RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519651.5

TSNARE1-204, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSNARE1, Length 2,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-204ENST00000519651 OR9G4Q8NGQ1 327 aa13.13□□□□□ -0.31
TSNARE1-204ENST00000519651 HECTD1Q9ULT8 2610 aa13.13□□□□□ -0.31
TSNARE1-204ENST00000519651 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
TSNARE1-204ENST00000519651 PMCHL1Q16048 86 aa13.12□□□□□ -0.31
TSNARE1-204ENST00000519651 APRG1Q8IVJ8 170 aa13.12□□□□□ -0.31
TSNARE1-204ENST00000519651 ORMDL3Q8N138 153 aa13.12□□□□□ -0.31
TSNARE1-204ENST00000519651 OR10AG1Q8NH19 301 aa13.12□□□□□ -0.31
TSNARE1-204ENST00000519651 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
TSNARE1-204ENST00000519651 PRO1933Q9H354 126 aa13.12□□□□□ -0.31
TSNARE1-204ENST00000519651 LINC00587B1AMM8 73 aa13.12□□□□□ -0.31
TSNARE1-204ENST00000519651 CKS2P33552 79 aa13.12□□□□□ -0.31
TSNARE1-204ENST00000519651 ZNF664Q8N3J9 261 aa13.12□□□□□ -0.31
TSNARE1-204ENST00000519651 PRELID3AQ96N28 172 aa13.12□□□□□ -0.31
TSNARE1-204ENST00000519651 H3BVH4 76 aa13.11□□□□□ -0.31
TSNARE1-204ENST00000519651 PKIAP61925 76 aa13.11□□□□□ -0.31
TSNARE1-204ENST00000519651 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa13.11□□□□□ -0.31
TSNARE1-204ENST00000519651 SPANXN1Q5VSR9 72 aa13.11□□□□□ -0.31
TSNARE1-204ENST00000519651 EBLN2Q6P2I7 272 aa13.11□□□□□ -0.31
TSNARE1-204ENST00000519651 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
TSNARE1-204ENST00000519651 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
TSNARE1-204ENST00000519651 TSTD3H0UI37 97 aa13.1□□□□□ -0.31
TSNARE1-204ENST00000519651 OR5AL1P0C617 328 aa13.1□□□□□ -0.31
TSNARE1-204ENST00000519651 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa13.1□□□□□ -0.31
TSNARE1-204ENST00000519651 U3KQK5 164 aa13.1□□□□□ -0.31
TSNARE1-204ENST00000519651 IGKV3-20P01619 116 aa13.1□□□□□ -0.31
TSNARE1-204ENST00000519651 C3orf79P0CE67 100 aa13.1□□□□□ -0.31
TSNARE1-204ENST00000519651 RAB4AP20338 218 aa13.1□□□□□ -0.31
TSNARE1-204ENST00000519651 S100A4P26447 101 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
TSNARE1-204ENST00000519651 NF1P21359 2839 aa13.09□□□□□ -0.31
TSNARE1-204ENST00000519651 A0A0J9YX75 114 aa13.09□□□□□ -0.31
TSNARE1-204ENST00000519651 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa13.09□□□□□ -0.31
TSNARE1-204ENST00000519651 A0A1W2PRX2 142 aa13.09□□□□□ -0.31
TSNARE1-204ENST00000519651 KLLNB2CW77 178 aa13.09□□□□□ -0.31
TSNARE1-204ENST00000519651 SMKR1H3BMG3 65 aa13.09□□□□□ -0.31
TSNARE1-204ENST00000519651 SNAI2O43623 268 aa13.09□□□□□ -0.31
TSNARE1-204ENST00000519651 LINC01006Q8NI28 216 aa13.09□□□□□ -0.31
TSNARE1-204ENST00000519651 TMEM160Q9NX00 188 aa13.09□□□□□ -0.31
TSNARE1-204ENST00000519651 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa13.09□□□□□ -0.31
TSNARE1-204ENST00000519651 CD28P10747 220 aa13.09□□□□□ -0.31
TSNARE1-204ENST00000519651 SMIM15Q7Z3B0 74 aa13.09□□□□□ -0.31
TSNARE1-204ENST00000519651 RNF185Q96GF1 192 aa13.09□□□□□ -0.31
TSNARE1-204ENST00000519651 EVI2AP22794 236 aa13.08□□□□□ -0.32
TSNARE1-204ENST00000519651 DMRTA1Q5VZB9 504 aa13.08□□□□□ -0.32
TSNARE1-204ENST00000519651 GNRH2O43555 120 aa13.07□□□□□ -0.32
TSNARE1-204ENST00000519651 NCR2O95944 276 aa13.07□□□□□ -0.32
TSNARE1-204ENST00000519651 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
TSNARE1-204ENST00000519651 ASIPP42127 132 aa13.07□□□□□ -0.32
TSNARE1-204ENST00000519651 CACNG7P62955 275 aa13.07□□□□□ -0.32
TSNARE1-204ENST00000519651 FA2HQ7L5A8 372 aa13.07□□□□□ -0.32
