RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494420.1

HOXB-AS3-215, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 2

Gene HOXB-AS3, Length 431 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-215ENST00000494420 A0A1W2PPQ1 181 aa13.28□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RNF222A6NCQ9 220 aa13.28□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TCRAP04437 139 aa13.28□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZNF575Q86XF7 245 aa13.28□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-215ENST00000494420 KCNS1Q96KK3 526 aa13.28□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SDF2L1Q9HCN8 221 aa13.28□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-215ENST00000494420 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa13.27□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RGS21Q2M5E4 152 aa13.27□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 M0R2P5 195 aa13.26□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SIVA1O15304 175 aa13.26□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TYMSP04818 313 aa13.26□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 LYPD5Q6UWN5 251 aa13.26□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 OR4C5Q8NGB2 326 aa13.26□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 EPDR1Q9UM22 224 aa13.26□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PSG8Q9UQ74 426 aa13.26□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 DNAH11Q96DT5 4516 aa13.25□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NXPH4O95158 308 aa13.25□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NEGR1Q7Z3B1 354 aa13.25□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PRNTQ86SH4 94 aa13.25□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TRAV4A0A0B4J268 109 aa13.24□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GGTLC3B5MD39 225 aa13.24□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TAAR5O14804 337 aa13.24□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SRIP30626 198 aa13.24□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 C16orf90A8MZG2 172 aa13.23□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 K7EQD1 137 aa13.23□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GCGP01275 180 aa13.23□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GYPEP15421 78 aa13.23□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZFP69Q49AA0 526 aa13.23□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa13.23□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa13.22□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 A0A1W2PRE2 83 aa13.22□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 C9JCJ5 164 aa13.22□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 IFNA7P01567 189 aa13.22□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 IGLV2-11P01706 119 aa13.22□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ORM1P02763 201 aa13.22□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 BTF3P20290 206 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZNF726P1Q15940 193 aa13.22□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SMUG1Q53HV7 270 aa13.22□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa13.22□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TMEM75Q8N9X5 138 aa13.22□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa13.22□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ARPC5O15511 151 aa13.21□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PFN1P07737 140 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 UBE2G2P60604 165 aa13.21□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa13.21□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 C11orf21Q9P2W6 132 aa13.21□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 LINC00315P59091 139 aa13.2□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 LINC00479Q96M42 142 aa13.2□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TXNDC17Q9BRA2 123 aa13.2□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TRAV34A0A0B4J273 112 aa13.19□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 G3V3Q6 166 aa13.19□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZNF876PQ49A33 203 aa13.19□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SPATA12Q7Z6I5 190 aa13.19□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa13.18□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PPT1P50897 306 aa13.18□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CYTL1Q9NRR1 136 aa13.18□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa13.17□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SMLR1H3BR10 107 aa13.17□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 LY96Q9Y6Y9 160 aa13.17□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 FAM74A7A6NL05 159 aa13.16□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NHLRC2Q8NBF2 726 aa13.16□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa13.16□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa13.15□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa13.15□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PEX7O00628 323 aa13.15□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RS1O15537 224 aa13.15□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CFAP126Q5VTH2 177 aa13.15□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SH2D6Q7Z4S9 175 aa13.15□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 HIST1H2BAQ96A08 127 aa13.15□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 C9orf85Q96MD7 179 aa13.15□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa13.15□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa13.15□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PGPEP1LA6NFU8 196 aa13.14□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-215ENST00000494420 FABP5P3A8MUU1 101 aa13.14□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CIDEAO60543 219 aa13.14□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-215ENST00000494420 EVI2AP22794 236 aa13.14□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-215ENST00000494420 S100A4P26447 101 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-215ENST00000494420 DPPA3Q6W0C5 159 aa13.14□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-215ENST00000494420 WFDC10BQ8IUB3 73 aa13.14□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZNF506Q5JVG8 444 aa13.13□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-215ENST00000494420 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SLC25A29Q8N8R3 303 aa13.13□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-215ENST00000494420 STOML3Q8TAV4 291 aa13.13□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PTH2Q96A98 100 aa13.13□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PRADC1Q9BSG0 188 aa13.13□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-215ENST00000494420 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa13.12□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-215ENST00000494420 KRTAP10-2P60368 255 aa13.12□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NFE4Q86UQ8 179 aa13.12□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CST9LP1Q5W188 147 aa13.11□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-215ENST00000494420 Q86TA4 180 aa13.11□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-215ENST00000494420 KCNRGQ8N5I3 272 aa13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms