RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489789.3

CNTNAP3B-209, Transcript of contactin associated protein like 3B, human

TSL 5

Gene CNTNAP3B, Length 501 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	NRN1	Q9NPD7	142 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789		A0A1B0GUT8	65 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	RBMY1B	A6NDE4	496 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	RBMY1E	A6NEQ0	496 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789		F2Z2F3	143 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	APCS	P02743	223 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	RBMY1D	P0C7P1	496 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	RAB4A	P20338	218 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	ZNF138	P52744	262 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	RAB4B	P61018	213 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	PAFAH1B2	P68402	229 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	S100A12	P80511	92 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789		Q0VG73	95 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	ZNF124	Q15973	351 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	LINC00479	Q96M42	142 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	SPATA25	Q9BR10	227 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	SMPX	Q9UHP9	88 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789		A0A1B0GXF2	115 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	TMEM189	A5PLL7	270 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	OR4C46	A6NHA9	309 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789		H3BTX0	84 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	ESD	P10768	282 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	TMEM136	Q6ZRR5	245 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	TCF24	Q7RTU0	167 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	LINC00518	Q8N0U6	118 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	HIST3H2BB	Q8N257	126 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	ZNF738	Q8NE65	137 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	NUP35	Q8NFH5	326 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	ODF3	Q96PU9	254 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	DNAH3	Q8TD57	4116 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	TRAV8-1	A0A0A6YYK1	113 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	TRAV25	A0A0B4J276	109 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789		A8MZ25	164 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789		M0R3E3	92 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	PMCH	P20382	165 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	TSPO	P30536	169 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	CTRL	P40313	264 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	TCL1A	P56279	114 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	SMIM15	Q7Z3B0	74 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	BAGE3	Q86Y29	109 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	GATD1	Q8NB37	220 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	MUC7	Q8TAX7	377 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	C17orf77	Q96MU5	243 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	C12orf57	Q99622	126 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	SPAG8	Q99932	426 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	LAMTOR2	Q9Y2Q5	125 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	RYR3	Q15413	4870 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	COL7A1	Q02388	2944 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	SH2D1A	O60880	128 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	PPBP	P02775	128 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	MED14OS	P0DP75	135 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	LEP	P41159	167 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	CACNG7	P62955	275 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	DEFB135	Q30KP9	77 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	KCNS1	Q96KK3	526 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	HIST1H2BL	Q99880	126 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	CNFN	Q9BYD5	112 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	AGRN	O00468	2067 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	C3orf84	H3BNL1	204 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	SOCS3	O14543	225 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	OR5AL1	P0C617	328 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	FABP4	P15090	132 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	APOC4	P55056	127 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	DEFB131A	P59861	70 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	CASC10	Q5T4H9	136 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	CHCHD1	Q96BP2	118 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	VGLL1	Q99990	258 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		4.52	□□□□□ -1.69

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