RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542921.5

JMJD1C-210, Transcript of jumonji domain containing 1C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene JMJD1C, Length 8,149 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD1C-210ENST00000542921 IGLC6P0CF74 106 aa2.45□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 LINC00208Q96KT6 92 aa2.45□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa2.45□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa2.45□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa2.45□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 COLCA2A8K830 154 aa2.45□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa2.44□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 LINC01548A6NM66 108 aa2.44□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 F8WDY8 70 aa2.44□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP2.44□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 IGKV1-39P01597 117 aa2.44□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 IGHV3-48P01763 117 aa2.44□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 IGKV1D-39P04432 117 aa2.44□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 LCA10Q71F78 164 aa2.44□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 SPACA3Q8IXA5 215 aa2.44□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa2.44□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa2.44□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 MYH15Q9Y2K3 1946 aa2.44□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 C4orf51C9J302 202 aa2.44□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 EFNA2O43921 213 aa2.44□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 TIAF1O95411 115 aa2.44□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 Q5BKY6 102 aa2.44□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 REG3GQ6UW15 175 aa2.44□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 LINC00526Q96FQ7 95 aa2.44□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 Q9HAA7 133 aa2.44□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 KIF13BQ9NQT8 1826 aa2.44□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa2.44□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 NDPQ00604 133 aa2.44□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 PRR13Q9NZ81 148 aa2.44□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 LTBP4Q8N2S1 1624 aa2.44□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 NUP188Q5SRE5 1749 aa2.44□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 SPAG17Q6Q759 2223 aa2.44□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa2.44□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 LRP5O75197 1615 aa2.44□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa2.44□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 CT62P0C5K7 136 aa2.44□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 DEFB131AP59861 70 aa2.44□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 ATP6V0E1O15342 81 aa2.44□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 EFNA4P52798 201 aa2.44□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 Q8NBF4 154 aa2.44□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 OCC1Q8TAD7 63 aa2.44□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 MYH6P13533 1939 aa2.44□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 H3BUX3 64 aa2.44□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 DEFB113Q30KQ7 82 aa2.44□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 C11orf45Q8TAV5 145 aa2.44□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 PLAC4Q8WY50 150 aa2.44□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa2.44□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 BCE1O60756 84 aa2.44□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 SPINK1P00995 79 aa2.44□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP2.44□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP2.44□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 Q8N814 137 aa2.44□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 HHLA3Q9XRX5 114 aa2.44□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 MYH7P12883 1935 aa2.44□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa2.43□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 A0A0J9YWU9 116 aa2.43□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 C19orf71A6NCJ1 209 aa2.43□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa2.43□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 IGHV4-31P0DP07 118 aa2.43□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 DEFB124Q8NES8 71 aa2.43□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 IL25Q9H293 177 aa2.43□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 PPDPFQ9H3Y8 114 aa2.43□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP2.43□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa2.43□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 RFPL3SP0C7P2 107 aa2.43□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 ZNF843Q8N446 348 aa2.43□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 ZNRD1Q9P1U0 126 aa2.43□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa2.43□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 CHD1O14646 1710 aa2.43□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa2.43□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa2.43□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 EPM2AB3EWF7 344 aa2.43□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 CRYGAP11844 174 aa2.43□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 RPL39P5Q59GN2 51 aa2.43□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 Q6ZS92 163 aa2.43□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 C5orf66Q9H5L9 145 aa2.43□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 H0Y8X5 98 aa2.43□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 ARTNQ5T4W7 220 aa2.43□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP2.43□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa2.43□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa2.43□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 H0Y9P7 68 aa2.43□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 ZNF497Q6ZNH5 498 aa2.43□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 Q8N6K4 173 aa2.43□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 E7EQL1 145 aa2.43□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 KAAG1Q9UBP8 84 aa2.43□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 ALKAL1Q6UXT8 129 aa2.42□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 Q6ZQT7 251 aa2.42□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa2.42□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 SLX4Q8IY92 1834 aa2.42□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 SCN9AQ15858 1988 aa2.42□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa2.42□□□□□ -2.02
JMJD1C-210ENST00000542921 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa2.42□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88.1 ms