RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503638.1

PGGT1B-204, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 579 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-204ENST00000503638 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa9.61□□□□□ -0.87
PGGT1B-204ENST00000503638 PFN1P07737 140 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
PGGT1B-204ENST00000503638 DEFB130BP0DP73 79 aa9.61□□□□□ -0.87
PGGT1B-204ENST00000503638 DEFB130AP0DP74 79 aa9.61□□□□□ -0.87
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF415Q09FC8 603 aa9.61□□□□□ -0.87
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF506Q5JVG8 444 aa9.61□□□□□ -0.87
PGGT1B-204ENST00000503638 FAM210AQ96ND0 272 aa9.61□□□□□ -0.87
PGGT1B-204ENST00000503638 SDF2L1Q9HCN8 221 aa9.61□□□□□ -0.87
PGGT1B-204ENST00000503638 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
PGGT1B-204ENST00000503638 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa9.61□□□□□ -0.87
PGGT1B-204ENST00000503638 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa9.61□□□□□ -0.87
PGGT1B-204ENST00000503638 CELA1Q9UNI1 258 aa9.61□□□□□ -0.87
PGGT1B-204ENST00000503638 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
PGGT1B-204ENST00000503638 DNAH7Q8WXX0 4024 aa9.6□□□□□ -0.87
PGGT1B-204ENST00000503638 TRGV11A0A075B6L2 103 aa9.6□□□□□ -0.87
PGGT1B-204ENST00000503638 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa9.6□□□□□ -0.87
PGGT1B-204ENST00000503638 RAB19A4D1S5 217 aa9.6□□□□□ -0.87
PGGT1B-204ENST00000503638 FABP5P3A8MUU1 101 aa9.6□□□□□ -0.87
PGGT1B-204ENST00000503638 M0R036 132 aa9.6□□□□□ -0.87
PGGT1B-204ENST00000503638 ORM1P02763 201 aa9.6□□□□□ -0.87
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PGGT1B-204ENST00000503638 DAD1P61803 113 aa9.6□□□□□ -0.87
PGGT1B-204ENST00000503638 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa9.6□□□□□ -0.87
PGGT1B-204ENST00000503638 FAM162BQ5T6X4 162 aa9.6□□□□□ -0.87
PGGT1B-204ENST00000503638 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
PGGT1B-204ENST00000503638 KCNS1Q96KK3 526 aa9.6□□□□□ -0.87
PGGT1B-204ENST00000503638 SH2D1AO60880 128 aa9.59□□□□□ -0.87
PGGT1B-204ENST00000503638 OR5I1Q13606 314 aa9.59□□□□□ -0.87
PGGT1B-204ENST00000503638 LINC00467Q9BRT7 94 aa9.59□□□□□ -0.87
PGGT1B-204ENST00000503638 DKK2Q9UBU2 259 aa9.59□□□□□ -0.87
PGGT1B-204ENST00000503638 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa9.58□□□□□ -0.88
PGGT1B-204ENST00000503638 LYRM9A8MSI8 78 aa9.58□□□□□ -0.88
PGGT1B-204ENST00000503638 TMEM250H0YL14 139 aa9.58□□□□□ -0.88
PGGT1B-204ENST00000503638 C3orf84H3BNL1 204 aa9.58□□□□□ -0.88
PGGT1B-204ENST00000503638 GNRH2O43555 120 aa9.58□□□□□ -0.88
PGGT1B-204ENST00000503638 PEA15Q15121 130 aa9.58□□□□□ -0.88
PGGT1B-204ENST00000503638 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa9.57□□□□□ -0.88
PGGT1B-204ENST00000503638 GAGE12BA1L429 117 aa9.57□□□□□ -0.88
PGGT1B-204ENST00000503638 B4DEV8 164 aa9.57□□□□□ -0.88
PGGT1B-204ENST00000503638 GAGE7O76087 117 aa9.57□□□□□ -0.88
PGGT1B-204ENST00000503638 GAGE12FP0CL80 117 aa9.57□□□□□ -0.88
PGGT1B-204ENST00000503638 GAGE12GP0CL81 117 aa9.57□□□□□ -0.88
PGGT1B-204ENST00000503638 GAGE12IP0CL82 117 aa9.57□□□□□ -0.88
PGGT1B-204ENST00000503638 S100A4P26447 101 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
PGGT1B-204ENST00000503638 CASC10Q5T4H9 136 aa9.57□□□□□ -0.88
PGGT1B-204ENST00000503638 Q6ZTC4 211 aa9.57□□□□□ -0.88
PGGT1B-204ENST00000503638 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
PGGT1B-204ENST00000503638 PARLQ9H300 379 aa9.57□□□□□ -0.88
