST1P10620 155 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CS-230ENST00000551968 RPL29P47914 159 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CS-230ENST00000551968 TAS2R30P59541 319 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-230ENST00000551968 ZNF506Q5JVG8 444 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-230ENST00000551968 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-230ENST00000551968 WDR73Q6P4I2 378 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-230ENST00000551968 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
CS-230ENST00000551968 MCFD2Q8NI22 146 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-230ENST00000551968 FXYD5Q96DB9 178 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-230ENST00000551968 TVP23CQ96ET8 276 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-230ENST00000551968 C11orf21Q9P2W6 132 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-230ENST00000551968 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-230ENST00000551968 RBAKDNA6NC62 111 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-230ENST00000551968 NOL3O60936 208 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CS-230ENST00000551968 CST7O76096 145 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-230ENST00000551968 HLA-DQA1P01909 254 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-230ENST00000551968 OR2T35Q8NGX2 323 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-230ENST00000551968 C1orf43Q9BWL3 253 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-230ENST00000551968 A0A087WWC5 75 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-230ENST00000551968 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-230ENST00000551968 C9orf170A2RU37 121 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-230ENST00000551968 DIRC3C9JPN6 131 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-230ENST00000551968 MBPP02686 304 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
CS-230ENST00000551968 DEDD2Q8WXF8 326 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-230ENST00000551968 C20orf85Q9H1P6 137 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-230ENST00000551968 SDF2L1Q9HCN8 221 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-230ENST00000551968 CIDEAO60543 219 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-230ENST00000551968 RANP62826 216 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
CS-230ENST00000551968 PRR3P79522 188 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
CS-230ENST00000551968 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
CS-230ENST00000551968 ASB13Q8WXK3 278 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-230ENST00000551968 TRIM63Q969Q1 353 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-230ENST00000551968 LINC00479Q96M42 142 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-230ENST00000551968 C9orf85Q96MD7 179 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-230ENST00000551968 PARLQ9H300 379 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-230ENST00000551968 UQCC1Q9NVA1 299 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-230ENST00000551968 LENEPQ9Y5L5 61 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-230ENST00000551968 TRAV21A0A0B4J279 112 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-230ENST00000551968 FAM24AA6NFZ4 105 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-230ENST00000551968 BAXQ07812 192 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-230ENST00000551968 TMEM75Q8N9X5 138 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-230ENST00000551968 SPACA4Q8TDM5 124 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-230ENST00000551968 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CS-230ENST00000551968 JPT2Q9H910 190 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-230ENST00000551968 GSKIPQ9P0R6 139 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-230ENST00000551968 A0A087WX48 190 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-230ENST00000551968 SEC11BP0C7V7 166 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-230ENST00000551968 CSN1S1P47710 185 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-230ENST00000551968 RPL19P84098 196 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CS-230ENST00000551968 Q0VG73 95 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-230ENST00000551968 DMRTA1Q5VZB9 504 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-230ENST00000551968 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-230ENST00000551968 DPH3Q96FX2 82 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-230ENST00000551968 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CS-230ENST00000551968 SH3BGRL3Q9H299 93 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-230ENST00000551968 C11orf1Q9H5F2 150 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-230ENST00000551968 PLAC8Q9NZF1 115 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-230ENST00000551968 V9GYH0 126 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-230ENST00000551968 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-230ENST00000551968 SLPIP03973 132 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-230ENST00000551968 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
CS-230ENST00000551968 FGF7P21781 194 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-230ENST00000551968 FAUP35544 74 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
CS-230ENST00000551968 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms