RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489100.5

FAM107B-223, Transcript of family with sequence similarity 107 member B, human

TSL 4

Gene FAM107B, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM107B-223	ENST00000489100	CMTM2	Q8TAZ6	248 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	TMED6	Q8WW62	240 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	PRO0255	Q9UI72	69 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	KLF12	Q9Y4X4	402 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	MYCBP2	O75592	4640 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	TRGV11	A0A075B6L2	103 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100		A0A1W2PPV4	95 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	DIRC3	C9JPN6	131 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100		Q6AWC8	147 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	ARL6IP6	Q8N6S5	226 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	C8orf49	Q96NF6	230 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100		Q9HAA7	133 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	BATF3	Q9NR55	127 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	OTOR	Q9NRC9	128 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	MRPL16	Q9NX20	251 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	PPT1	P50897	306 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	MUC21	Q5SSG8	566 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	FAM159A	Q6UWV7	190 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	TXNDC17	Q9BRA2	123 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	SPX	Q9BT56	116 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	SERTM2	A0A1B0GWG4	89 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	PTTG1	O95997	202 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	ORM1	P02763	201 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	CRYBA4	P53673	196 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	RAB2A	P61019	212 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	TMEM183B	Q1AE95	376 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	TDRG1	Q3Y452	100 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100		Q6ZQT7	251 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	TMEM183A	Q8IXX5	376 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100		Q8N814	137 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	OR10G4	Q8NGN3	311 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	OR10G9	Q8NGN4	311 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	HYLS1	Q96M11	299 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	WFDC1	Q9HC57	220 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	ALG5	Q9Y673	324 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	PGP	A6NDG6	321 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100		C9JCJ5	164 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	RS1	O15537	224 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	OXT	P01178	125 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	MB	P02144	154 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	GYPE	P15421	78 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	FHL2	Q14192	279 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	ASB13	Q8WXK3	278 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	RASL10A	Q92737	203 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	KCNS1	Q96KK3	526 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	AQP10	Q96PS8	301 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	TM2D2	Q9BX73	214 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	MED28	Q9H204	178 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	NAGK	Q9UJ70	344 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAM107B-223	ENST00000489100	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100		F6UZH7	168 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100		K7EQM0	130 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100		M0R2P5	195 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	4.83	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	C1QB	P02746	253 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	SFTA3	P0C7M3	94 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	STAG3L2	P0CL84	134 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	STAG3L3	P0CL85	134 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	SERF2	P84101	59 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	ZNF479	Q96JC4	524 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	TREM1	Q9NP99	234 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	TRAV8-1	A0A0A6YYK1	113 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100		K7EQD1	137 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	CXorf1	O96002	111 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	TCRA	P04437	139 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	TYMS	P04818	313 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	ATP6V0C	P27449	155 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	GCHFR	P30047	84 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	GNG5	P63218	68 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	ZFP69	Q49AA0	526 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64

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