PGGT1B-204ENST00000503638 MDFICQ9P1T7 246 aa9.57□□□□□ -0.88
PGGT1B-204ENST00000503638 DNAH1Q9P2D7 4330 aa9.56□□□□□ -0.88
PGGT1B-204ENST00000503638 TRGV2A0A075B6R0 118 aa9.56□□□□□ -0.88
PGGT1B-204ENST00000503638 PLAC8L1A1L4L8 177 aa9.56□□□□□ -0.88
PGGT1B-204ENST00000503638 PGPEP1LA6NFU8 196 aa9.56□□□□□ -0.88
PGGT1B-204ENST00000503638 TYMSP04818 313 aa9.56□□□□□ -0.88
PGGT1B-204ENST00000503638 ASIPP42127 132 aa9.56□□□□□ -0.88
PGGT1B-204ENST00000503638 TCL1AP56279 114 aa9.56□□□□□ -0.88
PGGT1B-204ENST00000503638 C12orf74Q32Q52 190 aa9.56□□□□□ -0.88
PGGT1B-204ENST00000503638 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
PGGT1B-204ENST00000503638 C11orf72Q8NBR9 251 aa9.56□□□□□ -0.88
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PGGT1B-204ENST00000503638 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
PGGT1B-204ENST00000503638 C11orf21Q9P2W6 132 aa9.56□□□□□ -0.88
PGGT1B-204ENST00000503638 TRAV10A0A0B4J240 114 aa9.55□□□□□ -0.88
PGGT1B-204ENST00000503638 GRIFINA4D1Z8 144 aa9.55□□□□□ -0.88
PGGT1B-204ENST00000503638 NUPR2A6NF83 97 aa9.55□□□□□ -0.88
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF727A8MUV8 499 aa9.55□□□□□ -0.88
PGGT1B-204ENST00000503638 CRIP1P50238 77 aa9.55□□□□□ -0.88
PGGT1B-204ENST00000503638 IFITM2Q01629 132 aa9.55□□□□□ -0.88
PGGT1B-204ENST00000503638 TDRG1Q3Y452 100 aa9.55□□□□□ -0.88
PGGT1B-204ENST00000503638 BIN3Q9NQY0 253 aa9.55□□□□□ -0.88
PGGT1B-204ENST00000503638 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa9.54□□□□□ -0.88
PGGT1B-204ENST00000503638 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa9.54□□□□□ -0.88
PGGT1B-204ENST00000503638 SRP19P09132 144 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
PGGT1B-204ENST00000503638 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
PGGT1B-204ENST00000503638 CLLU1Q5K131 121 aa9.54□□□□□ -0.88
PGGT1B-204ENST00000503638 Q6ZTI0 123 aa9.54□□□□□ -0.88
PGGT1B-204ENST00000503638 COX8CQ7Z4L0 72 aa9.54□□□□□ -0.88
PGGT1B-204ENST00000503638 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
PGGT1B-204ENST00000503638 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa9.53□□□□□ -0.88
PGGT1B-204ENST00000503638 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa9.53□□□□□ -0.88
PGGT1B-204ENST00000503638 KRBOX1C9JBD0 128 aa9.53□□□□□ -0.88
PGGT1B-204ENST00000503638 C9JCJ5 164 aa9.53□□□□□ -0.88
PGGT1B-204ENST00000503638 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
PGGT1B-204ENST00000503638 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
PGGT1B-204ENST00000503638 SMIM12Q96EX1 92 aa9.53□□□□□ -0.88
PGGT1B-204ENST00000503638 SPXQ9BT56 116 aa9.53□□□□□ -0.88
PGGT1B-204ENST00000503638 MLST8Q9BVC4 326 aa9.53□□□□□ -0.88
PGGT1B-204ENST00000503638 F5H768 121 aa9.52□□□□□ -0.89
PGGT1B-204ENST00000503638 H3BVH4 76 aa9.52□□□□□ -0.89
PGGT1B-204ENST00000503638 P01737 135 aa9.52□□□□□ -0.89
PGGT1B-204ENST00000503638 ATP5G1P05496 136 aa9.52□□□□□ -0.89
PGGT1B-204ENST00000503638 RPL19P84098 196 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
PGGT1B-204ENST00000503638 LYSTQ99698 3801 aa9.51□□□□□ -0.89
PGGT1B-204ENST00000503638 IGLL5B9A064 214 aa9.51□□□□□ -0.89
PGGT1B-204ENST00000503638 M0R2P5 195 aa9.51□□□□□ -0.89
PGGT1B-204ENST00000503638 SPINK4O60575 86 aa9.51□□□□□ -0.89
PGGT1B-204ENST00000503638 IGLV2-8P01709 118 aa9.51□□□□□ -0.89
PGGT1B-204ENST00000503638 IGHV3-53P01767 116 aa9.51□□□□□ -0.89
PGGT1B-204ENST00000503638 OR2D3Q8NGH3 330 aa9.51□□□□□ -0.89
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