RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 MSMBP08118 114 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAME-213ENST00000492657 CACNG7P62955 275 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAME-213ENST00000492657 ORMDL3Q8N138 153 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAME-213ENST00000492657 HIF1ANQ9NWT6 349 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAME-213ENST00000492657 A0A0G2JLM5 398 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAME-213ENST00000492657 C20orf173Q96LM9 149 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAME-213ENST00000492657 SLC50A1Q9BRV3 221 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAME-213ENST00000492657 CREBBPQ92793 2442 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAME-213ENST00000492657 TEX15Q9BXT5 2789 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAME-213ENST00000492657 TLN2Q9Y4G6 2542 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAME-213ENST00000492657 A6NDX4 124 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAME-213ENST00000492657 IGF1P05019 195 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAME-213ENST00000492657 UFSP1Q6NVU6 142 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAME-213ENST00000492657 C18orf15Q96N68 181 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAME-213ENST00000492657 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAME-213ENST00000492657 FAM223BA6NKX1 122 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAME-213ENST00000492657 PF4V1P10720 104 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAME-213ENST00000492657 FGF6P10767 208 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAME-213ENST00000492657 CKS2P33552 79 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAME-213ENST00000492657 SMAGPQ0VAQ4 97 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAME-213ENST00000492657 FAM223AQ8IWN6 122 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAME-213ENST00000492657 U3KQK5 164 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAME-213ENST00000492657 NAV2Q8IVL1 2488 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAME-213ENST00000492657 G3V4G9 280 aa9.81□□□□□ -0.84
PRAME-213ENST00000492657 NDUFS8O00217 210 aa9.81□□□□□ -0.84
PRAME-213ENST00000492657 NPYP01303 97 aa9.81□□□□□ -0.84
PRAME-213ENST00000492657 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
PRAME-213ENST00000492657 RPS20P60866 119 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
PRAME-213ENST00000492657 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa9.81□□□□□ -0.84
PRAME-213ENST00000492657 WFDC12Q8WWY7 111 aa9.81□□□□□ -0.84
PRAME-213ENST00000492657 C16orf92Q96LL3 132 aa9.81□□□□□ -0.84
PRAME-213ENST00000492657 SORL1Q92673 2214 aa9.81□□□□□ -0.84
PRAME-213ENST00000492657 J3KRW8 73 aa9.81□□□□□ -0.84
PRAME-213ENST00000492657 OR2K2Q8NGT1 345 aa9.81□□□□□ -0.84
PRAME-213ENST00000492657 GLMPQ8WWB7 406 aa9.81□□□□□ -0.84
PRAME-213ENST00000492657 SPCS1Q9Y6A9 102 aa9.81□□□□□ -0.84
PRAME-213ENST00000492657 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa9.8□□□□□ -0.84
PRAME-213ENST00000492657 IGHG2P01859 326 aa9.8□□□□□ -0.84
PRAME-213ENST00000492657 CLUHP3Q96NS8 147 aa9.8□□□□□ -0.84
PRAME-213ENST00000492657 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa9.8□□□□□ -0.84
PRAME-213ENST00000492657 TMEM78Q5T7P6 136 aa9.8□□□□□ -0.84
PRAME-213ENST00000492657 GPHB5Q86YW7 130 aa9.8□□□□□ -0.84
PRAME-213ENST00000492657 RNF185Q96GF1 192 aa9.8□□□□□ -0.84
PRAME-213ENST00000492657 RBAKDNA6NC62 111 aa9.79□□□□□ -0.84
PRAME-213ENST00000492657 C9orf118A6NHY6 69 aa9.79□□□□□ -0.84
PRAME-213ENST00000492657 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
PRAME-213ENST00000492657 MYO9AB2RTY4 2548 aa9.79□□□□□ -0.84
PRAME-213ENST00000492657 LINC01559Q495D7 138 aa9.79□□□□□ -0.84
PRAME-213ENST00000492657 PRR9Q5T870 116 aa9.79□□□□□ -0.84
PRAME-213ENST00000492657 DKK2Q9UBU2 259 aa9.79□□□□□ -0.84
PRAME-213ENST00000492657 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
PRAME-213ENST00000492657 K7EP34 96 aa9.78□□□□□ -0.84
PRAME-213ENST00000492657 SPRY2O43597 315 aa9.78□□□□□ -0.84
PRAME-213ENST00000492657 EDN2P20800 178 aa9.78□□□□□ -0.84
PRAME-213ENST00000492657 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa9.78□□□□□ -0.84
PRAME-213ENST00000492657 OR4X2Q8NGF9 303 aa9.78□□□□□ -0.84
PRAME-213ENST00000492657 HBDP02042 147 aa9.78□□□□□ -0.84
PRAME-213ENST00000492657 GCSHP23434 173 aa9.78□□□□□ -0.84
PRAME-213ENST00000492657 EVI2AP22794 236 aa9.78□□□□□ -0.84
PRAME-213ENST00000492657 RPL11P62913 178 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
PRAME-213ENST00000492657 B4DSR2 109 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-213ENST00000492657 FXYD2P54710 66 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-213ENST00000492657 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
PRAME-213ENST00000492657 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-213ENST00000492657 IFI27L1Q96BM0 104 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-213ENST00000492657 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-213ENST00000492657 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-213ENST00000492657 F6UB75 175 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-213ENST00000492657 NDUFA4O00483 81 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-213ENST00000492657 SRD5A1P18405 259 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-213ENST00000492657 C10orf99Q6UWK7 81 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-213ENST00000492657 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
PRAME-213ENST00000492657 A1L4Q6 167 aa9.76□□□□□ -0.85
PRAME-213ENST00000492657 IGHV4-59P01825 116 aa9.76□□□□□ -0.85
PRAME-213ENST00000492657 CNFNQ9BYD5 112 aa9.76□□□□□ -0.85
PRAME-213ENST00000492657 AZU1P20160 251 aa9.76□□□□□ -0.85
PRAME-213ENST00000492657 SEC11AP67812 179 aa9.76□□□□□ -0.85
PRAME-213ENST00000492657 LGALS9BQ3B8N2 356 aa9.76□□□□□ -0.85
PRAME-213ENST00000492657 SAMD13Q5VXD3 122 aa9.76□□□□□ -0.85
PRAME-213ENST00000492657 LGALS9CQ6DKI2 356 aa9.76□□□□□ -0.85
PRAME-213ENST00000492657 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
PRAME-213ENST00000492657 CUBNO60494 3623 aa9.75□□□□□ -0.85
PRAME-213ENST00000492657 A0A1W2PPM0 123 aa9.75□□□□□ -0.85
PRAME-213ENST00000492657 DEFB112Q30KQ8 113 aa9.75□□□□□ -0.85
PRAME-213ENST00000492657 USMG5Q96IX5 58 aa9.75□□□□□ -0.85
PRAME-213ENST00000492657 ATP6V0BQ99437 205 aa9.75□□□□□ -0.85
PRAME-213ENST00000492657 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa9.75□□□□□ -0.85
PRAME-213ENST00000492657 A6NDN8 102 aa9.75□□□□□ -0.85
PRAME-213ENST00000492657 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
PRAME-213ENST00000492657 H3BRM9 83 aa9.75□□□□□ -0.85
PRAME-213ENST00000492657 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa9.75□□□□□ -0.85
PRAME-213ENST00000492657 NEGR1Q7Z3B1 354 aa9.75□□□□□ -0.85
PRAME-213ENST00000492657 TMEM8BA6NDV4 472 aa9.74□□□□□ -0.85
PRAME-213ENST00000492657 IGLV1-40P01703 118 aa9.74□□□□□ -0.85
PRAME-213ENST00000492657 AMTNQ6UX39 209 aa9.74□□□□□ -0.85
PRAME-213ENST00000492657 C9orf139Q6ZV77 190 aa9.74□□□□□ -0.85
PRAME-213ENST00000492657 SOCS3O14543 225 aa9.74□□□□□ -0.85
PRAME-213ENST00000492657 SH2D6Q7Z4S9 175 aa9.74□□□□□ -0.85
PRAME-213ENST00000492657 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa9.74□□□□□ -0.85
PRAME-213ENST00000492657 MAP1LC3AQ9H492 121 aa9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.8 ms