RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502260.5

SH3BP2-205, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 727 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-205ENST00000502260 HERC1Q15751 4861 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP2-205ENST00000502260 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-205ENST00000502260 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-205ENST00000502260 IFNA7P01567 189 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-205ENST00000502260 BTF3P20290 206 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-205ENST00000502260 SULT1A2P50226 295 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-205ENST00000502260 RAB5CP51148 216 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-205ENST00000502260 TCL1AP56279 114 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-205ENST00000502260 OR5I1Q13606 314 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-205ENST00000502260 TTC32Q5I0X7 151 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-205ENST00000502260 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
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SH3BP2-205ENST00000502260 UPK3BQ9BT76 320 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-205ENST00000502260 KLF12Q9Y4X4 402 aa9.56□□□□□ -0.88
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SH3BP2-205ENST00000502260 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP2-205ENST00000502260 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP2-205ENST00000502260 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP2-205ENST00000502260 K7EQM0 130 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP2-205ENST00000502260 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
SH3BP2-205ENST00000502260 ZNF726P1Q15940 193 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP2-205ENST00000502260 ESRGQ1W209 222 aa9.55□□□□□ -0.88
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SH3BP2-205ENST00000502260 Q6AWC8 147 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP2-205ENST00000502260 DPPA3Q6W0C5 159 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP2-205ENST00000502260 TREM1Q9NP99 234 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP2-205ENST00000502260 A0A0J9YY99 117 aa9.54□□□□□ -0.88
SH3BP2-205ENST00000502260 A0A1W2PPQ1 181 aa9.54□□□□□ -0.88
SH3BP2-205ENST00000502260 TCRAP04437 139 aa9.54□□□□□ -0.88
SH3BP2-205ENST00000502260 HOXA5P20719 270 aa9.54□□□□□ -0.88
SH3BP2-205ENST00000502260 ZNF415Q09FC8 603 aa9.54□□□□□ -0.88
SH3BP2-205ENST00000502260 FAM159AQ6UWV7 190 aa9.54□□□□□ -0.88
SH3BP2-205ENST00000502260 SGK494Q96LW2 274 aa9.54□□□□□ -0.88
SH3BP2-205ENST00000502260 NDFIP1Q9BT67 221 aa9.54□□□□□ -0.88
SH3BP2-205ENST00000502260 A0A1W2PRE2 83 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP2-205ENST00000502260 GGTLC3B5MD39 225 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP2-205ENST00000502260 F6UZH7 168 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP2-205ENST00000502260 SPINK4O60575 86 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP2-205ENST00000502260 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
SH3BP2-205ENST00000502260 IFITM2Q01629 132 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP2-205ENST00000502260 FAM213BQ8TBF2 198 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP2-205ENST00000502260 TVP23CQ96ET8 276 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP2-205ENST00000502260 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP2-205ENST00000502260 NAGKQ9UJ70 344 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP2-205ENST00000502260 EPDR1Q9UM22 224 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP2-205ENST00000502260 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
SH3BP2-205ENST00000502260 TRGV11A0A075B6L2 103 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP2-205ENST00000502260 TRAV21A0A0B4J279 112 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP2-205ENST00000502260 H3BNG1 76 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP2-205ENST00000502260 FHITP49789 147 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP2-205ENST00000502260 TMEM183BQ1AE95 376 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP2-205ENST00000502260 TMEM183AQ8IXX5 376 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP2-205ENST00000502260 C18orf15Q96N68 181 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP2-205ENST00000502260 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
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SH3BP2-205ENST00000502260 FAT1Q14517 4588 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-205ENST00000502260 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa9.51□□□□□ -0.89
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SH3BP2-205ENST00000502260 BLOC1S1P78537 153 aa9.51□□□□□ -0.89
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SH3BP2-205ENST00000502260 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-205ENST00000502260 MBD3L1Q8WWY6 194 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-205ENST00000502260 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-205ENST00000502260 MDFICQ9P1T7 246 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-205ENST00000502260 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-205ENST00000502260 H2AFB1P0C5Y9 115 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-205ENST00000502260 TDRG1Q3Y452 100 aa9.5□□□□□ -0.89
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SH3BP2-205ENST00000502260 C8orf49Q96NF6 230 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-205ENST00000502260 SPXQ9BT56 116 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-205ENST00000502260 FAM74A7A6NL05 159 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP2-205ENST00000502260 EPM2AB3EWF7 344 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP2-205ENST00000502260 TEX46H3BTG2 121 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP2-205ENST00000502260 GNRH2O43555 120 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP2-205ENST00000502260 IGLV2-11P01706 119 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP2-205ENST00000502260 IGHV3-53P01767 116 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP2-205ENST00000502260 LINC00315P59091 139 aa9.49□□□□□ -0.89
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SH3BP2-205ENST00000502260 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SH3BP2-205ENST00000502260 SDF2L1Q9HCN8 221 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP2-205ENST00000502260 TRAV34A0A0B4J273 112 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP2-205ENST00000502260 GCGP01275 180 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP2-205ENST00000502260 TYMSP04818 313 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP2-205ENST00000502260 PPT1P50897 306 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP2-205ENST00000502260 RAB14P61106 215 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP2-205ENST00000502260 SMUG1Q53HV7 270 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP2-205ENST00000502260 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP2-205ENST00000502260 VSIG2Q96IQ7 327 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP2-205ENST00000502260 A0A096LPF7 62 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP2-205ENST00000502260 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP2-205ENST00000502260 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP2-205ENST00000502260 PEX7O00628 323 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP2-205ENST00000502260 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
SH3BP2-205ENST00000502260 HIST1H2BAQ96A08 127 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP2-205ENST00000502260 LINC00479Q96M42 142 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP2-205ENST00000502260 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP2-205ENST00000502260 PAX4O43316 350 aa9.46□□□□□ -0.9
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