RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498524.5

ANKRD28-213, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,289 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-213ENST00000498524 TEX45Q8NA69 505 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-213ENST00000498524 IFI27L1Q96BM0 104 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-213ENST00000498524 ZNF292O60281 2723 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-213ENST00000498524 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
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ANKRD28-213ENST00000498524 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-213ENST00000498524 Q6ZR03 302 aa3.08□□□□□ -1.92
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ANKRD28-213ENST00000498524 BRWD1-AS2P59051 145 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-213ENST00000498524 C10orf55Q5SWW7 151 aa3.08□□□□□ -1.92
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ANKRD28-213ENST00000498524 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-213ENST00000498524 C11orf53Q8IXP5 236 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-213ENST00000498524 LINC00528Q8N1L1 170 aa3.08□□□□□ -1.92
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ANKRD28-213ENST00000498524 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa3.08□□□□□ -1.92
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ANKRD28-213ENST00000498524 C9orf118A6NHY6 69 aa3.07□□□□□ -1.92
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ANKRD28-213ENST00000498524 LINC00310P59036 64 aa3.07□□□□□ -1.92
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ANKRD28-213ENST00000498524 SCGB1D4Q6XE38 83 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-213ENST00000498524 TTC9CQ8N5M4 171 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-213ENST00000498524 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-213ENST00000498524 FXYD5Q96DB9 178 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-213ENST00000498524 HIST1H4GQ99525 98 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-213ENST00000498524 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa3.07□□□□□ -1.92
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ANKRD28-213ENST00000498524 TRAV41A0A0B4J266 112 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-213ENST00000498524 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-213ENST00000498524 CCL3L1P16619 93 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-213ENST00000498524 ZNF138P52744 262 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-213ENST00000498524 C18orf15Q96N68 181 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-213ENST00000498524 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
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ANKRD28-213ENST00000498524 CYSLTR1Q9Y271 337 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-213ENST00000498524 C2orf70A6NJV1 201 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-213ENST00000498524 D6R8Y8 96 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-213ENST00000498524 K7EP34 96 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-213ENST00000498524 TAX1BP3O14907 124 aa3.07□□□□□ -1.92
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ANKRD28-213ENST00000498524 HERVK_113P61574 105 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-213ENST00000498524 C17orf58Q2M2W7 97 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-213ENST00000498524 ZNF788Q6ZQV5 615 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-213ENST00000498524 PPP1R27Q86WC6 154 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-213ENST00000498524 LYPD1Q8N2G4 141 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-213ENST00000498524 Q8N7P7 452 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-213ENST00000498524 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-213ENST00000498524 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa3.07□□□□□ -1.92
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ANKRD28-213ENST00000498524 LTAP01374 205 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-213ENST00000498524 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP3.07□□□□□ -1.92
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ANKRD28-213ENST00000498524 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-213ENST00000498524 GAFA1Q96PS6 74 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-213ENST00000498524 SCRT2Q9NQ03 307 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-213ENST00000498524 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-213ENST00000498524 PLCE1Q9P212 2302 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-213ENST00000498524 DPM2O94777 84 aa3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-213ENST00000498524 IGLV2-8P01709 118 aa3.06□□□□□ -1.92
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ANKRD28-213ENST00000498524 RHOGP84095 191 aa3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-213ENST00000498524 SPANXN1Q5VSR9 72 aa3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-213ENST00000498524 LINC01545Q5VT33 79 aa3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-213ENST00000498524 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-213ENST00000498524 GATD1Q8NB37 220 aa3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-213ENST00000498524 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-213ENST00000498524 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-213ENST00000498524 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-213ENST00000498524 SCGB1C2P0DMR2 95 aa3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-213ENST00000498524 LOXP28300 417 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-213ENST00000498524 WT1-ASQ06250 92 aa3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-213ENST00000498524 TMEM75Q8N9X5 138 aa3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-213ENST00000498524 C15orf53Q8NAA6 179 aa3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-213ENST00000498524 TNCP24821 2201 aa3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-213ENST00000498524 A0A1B0GXF2 115 aa3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-213ENST00000498524 FABP5P3A8MUU1 101 aa3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-213ENST00000498524 C9JAW5 83 aa3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-213ENST00000498524 IGKCP01834 107 aa3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-213ENST00000498524 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-213ENST00000498524 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-213ENST00000498524 TTC32Q5I0X7 151 aa3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-213ENST00000498524 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-213ENST00000498524 Q8N976 141 aa3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-213ENST00000498524 ZNF503Q96F45 646 aa3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-213ENST00000498524 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-213ENST00000498524 INS-IGF2F8WCM5 200 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-213ENST00000498524 PROP1O75360 226 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-213ENST00000498524 IGHV1-8P0DP01 117 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-213ENST00000498524 ANKRD29Q8N6D5 301 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-213ENST00000498524 TMEM14CQ9P0S9 112 aa3.05□□□□□ -1.92
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