TSNARE1-204ENST00000519651 AP5S1Q9NUS5 200 aa13.07□□□□□ -0.32
TSNARE1-204ENST00000519651 HILS1P60008 231 aa13.07□□□□□ -0.32
TSNARE1-204ENST00000519651 DYNLRB2Q8TF09 96 aa13.07□□□□□ -0.32
TSNARE1-204ENST00000519651 RAX2Q96IS3 184 aa13.07□□□□□ -0.32
TSNARE1-204ENST00000519651 C16orf95Q9H693 158 aa13.07□□□□□ -0.32
TSNARE1-204ENST00000519651 MTORP42345 2549 aa13.06□□□□□ -0.32
TSNARE1-204ENST00000519651 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa13.06□□□□□ -0.32
TSNARE1-204ENST00000519651 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa13.06□□□□□ -0.32
TSNARE1-204ENST00000519651 LY6G6DO95868 133 aa13.06□□□□□ -0.32
TSNARE1-204ENST00000519651 FAM159AQ6UWV7 190 aa13.06□□□□□ -0.32
TSNARE1-204ENST00000519651 SPRY2O43597 315 aa13.06□□□□□ -0.32
TSNARE1-204ENST00000519651 LEPROTL1O95214 131 aa13.06□□□□□ -0.32
TSNARE1-204ENST00000519651 PPBPP02775 128 aa13.06□□□□□ -0.32
TSNARE1-204ENST00000519651 LEPP41159 167 aa13.06□□□□□ -0.32
TSNARE1-204ENST00000519651 TDRG1Q3Y452 100 aa13.06□□□□□ -0.32
TSNARE1-204ENST00000519651 TMEM61Q8N0U2 210 aa13.06□□□□□ -0.32
TSNARE1-204ENST00000519651 Q8N976 141 aa13.06□□□□□ -0.32
TSNARE1-204ENST00000519651 ODF3Q96PU9 254 aa13.06□□□□□ -0.32
TSNARE1-204ENST00000519651 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
TSNARE1-204ENST00000519651 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa13.06□□□□□ -0.32
TSNARE1-204ENST00000519651 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa13.06□□□□□ -0.32
TSNARE1-204ENST00000519651 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
TSNARE1-204ENST00000519651 NPYP01303 97 aa13.05□□□□□ -0.32
TSNARE1-204ENST00000519651 TEX43Q6ZNM6 134 aa13.05□□□□□ -0.32
TSNARE1-204ENST00000519651 FOXI2Q6ZQN5 318 aa13.05□□□□□ -0.32
TSNARE1-204ENST00000519651 NOTCH2Q04721 2471 aa13.05□□□□□ -0.32
TSNARE1-204ENST00000519651 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa13.04□□□□□ -0.32
TSNARE1-204ENST00000519651 M0R381 172 aa13.04□□□□□ -0.32
TSNARE1-204ENST00000519651 BTF3P20290 206 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
TSNARE1-204ENST00000519651 C7orf71A4D174 169 aa13.04□□□□□ -0.32
TSNARE1-204ENST00000519651 CCL24O00175 119 aa13.04□□□□□ -0.32
TSNARE1-204ENST00000519651 TCF21O43680 179 aa13.04□□□□□ -0.32
TSNARE1-204ENST00000519651 GAS8-AS1O95177 125 aa13.04□□□□□ -0.32
TSNARE1-204ENST00000519651 DEFB131AP59861 70 aa13.04□□□□□ -0.32
TSNARE1-204ENST00000519651 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
TSNARE1-204ENST00000519651 SORL1Q92673 2214 aa13.04□□□□□ -0.32
TSNARE1-204ENST00000519651 HIVEP2P31629 2446 aa13.04□□□□□ -0.32
TSNARE1-204ENST00000519651 CDKN1BP46527 198 aa13.03□□□□□ -0.32
TSNARE1-204ENST00000519651 SPINK13Q1W4C9 94 aa13.03□□□□□ -0.32
TSNARE1-204ENST00000519651 DEFB114Q30KQ6 69 aa13.03□□□□□ -0.32
TSNARE1-204ENST00000519651 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
TSNARE1-204ENST00000519651 DDTP30046 118 aa13.02□□□□□ -0.33
TSNARE1-204ENST00000519651 TSPOP30536 169 aa13.02□□□□□ -0.33
TSNARE1-204ENST00000519651 LINC00173Q6ZV60 143 aa13.02□□□□□ -0.33
TSNARE1-204ENST00000519651 TMEM70Q9BUB7 260 aa13.02□□□□□ -0.33
TSNARE1-204ENST00000519651 KNCNA6PVL3 124 aa13.01□□□□□ -0.33
TSNARE1-204ENST00000519651 TNFRSF6BO95407 300 aa13.01□□□□□ -0.33
TSNARE1-204ENST00000519651 CD7P09564 240 aa13.01□□□□□ -0.33
TSNARE1-204ENST00000519651 MED14OSP0DP75 135 aa13.01□□□□□ -0.33
TSNARE1-204ENST00000519651 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
TSNARE1-204ENST00000519651 FHL3Q13643 280 aa13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 184.6 ms