RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524318.3

SFTPC-211, Transcript of surfactant protein C, humanhuman

TSL 3

Gene SFTPC, Length 993 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPC-211ENST00000524318 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa7.11□□□□□ -1.27
SFTPC-211ENST00000524318 F6UZH7 168 aa7.11□□□□□ -1.27
SFTPC-211ENST00000524318 ERVFC1-1P60608 527 aa7.11□□□□□ -1.27
SFTPC-211ENST00000524318 GNG5P63218 68 aa7.11□□□□□ -1.27
SFTPC-211ENST00000524318 WFDC10BQ8IUB3 73 aa7.11□□□□□ -1.27
SFTPC-211ENST00000524318 TXNDC17Q9BRA2 123 aa7.11□□□□□ -1.27
SFTPC-211ENST00000524318 C9JCJ5 164 aa7.1□□□□□ -1.27
SFTPC-211ENST00000524318 K7EP13 123 aa7.1□□□□□ -1.27
SFTPC-211ENST00000524318 EVI2AP22794 236 aa7.1□□□□□ -1.27
SFTPC-211ENST00000524318 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP7.1□□□□□ -1.27
SFTPC-211ENST00000524318 KCNS1Q96KK3 526 aa7.1□□□□□ -1.27
SFTPC-211ENST00000524318 SGK494Q96LW2 274 aa7.1□□□□□ -1.27
SFTPC-211ENST00000524318 SDF2L1Q9HCN8 221 aa7.1□□□□□ -1.27
SFTPC-211ENST00000524318 MSRB1Q9NZV6 116 aa7.1□□□□□ -1.27
SFTPC-211ENST00000524318 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa7.09□□□□□ -1.27
SFTPC-211ENST00000524318 TYMSP04818 313 aa7.09□□□□□ -1.27
SFTPC-211ENST00000524318 DNAH10OSP0CZ25 163 aa7.09□□□□□ -1.27
SFTPC-211ENST00000524318 ARL14EPLP0DKL9 152 aa7.09□□□□□ -1.27
SFTPC-211ENST00000524318 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
SFTPC-211ENST00000524318 SH2D6Q7Z4S9 175 aa7.09□□□□□ -1.27
SFTPC-211ENST00000524318 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa7.09□□□□□ -1.27
SFTPC-211ENST00000524318 ASB13Q8WXK3 278 aa7.09□□□□□ -1.27
SFTPC-211ENST00000524318 NDFIP1Q9BT67 221 aa7.09□□□□□ -1.27
SFTPC-211ENST00000524318 A0A087WTM6 91 aa7.08□□□□□ -1.28
SFTPC-211ENST00000524318 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa7.08□□□□□ -1.28
SFTPC-211ENST00000524318 STAG3L2P0CL84 134 aa7.08□□□□□ -1.28
SFTPC-211ENST00000524318 STAG3L3P0CL85 134 aa7.08□□□□□ -1.28
SFTPC-211ENST00000524318 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
SFTPC-211ENST00000524318 CDPF1Q6NVV7 123 aa7.08□□□□□ -1.28
SFTPC-211ENST00000524318 NHLRC2Q8NBF2 726 aa7.08□□□□□ -1.28
SFTPC-211ENST00000524318 OR2G3Q8NGZ4 309 aa7.08□□□□□ -1.28
SFTPC-211ENST00000524318 RAB24Q969Q5 203 aa7.08□□□□□ -1.28
SFTPC-211ENST00000524318 ALG5Q9Y673 324 aa7.08□□□□□ -1.28
SFTPC-211ENST00000524318 DNAH5Q8TE73 4624 aa7.07□□□□□ -1.28
SFTPC-211ENST00000524318 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
SFTPC-211ENST00000524318 K7EQM0 130 aa7.07□□□□□ -1.28
SFTPC-211ENST00000524318 TAAR5O14804 337 aa7.07□□□□□ -1.28
SFTPC-211ENST00000524318 TCRAP04437 139 aa7.07□□□□□ -1.28
SFTPC-211ENST00000524318 CRYGDP07320 174 aa7.07□□□□□ -1.28
SFTPC-211ENST00000524318 GCHFRP30047 84 aa7.07□□□□□ -1.28
SFTPC-211ENST00000524318 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
SFTPC-211ENST00000524318 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
SFTPC-211ENST00000524318 ZNF876PQ49A33 203 aa7.07□□□□□ -1.28
SFTPC-211ENST00000524318 C5orf17Q8NAS9 161 aa7.07□□□□□ -1.28
SFTPC-211ENST00000524318 SUN5Q8TC36 379 aa7.07□□□□□ -1.28
SFTPC-211ENST00000524318 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
SFTPC-211ENST00000524318 C11orf21Q9P2W6 132 aa7.07□□□□□ -1.28
SFTPC-211ENST00000524318 PSG8Q9UQ74 426 aa7.07□□□□□ -1.28
SFTPC-211ENST00000524318 APOBP04114 4563 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
