RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491075.1

CLIP2-208, Transcript of CAP-Gly domain containing linker protein 2, human

TSL 1 (best)

Gene CLIP2, Length 551 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLIP2-208	ENST00000491075	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
CLIP2-208	ENST00000491075	DIRC3	C9JPN6	131 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CLIP2-208	ENST00000491075	IL15RA	Q13261	267 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CLIP2-208	ENST00000491075	LELP1	Q5T871	98 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CLIP2-208	ENST00000491075	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CLIP2-208	ENST00000491075	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CLIP2-208	ENST00000491075	GNRH2	O43555	120 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CLIP2-208	ENST00000491075	WFDC2	Q14508	124 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CLIP2-208	ENST00000491075	RHOH	Q15669	191 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CLIP2-208	ENST00000491075	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CLIP2-208	ENST00000491075	ATP5S	Q99766	215 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CLIP2-208	ENST00000491075	LRP1	Q07954	4544 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
CLIP2-208	ENST00000491075	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CLIP2-208	ENST00000491075	TCRB	P04435	133 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CLIP2-208	ENST00000491075	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
CLIP2-208	ENST00000491075	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CLIP2-208	ENST00000491075	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CLIP2-208	ENST00000491075	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CLIP2-208	ENST00000491075	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CLIP2-208	ENST00000491075	LYRM1	O43325	122 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CLIP2-208	ENST00000491075	CIDEA	O60543	219 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CLIP2-208	ENST00000491075	TYMS	P04818	313 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CLIP2-208	ENST00000491075	NHLH2	Q02577	135 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CLIP2-208	ENST00000491075	NUDT15	Q9NV35	164 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CLIP2-208	ENST00000491075	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CLIP2-208	ENST00000491075	PLA2G10	O15496	165 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CLIP2-208	ENST00000491075	KCNS1	Q96KK3	526 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CLIP2-208	ENST00000491075	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
CLIP2-208	ENST00000491075	GTSF1L	Q9H1H1	148 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CLIP2-208	ENST00000491075	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CLIP2-208	ENST00000491075	SCX	Q7RTU7	201 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CLIP2-208	ENST00000491075	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
CLIP2-208	ENST00000491075	IGLV2-33	A0A075B6J2	118 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
CLIP2-208	ENST00000491075	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CLIP2-208	ENST00000491075	LECT2	O14960	151 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CLIP2-208	ENST00000491075	OXT	P01178	125 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CLIP2-208	ENST00000491075	ZNF876P	Q49A33	203 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CLIP2-208	ENST00000491075	KHDC3L	Q587J8	217 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CLIP2-208	ENST00000491075	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CLIP2-208	ENST00000491075	HYLS1	Q96M11	299 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CLIP2-208	ENST00000491075	FAT3	Q8TDW7	4589 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CLIP2-208	ENST00000491075	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CLIP2-208	ENST00000491075	CMTM2	Q8TAZ6	248 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CLIP2-208	ENST00000491075	ASB13	Q8WXK3	278 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CLIP2-208	ENST00000491075	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CLIP2-208	ENST00000491075	OTOR	Q9NRC9	128 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CLIP2-208	ENST00000491075		F6UZH7	168 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CLIP2-208	ENST00000491075	RS1	O15537	224 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CLIP2-208	ENST00000491075	TAS2R45	P59539	299 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CLIP2-208	ENST00000491075	ASAH1	Q13510	395 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CLIP2-208	ENST00000491075	TOR2A	Q5JU69	321 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CLIP2-208	ENST00000491075	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CLIP2-208	ENST00000491075	TREM1	Q9NP99	234 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CLIP2-208	ENST00000491075	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CLIP2-208	ENST00000491075	MGST1	P10620	155 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CLIP2-208	ENST00000491075	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CLIP2-208	ENST00000491075		Q8N3U1	123 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CLIP2-208	ENST00000491075	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CLIP2-208	ENST00000491075	COX11	Q9Y6N1	276 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CLIP2-208	ENST00000491075	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CLIP2-208	ENST00000491075	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CLIP2-208	ENST00000491075	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CLIP2-208	ENST00000491075	ARL6IP6	Q8N6S5	226 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CLIP2-208	ENST00000491075	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CLIP2-208	ENST00000491075	NMES1	Q9C002	83 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CLIP2-208	ENST00000491075	PGP	A6NDG6	321 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CLIP2-208	ENST00000491075	LINC01620	Q4KN68	170 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CLIP2-208	ENST00000491075	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CLIP2-208	ENST00000491075	TVP23C	Q96ET8	276 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CLIP2-208	ENST00000491075	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CLIP2-208	ENST00000491075	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
CLIP2-208	ENST00000491075	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
CLIP2-208	ENST00000491075	TRAV8-1	A0A0A6YYK1	113 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CLIP2-208	ENST00000491075	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CLIP2-208	ENST00000491075	GGTLC3	B5MD39	225 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CLIP2-208	ENST00000491075	BAALC	Q8WXS3	180 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CLIP2-208	ENST00000491075	OR5AC2	Q9NZP5	309 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CLIP2-208	ENST00000491075	MBD2	Q9UBB5	411 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CLIP2-208	ENST00000491075	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CLIP2-208	ENST00000491075		Q8N976	141 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CLIP2-208	ENST00000491075	PTH2	Q96A98	100 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CLIP2-208	ENST00000491075	RMI2	Q96E14	147 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CLIP2-208	ENST00000491075	C9orf85	Q96MD7	179 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CLIP2-208	ENST00000491075	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CLIP2-208	ENST00000491075	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CLIP2-208	ENST00000491075	LRRC37A5P	Q49AS3	106 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CLIP2-208	ENST00000491075	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CLIP2-208	ENST00000491075	PKHD1L1	Q86WI1	4243 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CLIP2-208	ENST00000491075		A0A087WWC5	75 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CLIP2-208	ENST00000491075	LINC00694	P0DN24	101 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CLIP2-208	ENST00000491075	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CLIP2-208	ENST00000491075	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CLIP2-208	ENST00000491075	TAAR5	O14804	337 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CLIP2-208	ENST00000491075	IGLV2-8	P01709	118 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CLIP2-208	ENST00000491075	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CLIP2-208	ENST00000491075	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CLIP2-208	ENST00000491075	SERTM2	A0A1B0GWG4	89 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CLIP2-208	ENST00000491075	RNF222	A6NCQ9	220 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CLIP2-208	ENST00000491075	GAGE12J	A6NER3	117 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CLIP2-208	ENST00000491075		H0YIZ8	118 aa		13.51	□□□□□ -0.25

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