RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515143.5

SPOCK3-223, Transcript of SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 3, human

TSL 4

Gene SPOCK3, Length 565 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPOCK3-223	ENST00000515143	ORM1	P02763	201 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	FAM159A	Q6UWV7	190 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143		Q8TAT8	98 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	RAB24	Q969Q5	203 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	KCNS1	Q96KK3	526 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	ALG5	Q9Y673	324 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143		A0A1W2PRE2	83 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143		K7EQD1	137 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	TAAR5	O14804	337 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	ATP6V0C	P27449	155 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	GCHFR	P30047	84 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	RAB2A	P61019	212 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143		Q5BKY6	102 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	DNLZ	Q5SXM8	178 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	ZNF575	Q86XF7	245 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	CMTM2	Q8TAZ6	248 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	ZNF479	Q96JC4	524 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	NKX6-2	Q9C056	277 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	C16orf90	A8MZG2	172 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	GNRH2	O43555	120 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	NXPH4	O95158	308 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	CXorf1	O96002	111 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	TCRA	P04437	139 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	TMEM183B	Q1AE95	376 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	SAPCD1	Q5SSQ6	148 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	NFE4	Q86UQ8	179 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	TMEM183A	Q8IXX5	376 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	C9orf85	Q96MD7	179 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	KRTAP4-5	Q9BYR2	181 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	MED28	Q9H204	178 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	TREM1	Q9NP99	234 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	MRPL16	Q9NX20	251 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	EPDR1	Q9UM22	224 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	TRAV8-1	A0A0A6YYK1	113 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	TRGV4	A0A0C4DH28	118 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	RNF222	A6NCQ9	220 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	GGTLC3	B5MD39	225 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143		G3V3Q6	166 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143		K7EQM0	130 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	RS1	O15537	224 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	PFN1	P07737	140 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	FHIT	P49789	147 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	LINC00315	P59091	139 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	KRTAP10-2	P60368	255 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	MUC21	Q5SSG8	566 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	HYLS1	Q96M11	299 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	C8orf49	Q96NF6	230 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	TXNDC17	Q9BRA2	123 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	PSG8	Q9UQ74	426 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	ABCA13	Q86UQ4	5058 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143		C9JCJ5	164 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	TYMS	P04818	313 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	GYPE	P15421	78 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	FLI1	Q01543	452 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	ZNF726P1	Q15940	193 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	SPATA12	Q7Z6I5	190 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143		Q8N1X5	172 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	OR4C5	Q8NGB2	326 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	TCEAL7	Q9BRU2	100 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	IGHV3-53	P01767	116 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	SFTA3	P0C7M3	94 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	SRI	P30626	198 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	ZNF876P	Q49A33	203 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	SMUG1	Q53HV7	270 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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