SFTPC-211ENST00000524318 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa7.06□□□□□ -1.28
SFTPC-211ENST00000524318 CIDEAO60543 219 aa7.06□□□□□ -1.28
SFTPC-211ENST00000524318 GCGP01275 180 aa7.06□□□□□ -1.28
SFTPC-211ENST00000524318 MBP02144 154 aa7.06□□□□□ -1.28
SFTPC-211ENST00000524318 PFN1P07737 140 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
SFTPC-211ENST00000524318 ATP6V0CP27449 155 aa7.06□□□□□ -1.28
SFTPC-211ENST00000524318 PPT1P50897 306 aa7.06□□□□□ -1.28
SFTPC-211ENST00000524318 TIRAPP58753 221 aa7.06□□□□□ -1.28
SFTPC-211ENST00000524318 SERF2P84101 59 aa7.06□□□□□ -1.28
SFTPC-211ENST00000524318 C10orf126Q8N4M7 172 aa7.06□□□□□ -1.28
SFTPC-211ENST00000524318 SLC25A29Q8N8R3 303 aa7.06□□□□□ -1.28
SFTPC-211ENST00000524318 AQP10Q96PS8 301 aa7.06□□□□□ -1.28
SFTPC-211ENST00000524318 PRADC1Q9BSG0 188 aa7.06□□□□□ -1.28
SFTPC-211ENST00000524318 MED28Q9H204 178 aa7.06□□□□□ -1.28
SFTPC-211ENST00000524318 EPDR1Q9UM22 224 aa7.06□□□□□ -1.28
SFTPC-211ENST00000524318 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa7.05□□□□□ -1.28
SFTPC-211ENST00000524318 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa7.05□□□□□ -1.28
SFTPC-211ENST00000524318 EPM2AB3EWF7 344 aa7.05□□□□□ -1.28
SFTPC-211ENST00000524318 RS1O15537 224 aa7.05□□□□□ -1.28
SFTPC-211ENST00000524318 CXorf1O96002 111 aa7.05□□□□□ -1.28
SFTPC-211ENST00000524318 IGLV2-11P01706 119 aa7.05□□□□□ -1.28
SFTPC-211ENST00000524318 XGP55808 180 aa7.05□□□□□ -1.28
SFTPC-211ENST00000524318 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
SFTPC-211ENST00000524318 SMUG1Q53HV7 270 aa7.05□□□□□ -1.28
SFTPC-211ENST00000524318 Q5BKY6 102 aa7.05□□□□□ -1.28
SFTPC-211ENST00000524318 CFAP126Q5VTH2 177 aa7.05□□□□□ -1.28
SFTPC-211ENST00000524318 DPPA3Q6W0C5 159 aa7.05□□□□□ -1.28
SFTPC-211ENST00000524318 PRNTQ86SH4 94 aa7.05□□□□□ -1.28
SFTPC-211ENST00000524318 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
SFTPC-211ENST00000524318 SH3BGRL3Q9H299 93 aa7.05□□□□□ -1.28
SFTPC-211ENST00000524318 TMEM167BQ9NRX6 74 aa7.05□□□□□ -1.28
SFTPC-211ENST00000524318 TNFSF18Q9UNG2 199 aa7.05□□□□□ -1.28
SFTPC-211ENST00000524318 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa7.04□□□□□ -1.28
SFTPC-211ENST00000524318 PGPEP1LA6NFU8 196 aa7.04□□□□□ -1.28
SFTPC-211ENST00000524318 GGTLC3B5MD39 225 aa7.04□□□□□ -1.28
SFTPC-211ENST00000524318 KRTAP10-1P60331 282 aa7.04□□□□□ -1.28
SFTPC-211ENST00000524318 RHOHQ15669 191 aa7.04□□□□□ -1.28
SFTPC-211ENST00000524318 ZFP69Q49AA0 526 aa7.04□□□□□ -1.28
SFTPC-211ENST00000524318 LINC01556Q5JQF7 62 aa7.04□□□□□ -1.28
SFTPC-211ENST00000524318 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa7.04□□□□□ -1.28
SFTPC-211ENST00000524318 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa7.04□□□□□ -1.28
SFTPC-211ENST00000524318 TMEM75Q8N9X5 138 aa7.04□□□□□ -1.28
SFTPC-211ENST00000524318 PTH2Q96A98 100 aa7.04□□□□□ -1.28
SFTPC-211ENST00000524318 C9orf85Q96MD7 179 aa7.04□□□□□ -1.28
SFTPC-211ENST00000524318 BATF3Q9NR55 127 aa7.04□□□□□ -1.28
SFTPC-211ENST00000524318 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa7.03□□□□□ -1.28
SFTPC-211ENST00000524318 PSCAO43653 123 aa7.03□□□□□ -1.28
SFTPC-211ENST00000524318 PTTG1O95997 202 aa7.03□□□□□ -1.28
SFTPC-211ENST00000524318 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
SFTPC-211ENST00000524318 GCSHP23434 173 aa7.03□□□□□ -1.28
SFTPC-211ENST00000524318 OR10J3Q5JRS4 329 aa7.03□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.7 ms