RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551901.5

RRN3P1-204, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene RRN3P1, Length 1,157 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1-204ENST00000551901 RTL8CO15255 209 aa7.22□□□□□ -1.25
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RRN3P1-204ENST00000551901 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa7.22□□□□□ -1.25
RRN3P1-204ENST00000551901 FAM159AQ6UWV7 190 aa7.22□□□□□ -1.25
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RRN3P1-204ENST00000551901 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa7.19□□□□□ -1.26
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RRN3P1-204ENST00000551901 FABP5P3A8MUU1 101 aa7.15□□□□□ -1.26
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RRN3P1-204ENST00000551901 Q86TA4 180 aa7.15□□□□□ -1.26
RRN3P1-204ENST00000551901 FAM213BQ8TBF2 198 aa7.15□□□□□ -1.26
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