RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508383.1

SLF1-208, Transcript of SMC5-SMC6 complex localization factor 1, human

TSL 3

Gene SLF1, Length 328 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLF1-208	ENST00000508383	PPT1	P50897	306 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLF1-208	ENST00000508383	RAB32	Q13637	225 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLF1-208	ENST00000508383	ZNF266	Q14584	549 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLF1-208	ENST00000508383	ATP6V1F	Q16864	119 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLF1-208	ENST00000508383		Q6AWC8	147 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLF1-208	ENST00000508383	FAM159A	Q6UWV7	190 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLF1-208	ENST00000508383	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLF1-208	ENST00000508383	THAP6	Q8TBB0	222 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLF1-208	ENST00000508383	FXYD5	Q96DB9	178 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLF1-208	ENST00000508383	C2orf50	Q96LR7	162 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLF1-208	ENST00000508383	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLF1-208	ENST00000508383	SPX	Q9BT56	116 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLF1-208	ENST00000508383	SLC25A31	Q9H0C2	315 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLF1-208	ENST00000508383	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SLF1-208	ENST00000508383	OR51M1	Q9H341	326 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLF1-208	ENST00000508383		Q9HAA7	133 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLF1-208	ENST00000508383	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLF1-208	ENST00000508383	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	OR7C2	O60412	319 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	TCRB	P04435	133 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	CSN1S1	P47710	185 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	OR4C5	Q8NGB2	326 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	PAXX	Q9BUH6	204 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	NUDT15	Q9NV35	164 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	NAGK	Q9UJ70	344 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383		M0R2P5	195 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	PLA2G10	O15496	165 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	LYRM1	O43325	122 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	C1QB	P02746	253 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	TIRAP	P58753	221 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	RAN	P62826	216 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	NHLH2	Q02577	135 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	IL15RA	Q13261	267 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	TDRG1	Q3Y452	100 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	DIRC3	C9JPN6	131 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	GNRH2	O43555	120 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	IGHV3-30	P01768	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	IGHV3-33	P01772	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	TYMS	P04818	313 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	WFDC2	Q14508	124 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383		Q6ZSA8	131 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383		F6UZH7	168 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	PFN1	P07737	140 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	LAGE3	Q14657	143 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	KHDC3L	Q587J8	217 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	TMED6	Q8WW62	240 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	HYLS1	Q96M11	299 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	OR5AC2	Q9NZP5	309 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	LRP1	Q07954	4544 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	IGLV2-33	A0A075B6J2	118 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	TRAV8-1	A0A0A6YYK1	113 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	LECT2	O14960	151 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	RHOH	Q15669	191 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	LRRC37A5P	Q49AS3	106 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	LELP1	Q5T871	98 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	CMTM2	Q8TAZ6	248 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	KCNS1	Q96KK3	526 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	PGP	A6NDG6	321 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	RS1	O15537	224 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	SIX6	O95475	246 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	TAS2R45	P59539	299 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	ZNF876P	Q49A33	203 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	LINC01620	Q4KN68	170 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	SCX	Q7RTU7	201 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	ASB13	Q8WXK3	278 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	TVP23C	Q96ET8	276 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLF1-208	ENST00000508383	ATP5S	Q99766	215 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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